Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0J4

Ankrd53, Ankyrin repeat domain-containing protein 53, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ankrd53Q3V0J4 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ankrd53Q3V0J4 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ankrd53Q3V0J4 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ankrd53Q3V0J4 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ankrd53Q3V0J4 Rad51c-202ENSMUST00000067692 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ankrd53Q3V0J4 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ankrd53Q3V0J4 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ankrd53Q3V0J4 Dcaf4-201ENSMUST00000021645 2008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ankrd53Q3V0J4 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ankrd53Q3V0J4 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ankrd53Q3V0J4 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ankrd53Q3V0J4 Gripap1-203ENSMUST00000115675 3015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ankrd53Q3V0J4 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ankrd53Q3V0J4 Rps3-202ENSMUST00000107096 952 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ankrd53Q3V0J4 Smyd3-202ENSMUST00000111134 1229 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ankrd53Q3V0J4 Gm14726-201ENSMUST00000120623 896 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Ankrd53Q3V0J4 Gm14381-201ENSMUST00000122105 414 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Ankrd53Q3V0J4 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ankrd53Q3V0J4 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ankrd53Q3V0J4 Gm2164-201ENSMUST00000184062 424 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ankrd53Q3V0J4 Gm27516-201ENSMUST00000184237 98 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Ankrd53Q3V0J4 Mocs2-215ENSMUST00000184335 646 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ankrd53Q3V0J4 Gm30459-201ENSMUST00000206203 1193 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ankrd53Q3V0J4 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ankrd53Q3V0J4 Kdelr1-203ENSMUST00000211234 832 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ankrd53Q3V0J4 Gm45865-201ENSMUST00000211815 945 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Ankrd53Q3V0J4 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Ankrd53Q3V0J4 Gm9257-201ENSMUST00000221254 232 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Ankrd53Q3V0J4 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ankrd53Q3V0J4 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ankrd53Q3V0J4 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ankrd53Q3V0J4 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ankrd53Q3V0J4 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ankrd53Q3V0J4 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Ankrd53Q3V0J4 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ankrd53Q3V0J4 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ankrd53Q3V0J4 Sept8-204ENSMUST00000121334 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ankrd53Q3V0J4 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ankrd53Q3V0J4 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ankrd53Q3V0J4 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ankrd53Q3V0J4 Wdr81-204ENSMUST00000173320 6908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ankrd53Q3V0J4 Alms1-ps1-201ENSMUST00000159498 2166 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Ankrd53Q3V0J4 Mfsd4b5-205ENSMUST00000170579 1554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ankrd53Q3V0J4 Taldo1-204ENSMUST00000211654 1362 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ankrd53Q3V0J4 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ankrd53Q3V0J4 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ankrd53Q3V0J4 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ankrd53Q3V0J4 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ankrd53Q3V0J4 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ankrd53Q3V0J4 Srp54b-202ENSMUST00000218879 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ankrd53Q3V0J4 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ankrd53Q3V0J4 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ankrd53Q3V0J4 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ankrd53Q3V0J4 Pcdhb22-202ENSMUST00000192409 6609 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ankrd53Q3V0J4 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ankrd53Q3V0J4 Usp24-201ENSMUST00000094933 10575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ankrd53Q3V0J4 Madd-203ENSMUST00000075269 5756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ankrd53Q3V0J4 Creb3l2-201ENSMUST00000041093 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ankrd53Q3V0J4 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ankrd53Q3V0J4 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ankrd53Q3V0J4 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ankrd53Q3V0J4 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ankrd53Q3V0J4 Gm12058-201ENSMUST00000118614 437 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Ankrd53Q3V0J4 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ankrd53Q3V0J4 Aamdc-210ENSMUST00000146605 642 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ankrd53Q3V0J4 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ankrd53Q3V0J4 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ankrd53Q3V0J4 Gm26973-201ENSMUST00000182105 696 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ankrd53Q3V0J4 Gm26956-201ENSMUST00000182176 986 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Ankrd53Q3V0J4 Gm43758-201ENSMUST00000199500 367 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Ankrd53Q3V0J4 AC132384.14-201ENSMUST00000219346 1147 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Ankrd53Q3V0J4 Cts7-204ENSMUST00000225321 1257 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Ankrd53Q3V0J4 Olfr1209-201ENSMUST00000099809 933 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ankrd53Q3V0J4 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ankrd53Q3V0J4 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ankrd53Q3V0J4 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ankrd53Q3V0J4 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ankrd53Q3V0J4 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ankrd53Q3V0J4 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ankrd53Q3V0J4 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ankrd53Q3V0J4 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ankrd53Q3V0J4 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ankrd53Q3V0J4 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ankrd53Q3V0J4 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ankrd53Q3V0J4 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ankrd53Q3V0J4 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ankrd53Q3V0J4 Epb41l2-204ENSMUST00000217929 3621 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ankrd53Q3V0J4 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ankrd53Q3V0J4 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ankrd53Q3V0J4 Hars2-201ENSMUST00000019287 2002 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ankrd53Q3V0J4 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ankrd53Q3V0J4 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ankrd53Q3V0J4 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ankrd53Q3V0J4 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ankrd53Q3V0J4 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ankrd53Q3V0J4 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ankrd53Q3V0J4 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ankrd53Q3V0J4 C2cd5-204ENSMUST00000203187 3494 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ankrd53Q3V0J4 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ankrd53Q3V0J4 Lmbr1-201ENSMUST00000055195 4926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms