Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCF2

Trappc1, Trafficking protein particle complex subunit 1, mousemouse

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Length 145 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc1Q5NCF2 Esr2-202ENSMUST00000101291 3362 ntTSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
Trappc1Q5NCF2 Camk2a-203ENSMUST00000102888 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
Trappc1Q5NCF2 Wdr43-201ENSMUST00000047086 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
Trappc1Q5NCF2 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
Trappc1Q5NCF2 Gmps-201ENSMUST00000029405 8105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
Trappc1Q5NCF2 Myo5a-201ENSMUST00000123128 11702 ntTSL 5 BASIC8.95□□□□□ -0.98
Trappc1Q5NCF2 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
Trappc1Q5NCF2 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC8.95□□□□□ -0.98
Trappc1Q5NCF2 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
Trappc1Q5NCF2 Birc3-201ENSMUST00000013949 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
Trappc1Q5NCF2 Hbs1l-209ENSMUST00000219915 2733 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
Trappc1Q5NCF2 Pck2-201ENSMUST00000048781 3400 ntTSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
Trappc1Q5NCF2 Spata33-207ENSMUST00000212760 4074 ntBASIC8.95□□□□□ -0.98
Trappc1Q5NCF2 Tube1-201ENSMUST00000019991 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
Trappc1Q5NCF2 Acvrl1-201ENSMUST00000000542 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
Trappc1Q5NCF2 A1cf-202ENSMUST00000224304 2968 ntAPPRIS ALT1 BASIC8.94□□□□□ -0.98
Trappc1Q5NCF2 Spats2l-211ENSMUST00000169772 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
Trappc1Q5NCF2 Atg14-202ENSMUST00000226299 3729 ntAPPRIS P1 BASIC8.94□□□□□ -0.98
Trappc1Q5NCF2 Angptl4-201ENSMUST00000002360 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
Trappc1Q5NCF2 Bdkrb2-201ENSMUST00000001652 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
Trappc1Q5NCF2 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC8.94□□□□□ -0.98
Trappc1Q5NCF2 Acin1-203ENSMUST00000111484 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.94□□□□□ -0.98
Trappc1Q5NCF2 Ttll10-206ENSMUST00000184348 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.94□□□□□ -0.98
Trappc1Q5NCF2 Nfic-201ENSMUST00000020461 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
Trappc1Q5NCF2 Pard3-213ENSMUST00000160766 4949 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.94□□□□□ -0.98
Trappc1Q5NCF2 Rps6ka6-203ENSMUST00000096348 4151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.94□□□□□ -0.98
Trappc1Q5NCF2 Gm3294-201ENSMUST00000164104 7367 ntTSL 3 BASIC8.94□□□□□ -0.98
Trappc1Q5NCF2 Lpar1-203ENSMUST00000107571 3543 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.94□□□□□ -0.98
Trappc1Q5NCF2 Son-204ENSMUST00000119368 7529 ntTSL 5 BASIC8.94□□□□□ -0.98
Trappc1Q5NCF2 Aar2-202ENSMUST00000109570 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
Trappc1Q5NCF2 Camk2g-203ENSMUST00000100837 3564 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
Trappc1Q5NCF2 Prss57-203ENSMUST00000169684 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
Trappc1Q5NCF2 Gripap1-202ENSMUST00000101694 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.94□□□□□ -0.98
Trappc1Q5NCF2 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
Trappc1Q5NCF2 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
Trappc1Q5NCF2 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.94□□□□□ -0.98
Trappc1Q5NCF2 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
Trappc1Q5NCF2 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC8.94□□□□□ -0.98
Trappc1Q5NCF2 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC8.94□□□□□ -0.98
Trappc1Q5NCF2 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC8.94□□□□□ -0.98
Trappc1Q5NCF2 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC8.94□□□□□ -0.98
Trappc1Q5NCF2 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC8.94□□□□□ -0.98
Trappc1Q5NCF2 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
Trappc1Q5NCF2 Orc5-201ENSMUST00000030872 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
Trappc1Q5NCF2 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
Trappc1Q5NCF2 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
Trappc1Q5NCF2 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
Trappc1Q5NCF2 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
Trappc1Q5NCF2 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
Trappc1Q5NCF2 Trim25-201ENSMUST00000000284 5566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
