Protein–RNA interactions for Protein: Q3V036

Ccdc27, Coiled-coil domain-containing protein 27, mousemouse

Predictions only

Length 639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc27Q3V036 Palm-204ENSMUST00000218631 2725 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc27Q3V036 Lmnb2-204ENSMUST00000179022 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc27Q3V036 Kctd10-202ENSMUST00000102581 3103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc27Q3V036 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc27Q3V036 Tbx4-203ENSMUST00000108047 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc27Q3V036 Fcho1-201ENSMUST00000093444 3073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc27Q3V036 Smim1-208ENSMUST00000143047 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc27Q3V036 Terb1-201ENSMUST00000064576 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc27Q3V036 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc27Q3V036 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc27Q3V036 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc27Q3V036 Tbc1d1-202ENSMUST00000101195 5432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc27Q3V036 Anp32e-204ENSMUST00000168106 2890 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc27Q3V036 Telo2-201ENSMUST00000024987 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc27Q3V036 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc27Q3V036 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc27Q3V036 Ptgr2-207ENSMUST00000146377 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc27Q3V036 Akt2-201ENSMUST00000051356 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc27Q3V036 Edc4-202ENSMUST00000119261 4645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc27Q3V036 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc27Q3V036 Camk2d-216ENSMUST00000163226 4204 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc27Q3V036 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc27Q3V036 Mbd1-202ENSMUST00000224047 2838 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc27Q3V036 Ttc27-201ENSMUST00000024882 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc27Q3V036 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc27Q3V036 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc27Q3V036 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc27Q3V036 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc27Q3V036 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc27Q3V036 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc27Q3V036 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc27Q3V036 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc27Q3V036 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc27Q3V036 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc27Q3V036 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc27Q3V036 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc27Q3V036 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc27Q3V036 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc27Q3V036 Hnrnpf-201ENSMUST00000035493 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc27Q3V036 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc27Q3V036 Slc17a5-202ENSMUST00000117645 3114 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc27Q3V036 9330182L06Rik-204ENSMUST00000134991 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc27Q3V036 Poldip3-201ENSMUST00000058793 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc27Q3V036 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc27Q3V036 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc27Q3V036 Pla2g15-201ENSMUST00000034377 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc27Q3V036 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc27Q3V036 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc27Q3V036 Ticam2-201ENSMUST00000070084 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc27Q3V036 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc27Q3V036 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc27Q3V036 Sertm1-201ENSMUST00000070342 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc27Q3V036 Pink1-202ENSMUST00000105816 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc27Q3V036 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc27Q3V036 Gusb-201ENSMUST00000026613 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc27Q3V036 Gjd4-201ENSMUST00000041007 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc27Q3V036 Kdm2a-201ENSMUST00000047898 8578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
Ccdc27Q3V036 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc27Q3V036 Gstt2-208ENSMUST00000220440 2254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc27Q3V036 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc27Q3V036 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc27Q3V036 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc27Q3V036 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc27Q3V036 Lamc3-201ENSMUST00000028187 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc27Q3V036 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc27Q3V036 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc27Q3V036 Clvs2-204ENSMUST00000161692 4283 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc27Q3V036 Xkr5-201ENSMUST00000055503 3176 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc27Q3V036 Eif4a2-223ENSMUST00000168891 2203 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc27Q3V036 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc27Q3V036 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc27Q3V036 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc27Q3V036 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc27Q3V036 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc27Q3V036 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc27Q3V036 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc27Q3V036 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc27Q3V036 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc27Q3V036 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc27Q3V036 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc27Q3V036 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc27Q3V036 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc27Q3V036 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc27Q3V036 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc27Q3V036 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc27Q3V036 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc27Q3V036 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc27Q3V036 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc27Q3V036 Gm43860-201ENSMUST00000201742 2705 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc27Q3V036 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc27Q3V036 Tiparp-201ENSMUST00000047906 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc27Q3V036 L3mbtl2-208ENSMUST00000174229 2578 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc27Q3V036 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc27Q3V036 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc27Q3V036 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc27Q3V036 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc27Q3V036 Zfp941-201ENSMUST00000080651 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc27Q3V036 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc27Q3V036 Gucy2e-203ENSMUST00000108665 3645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc27Q3V036 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.9 ms