Protein–RNA interactions for Protein: Q5SUD9

Bbs12, Bardet-Biedl syndrome 12 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bbs12Q5SUD9 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Bbs12Q5SUD9 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Bbs12Q5SUD9 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Bbs12Q5SUD9 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Bbs12Q5SUD9 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Bbs12Q5SUD9 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Bbs12Q5SUD9 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Bbs12Q5SUD9 Cerk-203ENSMUST00000156546 2162 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Bbs12Q5SUD9 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Bbs12Q5SUD9 Dennd4c-202ENSMUST00000082026 7940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Bbs12Q5SUD9 Pcnx-201ENSMUST00000021567 12139 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Bbs12Q5SUD9 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Bbs12Q5SUD9 Tfcp2-201ENSMUST00000009877 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Bbs12Q5SUD9 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Bbs12Q5SUD9 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Bbs12Q5SUD9 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Bbs12Q5SUD9 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Bbs12Q5SUD9 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Bbs12Q5SUD9 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Bbs12Q5SUD9 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Bbs12Q5SUD9 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Bbs12Q5SUD9 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Bbs12Q5SUD9 Gm10434-201ENSMUST00000101158 471 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Bbs12Q5SUD9 Gm12241-201ENSMUST00000118330 726 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Bbs12Q5SUD9 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Bbs12Q5SUD9 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Bbs12Q5SUD9 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Bbs12Q5SUD9 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Bbs12Q5SUD9 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Bbs12Q5SUD9 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Bbs12Q5SUD9 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Bbs12Q5SUD9 Gm38114-201ENSMUST00000191877 1232 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Bbs12Q5SUD9 Gm37489-201ENSMUST00000191883 159 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Bbs12Q5SUD9 Gm38158-201ENSMUST00000194617 339 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Bbs12Q5SUD9 Gm10608-202ENSMUST00000213924 676 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Bbs12Q5SUD9 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Bbs12Q5SUD9 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Bbs12Q5SUD9 Olfr569-201ENSMUST00000078191 945 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Bbs12Q5SUD9 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Bbs12Q5SUD9 Gm5773-201ENSMUST00000090853 1143 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Bbs12Q5SUD9 Olfr582-201ENSMUST00000098212 960 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Bbs12Q5SUD9 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Bbs12Q5SUD9 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Bbs12Q5SUD9 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Bbs12Q5SUD9 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Bbs12Q5SUD9 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Bbs12Q5SUD9 Pygo2-202ENSMUST00000107413 2911 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Bbs12Q5SUD9 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Bbs12Q5SUD9 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Bbs12Q5SUD9 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Bbs12Q5SUD9 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Bbs12Q5SUD9 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Bbs12Q5SUD9 Kif1a-210ENSMUST00000190723 6141 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Bbs12Q5SUD9 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Bbs12Q5SUD9 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Bbs12Q5SUD9 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Bbs12Q5SUD9 Ubxn10-201ENSMUST00000105809 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Bbs12Q5SUD9 Ercc2-202ENSMUST00000108460 3485 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Bbs12Q5SUD9 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Bbs12Q5SUD9 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Bbs12Q5SUD9 4930563D23Rik-201ENSMUST00000062638 2646 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Bbs12Q5SUD9 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Bbs12Q5SUD9 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Bbs12Q5SUD9 C230014O12Rik-201ENSMUST00000134921 2668 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Bbs12Q5SUD9 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Bbs12Q5SUD9 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Bbs12Q5SUD9 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Bbs12Q5SUD9 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Bbs12Q5SUD9 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Bbs12Q5SUD9 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Bbs12Q5SUD9 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Bbs12Q5SUD9 H2afz-206ENSMUST00000173790 437 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Bbs12Q5SUD9 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Bbs12Q5SUD9 Gm27516-201ENSMUST00000184237 98 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Bbs12Q5SUD9 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Bbs12Q5SUD9 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Bbs12Q5SUD9 Gm9368-201ENSMUST00000219348 831 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Bbs12Q5SUD9 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Bbs12Q5SUD9 Asb8-201ENSMUST00000059112 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Bbs12Q5SUD9 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Bbs12Q5SUD9 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Bbs12Q5SUD9 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Bbs12Q5SUD9 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Bbs12Q5SUD9 Emilin1-201ENSMUST00000031055 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Bbs12Q5SUD9 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Bbs12Q5SUD9 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Bbs12Q5SUD9 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Bbs12Q5SUD9 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Bbs12Q5SUD9 Ddah1-201ENSMUST00000029845 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Bbs12Q5SUD9 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Bbs12Q5SUD9 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Bbs12Q5SUD9 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Bbs12Q5SUD9 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Bbs12Q5SUD9 Zbtb44-201ENSMUST00000115222 8861 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Bbs12Q5SUD9 Wbp1l-201ENSMUST00000099376 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Bbs12Q5SUD9 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Bbs12Q5SUD9 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Bbs12Q5SUD9 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Bbs12Q5SUD9 Rbm4b-201ENSMUST00000036744 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Bbs12Q5SUD9 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms