Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPV3

E130208F15Rik, RIKEN cDNA E130208F15 gene, mousemouse

Predictions only

Length 143 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E130208F15RikQ3UPV3 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC8.55□□□□□ -1.04
E130208F15RikQ3UPV3 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
E130208F15RikQ3UPV3 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
E130208F15RikQ3UPV3 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC8.55□□□□□ -1.04
E130208F15RikQ3UPV3 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC8.55□□□□□ -1.04
E130208F15RikQ3UPV3 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
E130208F15RikQ3UPV3 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC8.55□□□□□ -1.04
E130208F15RikQ3UPV3 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC8.55□□□□□ -1.04
E130208F15RikQ3UPV3 Gm16302-201ENSMUST00000159268 428 ntTSL 3 BASIC8.55□□□□□ -1.04
E130208F15RikQ3UPV3 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC8.55□□□□□ -1.04
E130208F15RikQ3UPV3 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
E130208F15RikQ3UPV3 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
E130208F15RikQ3UPV3 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC8.55□□□□□ -1.04
E130208F15RikQ3UPV3 1500004A13Rik-208ENSMUST00000184958 823 ntTSL 3 BASIC8.55□□□□□ -1.04
E130208F15RikQ3UPV3 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC8.55□□□□□ -1.04
E130208F15RikQ3UPV3 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC8.55□□□□□ -1.04
E130208F15RikQ3UPV3 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC8.55□□□□□ -1.04
E130208F15RikQ3UPV3 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC8.55□□□□□ -1.04
E130208F15RikQ3UPV3 Pop4-201ENSMUST00000032585 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
E130208F15RikQ3UPV3 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
E130208F15RikQ3UPV3 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
E130208F15RikQ3UPV3 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
E130208F15RikQ3UPV3 CT009757.3-201ENSMUST00000223367 2320 ntBASIC8.55□□□□□ -1.04
E130208F15RikQ3UPV3 Cmtm6-201ENSMUST00000035007 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
E130208F15RikQ3UPV3 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
E130208F15RikQ3UPV3 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
E130208F15RikQ3UPV3 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
E130208F15RikQ3UPV3 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
E130208F15RikQ3UPV3 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
E130208F15RikQ3UPV3 Pfas-201ENSMUST00000021282 6373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.55□□□□□ -1.04
E130208F15RikQ3UPV3 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
E130208F15RikQ3UPV3 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
E130208F15RikQ3UPV3 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
E130208F15RikQ3UPV3 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
E130208F15RikQ3UPV3 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
E130208F15RikQ3UPV3 Arsa-202ENSMUST00000165199 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
E130208F15RikQ3UPV3 Abca7-203ENSMUST00000171637 6638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
E130208F15RikQ3UPV3 Gm26905-201ENSMUST00000180798 6621 ntTSL 5 BASIC8.54□□□□□ -1.04
E130208F15RikQ3UPV3 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
E130208F15RikQ3UPV3 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
E130208F15RikQ3UPV3 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
E130208F15RikQ3UPV3 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC8.54□□□□□ -1.04
E130208F15RikQ3UPV3 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
E130208F15RikQ3UPV3 Man1a2-201ENSMUST00000008907 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
E130208F15RikQ3UPV3 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
E130208F15RikQ3UPV3 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
E130208F15RikQ3UPV3 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
E130208F15RikQ3UPV3 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
E130208F15RikQ3UPV3 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
E130208F15RikQ3UPV3 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
E130208F15RikQ3UPV3 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC8.54□□□□□ -1.04
E130208F15RikQ3UPV3 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
E130208F15RikQ3UPV3 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
E130208F15RikQ3UPV3 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
E130208F15RikQ3UPV3 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
E130208F15RikQ3UPV3 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
E130208F15RikQ3UPV3 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
E130208F15RikQ3UPV3 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
E130208F15RikQ3UPV3 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
E130208F15RikQ3UPV3 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
E130208F15RikQ3UPV3 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC8.54□□□□□ -1.04
E130208F15RikQ3UPV3 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC8.54□□□□□ -1.04
E130208F15RikQ3UPV3 Gm11658-201ENSMUST00000120913 1008 ntBASIC8.54□□□□□ -1.04
E130208F15RikQ3UPV3 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
E130208F15RikQ3UPV3 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC8.54□□□□□ -1.04
E130208F15RikQ3UPV3 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC8.54□□□□□ -1.04
E130208F15RikQ3UPV3 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
E130208F15RikQ3UPV3 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
E130208F15RikQ3UPV3 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.54□□□□□ -1.04
E130208F15RikQ3UPV3 Gm2467-201ENSMUST00000182266 1010 ntBASIC8.54□□□□□ -1.04
E130208F15RikQ3UPV3 Gm6981-201ENSMUST00000182467 1008 ntBASIC8.54□□□□□ -1.04
E130208F15RikQ3UPV3 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC8.54□□□□□ -1.04
E130208F15RikQ3UPV3 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
E130208F15RikQ3UPV3 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
E130208F15RikQ3UPV3 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC8.54□□□□□ -1.04
E130208F15RikQ3UPV3 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC8.54□□□□□ -1.04
E130208F15RikQ3UPV3 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
E130208F15RikQ3UPV3 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC8.54□□□□□ -1.04
E130208F15RikQ3UPV3 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC8.54□□□□□ -1.04
E130208F15RikQ3UPV3 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
E130208F15RikQ3UPV3 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
E130208F15RikQ3UPV3 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
E130208F15RikQ3UPV3 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
E130208F15RikQ3UPV3 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
E130208F15RikQ3UPV3 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
E130208F15RikQ3UPV3 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
E130208F15RikQ3UPV3 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC8.54□□□□□ -1.04
E130208F15RikQ3UPV3 Wdr81-204ENSMUST00000173320 6908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.54□□□□□ -1.04
E130208F15RikQ3UPV3 St6galnac6-201ENSMUST00000072111 2277 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.54□□□□□ -1.04
E130208F15RikQ3UPV3 Gm4735-201ENSMUST00000138679 1302 ntBASIC8.54□□□□□ -1.04
E130208F15RikQ3UPV3 Gm5855-201ENSMUST00000200240 1305 ntBASIC8.54□□□□□ -1.04
E130208F15RikQ3UPV3 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
E130208F15RikQ3UPV3 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
E130208F15RikQ3UPV3 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
E130208F15RikQ3UPV3 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
E130208F15RikQ3UPV3 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
E130208F15RikQ3UPV3 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
E130208F15RikQ3UPV3 Gm38569-201ENSMUST00000205476 2228 ntTSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
E130208F15RikQ3UPV3 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC8.53□□□□□ -1.04
E130208F15RikQ3UPV3 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC8.53□□□□□ -1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms