Protein–RNA interactions for Protein: Q3US17

Znf48, Zinc finger protein 48, mousemouse

Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf48Q3US17 Rasgrp4-214ENSMUST00000205027 2717 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Znf48Q3US17 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Znf48Q3US17 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Znf48Q3US17 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Znf48Q3US17 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Znf48Q3US17 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Znf48Q3US17 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Znf48Q3US17 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Znf48Q3US17 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Znf48Q3US17 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Znf48Q3US17 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Znf48Q3US17 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Znf48Q3US17 Cd3e-201ENSMUST00000102832 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Znf48Q3US17 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Znf48Q3US17 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Znf48Q3US17 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Znf48Q3US17 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Znf48Q3US17 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Znf48Q3US17 Lgr5-201ENSMUST00000020350 4714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Znf48Q3US17 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Znf48Q3US17 Epb41l1-203ENSMUST00000103136 6249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Znf48Q3US17 Pomgnt1-205ENSMUST00000121052 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Znf48Q3US17 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Znf48Q3US17 Sectm1a-204ENSMUST00000106120 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Znf48Q3US17 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Znf48Q3US17 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Znf48Q3US17 Gm13115-201ENSMUST00000156438 620 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Znf48Q3US17 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Znf48Q3US17 Vmn1r-ps8-201ENSMUST00000177200 838 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Znf48Q3US17 Gm7895-201ENSMUST00000187459 1173 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Znf48Q3US17 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Znf48Q3US17 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Znf48Q3US17 Gm37312-201ENSMUST00000195753 685 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Znf48Q3US17 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Znf48Q3US17 Gm45701-201ENSMUST00000212049 235 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Znf48Q3US17 2700097O09Rik-201ENSMUST00000021406 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Znf48Q3US17 AC155637.1-201ENSMUST00000218560 636 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Znf48Q3US17 CT030194.1-201ENSMUST00000225507 532 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Znf48Q3US17 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Znf48Q3US17 2310057N15Rik-201ENSMUST00000054223 1028 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Znf48Q3US17 Vmn1r35-201ENSMUST00000071414 891 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Znf48Q3US17 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Znf48Q3US17 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Znf48Q3US17 Edc4-202ENSMUST00000119261 4645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Znf48Q3US17 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Znf48Q3US17 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Znf48Q3US17 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Znf48Q3US17 Oprd1-201ENSMUST00000056336 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Znf48Q3US17 Utp23-203ENSMUST00000137116 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Znf48Q3US17 Rcor3-201ENSMUST00000073279 3748 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Znf48Q3US17 Gm38262-201ENSMUST00000194760 1382 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Znf48Q3US17 Shank2-202ENSMUST00000105900 8169 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Znf48Q3US17 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Znf48Q3US17 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Znf48Q3US17 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Znf48Q3US17 AC154806.5-202ENSMUST00000227217 1443 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Znf48Q3US17 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Znf48Q3US17 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Znf48Q3US17 Nfe2l1-210ENSMUST00000167110 3547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Znf48Q3US17 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Znf48Q3US17 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Znf48Q3US17 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Znf48Q3US17 Cul9-204ENSMUST00000182485 7848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Znf48Q3US17 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Znf48Q3US17 Fn1-201ENSMUST00000055226 8315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Znf48Q3US17 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Znf48Q3US17 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Znf48Q3US17 Gm26823-201ENSMUST00000181425 2361 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Znf48Q3US17 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Znf48Q3US17 Sept8-204ENSMUST00000121334 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Znf48Q3US17 A830018L16Rik-202ENSMUST00000135014 6451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Znf48Q3US17 Myo15b-208ENSMUST00000222123 5154 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Znf48Q3US17 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Znf48Q3US17 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Znf48Q3US17 Gm26794-201ENSMUST00000180810 4312 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Znf48Q3US17 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Znf48Q3US17 Fbxo40-202ENSMUST00000114806 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Znf48Q3US17 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Znf48Q3US17 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Znf48Q3US17 Ppm1l-201ENSMUST00000029355 9417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Znf48Q3US17 Cacna1c-201ENSMUST00000075591 7584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Znf48Q3US17 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Znf48Q3US17 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Znf48Q3US17 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Znf48Q3US17 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Znf48Q3US17 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Znf48Q3US17 Gm14381-201ENSMUST00000122105 414 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Znf48Q3US17 Gm12749-201ENSMUST00000122138 1159 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Znf48Q3US17 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Znf48Q3US17 2010001A14Rik-203ENSMUST00000152790 714 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Znf48Q3US17 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Znf48Q3US17 Gm17111-201ENSMUST00000169981 411 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Znf48Q3US17 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Znf48Q3US17 1500004A13Rik-208ENSMUST00000184958 823 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Znf48Q3US17 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Znf48Q3US17 Gm37259-201ENSMUST00000193903 849 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Znf48Q3US17 Gm43055-201ENSMUST00000198859 879 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Znf48Q3US17 Gm5149-202ENSMUST00000199980 1250 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Znf48Q3US17 Scoc-203ENSMUST00000212031 409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Znf48Q3US17 AC131743.3-201ENSMUST00000222099 662 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.9 ms