Protein–RNA interactions for Protein: Q60803

Traf3, TNF receptor-associated factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 567 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf3Q60803 Gm38341-201ENSMUST00000195357 515 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Traf3Q60803 Gm43822-201ENSMUST00000200285 476 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Traf3Q60803 Scoc-203ENSMUST00000212031 409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Traf3Q60803 Tpd52l1-203ENSMUST00000213639 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Traf3Q60803 Mirlet7c-2-201ENSMUST00000083674 95 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Traf3Q60803 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Traf3Q60803 Ripk3-201ENSMUST00000022830 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Traf3Q60803 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Traf3Q60803 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Traf3Q60803 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Traf3Q60803 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Traf3Q60803 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Traf3Q60803 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Traf3Q60803 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Traf3Q60803 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Traf3Q60803 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Traf3Q60803 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Traf3Q60803 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Traf3Q60803 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Traf3Q60803 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Traf3Q60803 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Traf3Q60803 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Traf3Q60803 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Traf3Q60803 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Traf3Q60803 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Traf3Q60803 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Traf3Q60803 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Traf3Q60803 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Traf3Q60803 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Traf3Q60803 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Traf3Q60803 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Traf3Q60803 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Traf3Q60803 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Traf3Q60803 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Traf3Q60803 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Traf3Q60803 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Traf3Q60803 Gm13124-201ENSMUST00000105748 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Traf3Q60803 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Traf3Q60803 Rbm3-ps-201ENSMUST00000121422 465 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Traf3Q60803 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Traf3Q60803 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Traf3Q60803 Gm28882-201ENSMUST00000185504 314 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Traf3Q60803 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Traf3Q60803 Gm3961-201ENSMUST00000204425 994 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Traf3Q60803 Lrrc52-201ENSMUST00000036643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Traf3Q60803 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Traf3Q60803 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Traf3Q60803 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Traf3Q60803 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Traf3Q60803 Gm44260-201ENSMUST00000204946 2094 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Traf3Q60803 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Traf3Q60803 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Traf3Q60803 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Traf3Q60803 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Traf3Q60803 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Traf3Q60803 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Traf3Q60803 1520401A03Rik-205ENSMUST00000201734 2660 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Traf3Q60803 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Traf3Q60803 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Traf3Q60803 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Traf3Q60803 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Traf3Q60803 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Traf3Q60803 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Traf3Q60803 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Traf3Q60803 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Traf3Q60803 Gm23270-201ENSMUST00000104055 131 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Traf3Q60803 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Traf3Q60803 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Traf3Q60803 Egfl7-209ENSMUST00000150404 892 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Traf3Q60803 Olfr668-201ENSMUST00000164391 957 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Traf3Q60803 Gm17344-201ENSMUST00000171173 1159 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Traf3Q60803 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Traf3Q60803 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Traf3Q60803 Gm33056-201ENSMUST00000213234 1120 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Traf3Q60803 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Traf3Q60803 AC122371.3-201ENSMUST00000223402 1061 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Traf3Q60803 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Traf3Q60803 Syngr4-201ENSMUST00000039049 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Traf3Q60803 Ccdc70-202ENSMUST00000070649 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Traf3Q60803 Olfr667-201ENSMUST00000071362 981 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Traf3Q60803 Olfr666-201ENSMUST00000081116 957 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Traf3Q60803 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Traf3Q60803 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Traf3Q60803 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Traf3Q60803 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Traf3Q60803 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Traf3Q60803 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Traf3Q60803 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Traf3Q60803 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Traf3Q60803 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Traf3Q60803 Mfsd4b5-205ENSMUST00000170579 1554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Traf3Q60803 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Traf3Q60803 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Traf3Q60803 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Traf3Q60803 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Traf3Q60803 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Traf3Q60803 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC13.02□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.5 ms