Protein–RNA interactions for Protein: Q3V038

Ttc9, Tetratricopeptide repeat protein 9A, mousemouse

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Length 219 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc9Q3V038 Lce1e-201ENSMUST00000090867 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ttc9Q3V038 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ttc9Q3V038 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Ttc9Q3V038 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Ttc9Q3V038 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ttc9Q3V038 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ttc9Q3V038 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ttc9Q3V038 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ttc9Q3V038 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ttc9Q3V038 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ttc9Q3V038 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ttc9Q3V038 Gsdma2-201ENSMUST00000017355 1314 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ttc9Q3V038 Zp3-201ENSMUST00000005073 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ttc9Q3V038 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ttc9Q3V038 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ttc9Q3V038 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Ttc9Q3V038 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Ttc9Q3V038 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Ttc9Q3V038 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Ttc9Q3V038 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ttc9Q3V038 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ttc9Q3V038 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ttc9Q3V038 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ttc9Q3V038 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ttc9Q3V038 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Ttc9Q3V038 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ttc9Q3V038 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ttc9Q3V038 Aire-202ENSMUST00000105395 1630 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ttc9Q3V038 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ttc9Q3V038 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ttc9Q3V038 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ttc9Q3V038 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Ttc9Q3V038 Kdelr1-203ENSMUST00000211234 832 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ttc9Q3V038 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ttc9Q3V038 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ttc9Q3V038 Gm32141-201ENSMUST00000220189 488 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ttc9Q3V038 CT025694.1-201ENSMUST00000226188 934 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Ttc9Q3V038 Kcnk7-201ENSMUST00000052448 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ttc9Q3V038 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ttc9Q3V038 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ttc9Q3V038 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ttc9Q3V038 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ttc9Q3V038 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ttc9Q3V038 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ttc9Q3V038 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Ttc9Q3V038 Gm4735-201ENSMUST00000138679 1302 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Ttc9Q3V038 Gm5855-201ENSMUST00000200240 1305 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Ttc9Q3V038 Sparc-209ENSMUST00000216313 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ttc9Q3V038 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ttc9Q3V038 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ttc9Q3V038 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ttc9Q3V038 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ttc9Q3V038 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ttc9Q3V038 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ttc9Q3V038 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ttc9Q3V038 CU062626.3-201ENSMUST00000225522 1411 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Ttc9Q3V038 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ttc9Q3V038 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ttc9Q3V038 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ttc9Q3V038 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ttc9Q3V038 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ttc9Q3V038 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ttc9Q3V038 0610010K14Rik-203ENSMUST00000100950 545 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ttc9Q3V038 Ccl27a-203ENSMUST00000108033 428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ttc9Q3V038 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Ttc9Q3V038 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Ttc9Q3V038 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Ttc9Q3V038 Gm13388-201ENSMUST00000126659 425 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
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Ttc9Q3V038 2610016A17Rik-202ENSMUST00000186768 689 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Ttc9Q3V038 Gm45765-201ENSMUST00000212027 1035 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
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Ttc9Q3V038 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ttc9Q3V038 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Ttc9Q3V038 Olfr887-201ENSMUST00000074681 930 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ttc9Q3V038 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ttc9Q3V038 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ttc9Q3V038 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ttc9Q3V038 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ttc9Q3V038 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ttc9Q3V038 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ttc9Q3V038 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ttc9Q3V038 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ttc9Q3V038 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ttc9Q3V038 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ttc9Q3V038 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ttc9Q3V038 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Ttc9Q3V038 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ttc9Q3V038 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Ttc9Q3V038 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ttc9Q3V038 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ttc9Q3V038 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ttc9Q3V038 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ttc9Q3V038 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ttc9Q3V038 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ttc9Q3V038 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ttc9Q3V038 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Ttc9Q3V038 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ttc9Q3V038 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ttc9Q3V038 Gm6335-201ENSMUST00000118081 1194 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
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