Protein–RNA interactions for Protein: Q60598

Cttn, Src substrate cortactin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 546 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CttnQ60598 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CttnQ60598 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CttnQ60598 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CttnQ60598 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CttnQ60598 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CttnQ60598 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CttnQ60598 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CttnQ60598 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CttnQ60598 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CttnQ60598 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CttnQ60598 Pitpnm3-201ENSMUST00000075258 6555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CttnQ60598 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CttnQ60598 Gm12058-201ENSMUST00000118614 437 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
CttnQ60598 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CttnQ60598 Gm26973-201ENSMUST00000182105 696 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CttnQ60598 Gm28379-201ENSMUST00000186450 554 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CttnQ60598 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CttnQ60598 Gm39404-201ENSMUST00000216350 313 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
CttnQ60598 Gm9004-201ENSMUST00000218739 1222 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
CttnQ60598 AC113031.8-201ENSMUST00000227856 631 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
CttnQ60598 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
CttnQ60598 Ctrc-201ENSMUST00000037059 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CttnQ60598 Txn2-201ENSMUST00000005487 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CttnQ60598 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CttnQ60598 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CttnQ60598 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CttnQ60598 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CttnQ60598 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CttnQ60598 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CttnQ60598 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CttnQ60598 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CttnQ60598 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CttnQ60598 Uggt2-212ENSMUST00000156203 6456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CttnQ60598 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CttnQ60598 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CttnQ60598 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CttnQ60598 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CttnQ60598 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CttnQ60598 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CttnQ60598 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CttnQ60598 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CttnQ60598 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CttnQ60598 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CttnQ60598 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CttnQ60598 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CttnQ60598 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CttnQ60598 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CttnQ60598 Gm22323-201ENSMUST00000103832 109 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
CttnQ60598 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CttnQ60598 Pdlim2-205ENSMUST00000129174 729 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CttnQ60598 Gas5-210ENSMUST00000159706 557 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CttnQ60598 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CttnQ60598 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CttnQ60598 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
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CttnQ60598 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CttnQ60598 Tmem205-203ENSMUST00000213698 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CttnQ60598 AC125209.1-201ENSMUST00000225812 766 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
CttnQ60598 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
CttnQ60598 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CttnQ60598 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CttnQ60598 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
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CttnQ60598 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CttnQ60598 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CttnQ60598 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CttnQ60598 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
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CttnQ60598 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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CttnQ60598 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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CttnQ60598 Tubb2a-ps2-201ENSMUST00000221547 1339 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
CttnQ60598 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CttnQ60598 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CttnQ60598 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CttnQ60598 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CttnQ60598 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CttnQ60598 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CttnQ60598 Etfrf1-207ENSMUST00000111726 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CttnQ60598 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CttnQ60598 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CttnQ60598 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CttnQ60598 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CttnQ60598 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CttnQ60598 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CttnQ60598 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CttnQ60598 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CttnQ60598 Ifna7-201ENSMUST00000105143 573 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CttnQ60598 Smyd3-202ENSMUST00000111134 1229 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CttnQ60598 Gm11222-201ENSMUST00000119005 738 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
CttnQ60598 Gm14999-201ENSMUST00000121039 624 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
CttnQ60598 Igf1-206ENSMUST00000122100 651 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CttnQ60598 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
CttnQ60598 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CttnQ60598 Gm21769-201ENSMUST00000211922 111 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
CttnQ60598 Gm6082-201ENSMUST00000215204 454 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
CttnQ60598 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms