Protein–RNA interactions for Protein: Q60841

Reln, Reelin, mousemouse

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Length 3,461 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RelnQ60841 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
RelnQ60841 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
RelnQ60841 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
RelnQ60841 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
RelnQ60841 Rufy2-203ENSMUST00000122231 2664 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
RelnQ60841 Morf4l2-202ENSMUST00000080411 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
RelnQ60841 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
RelnQ60841 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
RelnQ60841 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
RelnQ60841 Gm25766-201ENSMUST00000104101 131 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
RelnQ60841 Gm12684-201ENSMUST00000118675 999 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
RelnQ60841 Prss36-208ENSMUST00000156152 1132 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
RelnQ60841 Gm24398-201ENSMUST00000157870 109 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
RelnQ60841 Gm18776-201ENSMUST00000188833 654 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
RelnQ60841 Gm17796-201ENSMUST00000189015 1213 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
RelnQ60841 Gm19587-201ENSMUST00000191395 545 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
RelnQ60841 Gm5870-201ENSMUST00000196461 282 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
RelnQ60841 Gm35549-202ENSMUST00000203656 1009 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
RelnQ60841 Gm4811-201ENSMUST00000220879 1220 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
RelnQ60841 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
RelnQ60841 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
RelnQ60841 Gm43154-214ENSMUST00000211225 1420 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
RelnQ60841 Phkg2-201ENSMUST00000033086 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
RelnQ60841 Catsper3-201ENSMUST00000021961 1330 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
RelnQ60841 1520401A03Rik-205ENSMUST00000201734 2660 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
RelnQ60841 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
RelnQ60841 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
RelnQ60841 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
RelnQ60841 Gm24791-201ENSMUST00000104284 131 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
RelnQ60841 Gm14236-201ENSMUST00000142374 872 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
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RelnQ60841 Gm9116-201ENSMUST00000192400 1018 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
RelnQ60841 Gm17749-201ENSMUST00000216282 690 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
RelnQ60841 Gm7536-201ENSMUST00000077389 444 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
RelnQ60841 Gm5453-201ENSMUST00000080866 447 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
RelnQ60841 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
RelnQ60841 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
RelnQ60841 Zfp61-208ENSMUST00000165241 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
RelnQ60841 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
RelnQ60841 Gm15513-201ENSMUST00000140646 1569 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
RelnQ60841 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
RelnQ60841 Rhox3d-ps-201ENSMUST00000119181 825 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
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RelnQ60841 Gm11706-201ENSMUST00000151282 316 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
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RelnQ60841 Gm28686-201ENSMUST00000187404 609 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
RelnQ60841 Rhoc-205ENSMUST00000196817 877 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
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RelnQ60841 Tbc1d22bos-202ENSMUST00000163069 1349 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
RelnQ60841 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
RelnQ60841 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
RelnQ60841 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
RelnQ60841 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
RelnQ60841 Srsf5-205ENSMUST00000110356 1568 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
RelnQ60841 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
RelnQ60841 Palb2-204ENSMUST00000106469 2559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
RelnQ60841 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
RelnQ60841 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
RelnQ60841 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
RelnQ60841 Bpifb4-201ENSMUST00000099181 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
RelnQ60841 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
RelnQ60841 Gm11578-201ENSMUST00000118530 459 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
RelnQ60841 Ndufb5-204ENSMUST00000127477 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
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RelnQ60841 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
RelnQ60841 Ndel1-202ENSMUST00000101017 1646 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
RelnQ60841 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
RelnQ60841 Akap10-203ENSMUST00000108710 3394 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
RelnQ60841 6030458C11Rik-204ENSMUST00000228177 3156 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
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RelnQ60841 Opn1mw-202ENSMUST00000101457 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
RelnQ60841 Gm15906-201ENSMUST00000124746 323 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
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RelnQ60841 Gm3238-201ENSMUST00000168298 693 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
RelnQ60841 Nlrp5-ps-202ENSMUST00000173220 1294 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
RelnQ60841 A930005H10Rik-204ENSMUST00000185681 625 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
RelnQ60841 A930005H10Rik-206ENSMUST00000188260 739 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
RelnQ60841 CT573086.4-201ENSMUST00000226729 342 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
RelnQ60841 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
RelnQ60841 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
RelnQ60841 Lonp2-207ENSMUST00000163987 1556 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
RelnQ60841 Mmp19-203ENSMUST00000219404 2236 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
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