Protein–RNA interactions for Protein: Q60520

Sin3a, Paired amphipathic helix protein Sin3a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sin3aQ60520 Gm30285-201ENSMUST00000214614 422 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Sin3aQ60520 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sin3aQ60520 Zdhhc12-201ENSMUST00000081838 1187 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sin3aQ60520 Gm37472-201ENSMUST00000192342 4052 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Sin3aQ60520 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sin3aQ60520 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sin3aQ60520 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sin3aQ60520 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sin3aQ60520 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sin3aQ60520 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sin3aQ60520 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sin3aQ60520 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sin3aQ60520 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sin3aQ60520 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sin3aQ60520 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sin3aQ60520 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sin3aQ60520 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sin3aQ60520 Gm23270-201ENSMUST00000104055 131 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Sin3aQ60520 Gm12241-201ENSMUST00000118330 726 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Sin3aQ60520 Gm14723-201ENSMUST00000118686 215 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Sin3aQ60520 Gm13563-201ENSMUST00000125518 643 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sin3aQ60520 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sin3aQ60520 Olfr668-201ENSMUST00000164391 957 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sin3aQ60520 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sin3aQ60520 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sin3aQ60520 Gm43758-201ENSMUST00000199500 367 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Sin3aQ60520 Gm8712-201ENSMUST00000221090 701 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Sin3aQ60520 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sin3aQ60520 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sin3aQ60520 Pex11b-201ENSMUST00000048766 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sin3aQ60520 Olfr667-201ENSMUST00000071362 981 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sin3aQ60520 Olfr666-201ENSMUST00000081116 957 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sin3aQ60520 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sin3aQ60520 Atg4c-203ENSMUST00000180278 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sin3aQ60520 Fyb2-201ENSMUST00000106803 3136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sin3aQ60520 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Sin3aQ60520 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sin3aQ60520 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sin3aQ60520 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sin3aQ60520 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sin3aQ60520 Exosc1-202ENSMUST00000112123 1499 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sin3aQ60520 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sin3aQ60520 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sin3aQ60520 Pcp4l1-201ENSMUST00000111332 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sin3aQ60520 2410002F23Rik-205ENSMUST00000107949 3610 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sin3aQ60520 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sin3aQ60520 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sin3aQ60520 Il21r-202ENSMUST00000206103 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sin3aQ60520 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sin3aQ60520 AC160405.1-201ENSMUST00000218207 1545 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Sin3aQ60520 Anxa8-201ENSMUST00000022519 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sin3aQ60520 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sin3aQ60520 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sin3aQ60520 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sin3aQ60520 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Sin3aQ60520 Igf1-206ENSMUST00000122100 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sin3aQ60520 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sin3aQ60520 Gm17028-201ENSMUST00000170026 704 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sin3aQ60520 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sin3aQ60520 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sin3aQ60520 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Sin3aQ60520 Syngr4-201ENSMUST00000039049 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sin3aQ60520 Asb8-201ENSMUST00000059112 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sin3aQ60520 Acyp1-202ENSMUST00000065913 448 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sin3aQ60520 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sin3aQ60520 Rasgrp4-214ENSMUST00000205027 2717 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sin3aQ60520 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sin3aQ60520 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sin3aQ60520 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sin3aQ60520 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sin3aQ60520 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sin3aQ60520 Prc1-211ENSMUST00000174199 2128 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sin3aQ60520 Gm5053-201ENSMUST00000208361 1678 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Sin3aQ60520 Pik3cd-203ENSMUST00000105689 3132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sin3aQ60520 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sin3aQ60520 Celf2-225ENSMUST00000183091 2177 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sin3aQ60520 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sin3aQ60520 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sin3aQ60520 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sin3aQ60520 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sin3aQ60520 Ivns1abp-202ENSMUST00000097543 3337 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sin3aQ60520 Asph-207ENSMUST00000108333 2652 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sin3aQ60520 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sin3aQ60520 Cox16-204ENSMUST00000166723 579 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sin3aQ60520 Gm17586-201ENSMUST00000181502 908 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sin3aQ60520 Gm5565-201ENSMUST00000199463 1162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sin3aQ60520 AC098716.1-201ENSMUST00000213527 703 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Sin3aQ60520 Tpd52l1-203ENSMUST00000213639 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sin3aQ60520 Olfr1428-201ENSMUST00000087824 945 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sin3aQ60520 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sin3aQ60520 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sin3aQ60520 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sin3aQ60520 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sin3aQ60520 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sin3aQ60520 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sin3aQ60520 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sin3aQ60520 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sin3aQ60520 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sin3aQ60520 Acsm4-201ENSMUST00000047045 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sin3aQ60520 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.7 ms