Protein–RNA interactions for Protein: Q4ACU6

Shank3, SH3 and multiple ankyrin repeat domains protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,730 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shank3Q4ACU6 Gm2553-201ENSMUST00000215986 605 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Shank3Q4ACU6 Gm25201-201ENSMUST00000083093 170 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Shank3Q4ACU6 Gm23680-201ENSMUST00000083162 164 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Shank3Q4ACU6 Naa10-202ENSMUST00000096316 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Shank3Q4ACU6 Slc10a3-204ENSMUST00000114147 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Shank3Q4ACU6 Pla2g16-202ENSMUST00000136465 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Shank3Q4ACU6 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Shank3Q4ACU6 Psmc3-201ENSMUST00000002171 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Shank3Q4ACU6 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Shank3Q4ACU6 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Shank3Q4ACU6 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Shank3Q4ACU6 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Shank3Q4ACU6 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Shank3Q4ACU6 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Shank3Q4ACU6 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Shank3Q4ACU6 Lrrc18-204ENSMUST00000120951 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Shank3Q4ACU6 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Shank3Q4ACU6 Rffl-205ENSMUST00000103218 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Shank3Q4ACU6 Gm13549-201ENSMUST00000118339 796 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Shank3Q4ACU6 Cntrobos-201ENSMUST00000132834 383 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Shank3Q4ACU6 Lyzl4os-202ENSMUST00000156364 726 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Shank3Q4ACU6 Gm24398-201ENSMUST00000157870 109 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Shank3Q4ACU6 Gm19015-201ENSMUST00000184002 1189 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Shank3Q4ACU6 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Shank3Q4ACU6 Gm7504-201ENSMUST00000201449 424 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Shank3Q4ACU6 Gm35549-202ENSMUST00000203656 1009 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Shank3Q4ACU6 Gng8-202ENSMUST00000205459 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Shank3Q4ACU6 Gm45592-201ENSMUST00000209605 1043 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Shank3Q4ACU6 Gm13539-202ENSMUST00000211245 552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Shank3Q4ACU6 Pbld1-204ENSMUST00000219045 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Shank3Q4ACU6 Lgi3-203ENSMUST00000226548 1001 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Shank3Q4ACU6 Gm4604-201ENSMUST00000025040 390 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Shank3Q4ACU6 Gm23105-201ENSMUST00000083719 134 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Shank3Q4ACU6 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Shank3Q4ACU6 Gm8899-201ENSMUST00000214635 1332 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Shank3Q4ACU6 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Shank3Q4ACU6 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Shank3Q4ACU6 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Shank3Q4ACU6 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Shank3Q4ACU6 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Shank3Q4ACU6 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Shank3Q4ACU6 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Shank3Q4ACU6 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Shank3Q4ACU6 Gm21972-201ENSMUST00000135197 776 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Shank3Q4ACU6 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Shank3Q4ACU6 Gm17192-201ENSMUST00000169031 511 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Shank3Q4ACU6 Taar8c-201ENSMUST00000170267 1035 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Shank3Q4ACU6 Gm9508-201ENSMUST00000220084 693 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Shank3Q4ACU6 AC129308.3-201ENSMUST00000225652 524 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Shank3Q4ACU6 Taar8a-201ENSMUST00000051133 1035 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Shank3Q4ACU6 Gm4900-201ENSMUST00000222046 1628 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Shank3Q4ACU6 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Shank3Q4ACU6 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Shank3Q4ACU6 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Shank3Q4ACU6 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Shank3Q4ACU6 Morf4l2-202ENSMUST00000080411 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Shank3Q4ACU6 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Shank3Q4ACU6 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Shank3Q4ACU6 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Shank3Q4ACU6 Chit1-203ENSMUST00000160060 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Shank3Q4ACU6 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Shank3Q4ACU6 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Shank3Q4ACU6 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Shank3Q4ACU6 Pdzk1-201ENSMUST00000058865 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Shank3Q4ACU6 Bmp4-202ENSMUST00000100676 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Shank3Q4ACU6 Ccndbp1-203ENSMUST00000099489 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Shank3Q4ACU6 2610301B20Rik-202ENSMUST00000101504 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Shank3Q4ACU6 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Shank3Q4ACU6 Oc90-202ENSMUST00000079776 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Shank3Q4ACU6 Ypel4-201ENSMUST00000090729 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Shank3Q4ACU6 Tcl1-202ENSMUST00000101071 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Shank3Q4ACU6 Gsg1-202ENSMUST00000111909 1087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Shank3Q4ACU6 Marcksl1-ps4-201ENSMUST00000132531 291 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Shank3Q4ACU6 Gm45716-203ENSMUST00000153734 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Shank3Q4ACU6 4930557F10Rik-201ENSMUST00000155432 630 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Shank3Q4ACU6 Tcl1-204ENSMUST00000176579 760 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Shank3Q4ACU6 Spdye4c-203ENSMUST00000178601 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Shank3Q4ACU6 A930005H10Rik-204ENSMUST00000185681 625 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Shank3Q4ACU6 A930005H10Rik-206ENSMUST00000188260 739 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Shank3Q4ACU6 Gm19587-201ENSMUST00000191395 545 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Shank3Q4ACU6 Gm37013-201ENSMUST00000194544 313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Shank3Q4ACU6 1700013M08Rik-202ENSMUST00000200080 798 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Shank3Q4ACU6 2010109P13Rik-201ENSMUST00000204605 392 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Shank3Q4ACU6 Folr2-203ENSMUST00000210598 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Shank3Q4ACU6 AC168279.1-201ENSMUST00000214611 382 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Shank3Q4ACU6 Otx2-202ENSMUST00000119070 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Shank3Q4ACU6 Ankrd53-201ENSMUST00000014891 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Shank3Q4ACU6 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Shank3Q4ACU6 Gm45576-201ENSMUST00000210981 1322 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Shank3Q4ACU6 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Shank3Q4ACU6 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Shank3Q4ACU6 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Shank3Q4ACU6 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Shank3Q4ACU6 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Shank3Q4ACU6 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Shank3Q4ACU6 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Shank3Q4ACU6 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Shank3Q4ACU6 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Shank3Q4ACU6 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Shank3Q4ACU6 Mmp19-203ENSMUST00000219404 2236 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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