Trappc1Q5NCF2 Fam126a-203ENSMUST00000115109 2195 ntTSL 5 BASIC8.94□□□□□ -0.98
Trappc1Q5NCF2 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
Trappc1Q5NCF2 Asb8-204ENSMUST00000143400 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
Trappc1Q5NCF2 CT010480.4-201ENSMUST00000224654 2283 ntBASIC8.94□□□□□ -0.98
Trappc1Q5NCF2 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
Trappc1Q5NCF2 Pcdh18-201ENSMUST00000035931 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
Trappc1Q5NCF2 Bcl9-201ENSMUST00000046521 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
Trappc1Q5NCF2 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC8.94□□□□□ -0.98
Trappc1Q5NCF2 Maob-201ENSMUST00000040820 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
Trappc1Q5NCF2 Ttc17-203ENSMUST00000111237 4409 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.94□□□□□ -0.98
Trappc1Q5NCF2 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
Trappc1Q5NCF2 Sipa1l2-202ENSMUST00000212168 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
Trappc1Q5NCF2 Clec14a-201ENSMUST00000062254 4571 ntAPPRIS P1 BASIC8.94□□□□□ -0.98
Trappc1Q5NCF2 Klhl18-205ENSMUST00000198400 4638 ntTSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
Trappc1Q5NCF2 Tiam2-202ENSMUST00000169838 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
Trappc1Q5NCF2 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
Trappc1Q5NCF2 Exosc10-202ENSMUST00000076022 2682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
Trappc1Q5NCF2 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC8.94□□□□□ -0.98
Trappc1Q5NCF2 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
Trappc1Q5NCF2 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
Trappc1Q5NCF2 Fsd2-201ENSMUST00000042318 3985 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.94□□□□□ -0.98
Trappc1Q5NCF2 Ifi47-202ENSMUST00000109202 1773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.94□□□□□ -0.98
Trappc1Q5NCF2 Bpi-202ENSMUST00000109499 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
Trappc1Q5NCF2 Tesk2-201ENSMUST00000045542 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
Trappc1Q5NCF2 Arc-202ENSMUST00000110009 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
Trappc1Q5NCF2 Arc-201ENSMUST00000023268 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
Trappc1Q5NCF2 Pik3cd-202ENSMUST00000105688 4335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
Trappc1Q5NCF2 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
Trappc1Q5NCF2 Tcn2-201ENSMUST00000020710 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.94□□□□□ -0.98
Trappc1Q5NCF2 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
Trappc1Q5NCF2 Vmn1r45-206ENSMUST00000227977 3297 ntAPPRIS P1 BASIC8.93□□□□□ -0.98
Trappc1Q5NCF2 Pias2-203ENSMUST00000168882 4984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
Trappc1Q5NCF2 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
Trappc1Q5NCF2 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
Trappc1Q5NCF2 Slc22a14-201ENSMUST00000093775 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
Trappc1Q5NCF2 Bace2-201ENSMUST00000047275 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
Trappc1Q5NCF2 Elavl2-201ENSMUST00000008633 3730 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
Trappc1Q5NCF2 Igf1-201ENSMUST00000062862 2292 ntTSL 2 BASIC8.93□□□□□ -0.98
Trappc1Q5NCF2 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
Trappc1Q5NCF2 Msh3-201ENSMUST00000022220 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
Trappc1Q5NCF2 Carns1-201ENSMUST00000167055 3968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.93□□□□□ -0.98
Trappc1Q5NCF2 Nr2c1-202ENSMUST00000099343 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
Trappc1Q5NCF2 Dctn1-203ENSMUST00000113913 4163 ntTSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
Trappc1Q5NCF2 Ralgps1-205ENSMUST00000131298 6035 ntTSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
Trappc1Q5NCF2 Sema4g-201ENSMUST00000026225 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
Trappc1Q5NCF2 Nlgn1-205ENSMUST00000193603 11807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
Trappc1Q5NCF2 Gm5878-201ENSMUST00000113802 4643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
Trappc1Q5NCF2 Pla2g4c-201ENSMUST00000043612 3382 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
Trappc1Q5NCF2 Abi1-209ENSMUST00000140164 3403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
Trappc1Q5NCF2 Slc25a44-202ENSMUST00000168755 3418 ntTSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
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