Protein–RNA interactions for Protein: Q5SFM8

Rbm27, RNA-binding protein 27, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,060 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbm27Q5SFM8 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rbm27Q5SFM8 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rbm27Q5SFM8 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rbm27Q5SFM8 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rbm27Q5SFM8 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rbm27Q5SFM8 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rbm27Q5SFM8 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rbm27Q5SFM8 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rbm27Q5SFM8 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rbm27Q5SFM8 Gm14760-201ENSMUST00000121831 999 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Rbm27Q5SFM8 Igf1-206ENSMUST00000122100 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rbm27Q5SFM8 Gm6309-201ENSMUST00000174320 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rbm27Q5SFM8 Anapc16-202ENSMUST00000182116 581 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rbm27Q5SFM8 Gm28882-201ENSMUST00000185504 314 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Rbm27Q5SFM8 2610016A17Rik-202ENSMUST00000186768 689 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Rbm27Q5SFM8 Pcbd1-201ENSMUST00000020298 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rbm27Q5SFM8 Gm18615-201ENSMUST00000222919 1031 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Rbm27Q5SFM8 Lsm7-201ENSMUST00000035775 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rbm27Q5SFM8 Gm16519-201ENSMUST00000092011 489 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rbm27Q5SFM8 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rbm27Q5SFM8 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rbm27Q5SFM8 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rbm27Q5SFM8 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rbm27Q5SFM8 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rbm27Q5SFM8 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rbm27Q5SFM8 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rbm27Q5SFM8 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rbm27Q5SFM8 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rbm27Q5SFM8 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rbm27Q5SFM8 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rbm27Q5SFM8 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rbm27Q5SFM8 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rbm27Q5SFM8 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rbm27Q5SFM8 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rbm27Q5SFM8 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rbm27Q5SFM8 Etfrf1-207ENSMUST00000111726 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rbm27Q5SFM8 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rbm27Q5SFM8 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rbm27Q5SFM8 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rbm27Q5SFM8 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rbm27Q5SFM8 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rbm27Q5SFM8 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rbm27Q5SFM8 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rbm27Q5SFM8 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rbm27Q5SFM8 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rbm27Q5SFM8 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rbm27Q5SFM8 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rbm27Q5SFM8 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rbm27Q5SFM8 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Rbm27Q5SFM8 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rbm27Q5SFM8 Gm14109-201ENSMUST00000118814 309 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Rbm27Q5SFM8 Gm15782-201ENSMUST00000121073 445 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Rbm27Q5SFM8 Gm14832-201ENSMUST00000121289 322 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Rbm27Q5SFM8 Pdlim2-205ENSMUST00000129174 729 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rbm27Q5SFM8 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rbm27Q5SFM8 Gm11772-201ENSMUST00000136542 532 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rbm27Q5SFM8 Gm17376-201ENSMUST00000166016 84 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Rbm27Q5SFM8 Gm17586-201ENSMUST00000181502 908 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rbm27Q5SFM8 Gm29585-203ENSMUST00000188089 835 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rbm27Q5SFM8 Gm8885-201ENSMUST00000189382 598 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Rbm27Q5SFM8 Rpl7a-ps10-201ENSMUST00000190579 798 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Rbm27Q5SFM8 Ighv1-62-201ENSMUST00000193406 350 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Rbm27Q5SFM8 Gm42797-201ENSMUST00000197573 494 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rbm27Q5SFM8 Gm45881-201ENSMUST00000210659 517 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rbm27Q5SFM8 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rbm27Q5SFM8 Gm8712-201ENSMUST00000221090 701 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Rbm27Q5SFM8 AC154222.2-201ENSMUST00000225848 607 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Rbm27Q5SFM8 H2-M10.2-201ENSMUST00000023845 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rbm27Q5SFM8 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rbm27Q5SFM8 Rpl7a-ps3-201ENSMUST00000090170 796 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Rbm27Q5SFM8 Rpl7a-ps5-201ENSMUST00000095218 807 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rbm27Q5SFM8 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rbm27Q5SFM8 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rbm27Q5SFM8 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rbm27Q5SFM8 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rbm27Q5SFM8 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rbm27Q5SFM8 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rbm27Q5SFM8 Sgk1-204ENSMUST00000120509 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rbm27Q5SFM8 4930528D03Rik-203ENSMUST00000225577 1348 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Rbm27Q5SFM8 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rbm27Q5SFM8 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rbm27Q5SFM8 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rbm27Q5SFM8 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rbm27Q5SFM8 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rbm27Q5SFM8 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rbm27Q5SFM8 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rbm27Q5SFM8 Klk2-ps-202ENSMUST00000206865 2684 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rbm27Q5SFM8 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rbm27Q5SFM8 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rbm27Q5SFM8 Arid5a-203ENSMUST00000115031 3002 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rbm27Q5SFM8 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rbm27Q5SFM8 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rbm27Q5SFM8 Fthl17d-201ENSMUST00000105004 856 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rbm27Q5SFM8 C330007P06Rik-203ENSMUST00000115249 1145 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rbm27Q5SFM8 Gm14809-201ENSMUST00000152025 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rbm27Q5SFM8 Gnpda2-207ENSMUST00000173927 1011 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rbm27Q5SFM8 Gm27046-201ENSMUST00000182160 463 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Rbm27Q5SFM8 Tpd52l1-203ENSMUST00000213639 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rbm27Q5SFM8 Gm6082-201ENSMUST00000215204 454 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Rbm27Q5SFM8 Gm24136-201ENSMUST00000083374 165 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43 ms