Protein–RNA interactions for Protein: Q5FWD4

Gm20816, Predicted gene, 20816, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20816Q5FWD4 Scamp5-201ENSMUST00000046587 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm20816Q5FWD4 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm20816Q5FWD4 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm20816Q5FWD4 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm20816Q5FWD4 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm20816Q5FWD4 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm20816Q5FWD4 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm20816Q5FWD4 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm20816Q5FWD4 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm20816Q5FWD4 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm20816Q5FWD4 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm20816Q5FWD4 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm20816Q5FWD4 Lrfn5-201ENSMUST00000055815 4410 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm20816Q5FWD4 Hdac5-204ENSMUST00000107152 3788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm20816Q5FWD4 Misp-202ENSMUST00000169041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm20816Q5FWD4 Ildr1-201ENSMUST00000023617 3042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm20816Q5FWD4 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm20816Q5FWD4 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm20816Q5FWD4 Kifap3-202ENSMUST00000077642 4012 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm20816Q5FWD4 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm20816Q5FWD4 Stim1-202ENSMUST00000209255 4362 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm20816Q5FWD4 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm20816Q5FWD4 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm20816Q5FWD4 Jup-201ENSMUST00000001592 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm20816Q5FWD4 Evi5l-208ENSMUST00000176825 3728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm20816Q5FWD4 Ccdc151-202ENSMUST00000115336 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm20816Q5FWD4 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm20816Q5FWD4 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm20816Q5FWD4 Tcf4-254ENSMUST00000202674 2615 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm20816Q5FWD4 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm20816Q5FWD4 Accs-201ENSMUST00000041593 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm20816Q5FWD4 Cacna1c-212ENSMUST00000187940 7507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm20816Q5FWD4 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm20816Q5FWD4 Tdrd9-201ENSMUST00000079009 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm20816Q5FWD4 Strc-201ENSMUST00000038389 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm20816Q5FWD4 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm20816Q5FWD4 Amotl2-211ENSMUST00000153965 4222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm20816Q5FWD4 Clec10a-209ENSMUST00000178945 2332 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm20816Q5FWD4 Fbn2-201ENSMUST00000025497 10480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm20816Q5FWD4 Epb41l2-204ENSMUST00000217929 3621 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm20816Q5FWD4 Ecd-201ENSMUST00000022344 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm20816Q5FWD4 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm20816Q5FWD4 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm20816Q5FWD4 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm20816Q5FWD4 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm20816Q5FWD4 Hnrnpa2b1-203ENSMUST00000114459 1728 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm20816Q5FWD4 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm20816Q5FWD4 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm20816Q5FWD4 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm20816Q5FWD4 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm20816Q5FWD4 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm20816Q5FWD4 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm20816Q5FWD4 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm20816Q5FWD4 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm20816Q5FWD4 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm20816Q5FWD4 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm20816Q5FWD4 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm20816Q5FWD4 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm20816Q5FWD4 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm20816Q5FWD4 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm20816Q5FWD4 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm20816Q5FWD4 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm20816Q5FWD4 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm20816Q5FWD4 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm20816Q5FWD4 Xpnpep1-209ENSMUST00000183108 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm20816Q5FWD4 Slc6a16-201ENSMUST00000179310 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm20816Q5FWD4 Tex9-209ENSMUST00000184125 2794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm20816Q5FWD4 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm20816Q5FWD4 Tacc2-201ENSMUST00000033141 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm20816Q5FWD4 Akap10-202ENSMUST00000102650 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm20816Q5FWD4 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm20816Q5FWD4 Wdr45-203ENSMUST00000115688 1510 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm20816Q5FWD4 Lrrc18-204ENSMUST00000120951 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm20816Q5FWD4 Frmd8-201ENSMUST00000025728 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm20816Q5FWD4 Lrp8-203ENSMUST00000106732 2648 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm20816Q5FWD4 Chrdl1-204ENSMUST00000166406 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm20816Q5FWD4 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm20816Q5FWD4 Sfxn3-201ENSMUST00000062213 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm20816Q5FWD4 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm20816Q5FWD4 Lingo4-201ENSMUST00000050975 3645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm20816Q5FWD4 Sorcs1-203ENSMUST00000164039 7241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm20816Q5FWD4 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm20816Q5FWD4 Kansl3-201ENSMUST00000010597 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm20816Q5FWD4 Pcsk7-209ENSMUST00000216672 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm20816Q5FWD4 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm20816Q5FWD4 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm20816Q5FWD4 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm20816Q5FWD4 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm20816Q5FWD4 Gm44260-201ENSMUST00000204946 2094 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm20816Q5FWD4 Gm2916-202ENSMUST00000181779 1702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm20816Q5FWD4 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm20816Q5FWD4 Nom1-201ENSMUST00000001611 9219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm20816Q5FWD4 Cald1-205ENSMUST00000115027 4777 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm20816Q5FWD4 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm20816Q5FWD4 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm20816Q5FWD4 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm20816Q5FWD4 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm20816Q5FWD4 Umod-201ENSMUST00000033263 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm20816Q5FWD4 Dis3l-208ENSMUST00000168844 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm20816Q5FWD4 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms