Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPL0

Sec31a, Protein transport protein Sec31A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,230 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec31aQ3UPL0 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Sec31aQ3UPL0 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Sec31aQ3UPL0 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Sec31aQ3UPL0 5930412G12Rik-201ENSMUST00000091324 2403 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Sec31aQ3UPL0 Il22ra1-201ENSMUST00000102546 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Sec31aQ3UPL0 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Sec31aQ3UPL0 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Sec31aQ3UPL0 Cyp4f40-201ENSMUST00000165061 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Sec31aQ3UPL0 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Sec31aQ3UPL0 Gm43075-201ENSMUST00000198613 3905 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Sec31aQ3UPL0 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Sec31aQ3UPL0 Paip2b-201ENSMUST00000058383 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Sec31aQ3UPL0 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Sec31aQ3UPL0 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Sec31aQ3UPL0 Ttc23-202ENSMUST00000107470 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Sec31aQ3UPL0 Srek1-201ENSMUST00000074616 3934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sec31aQ3UPL0 Rbm10-202ENSMUST00000082089 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sec31aQ3UPL0 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sec31aQ3UPL0 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sec31aQ3UPL0 Lrrc18-204ENSMUST00000120951 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sec31aQ3UPL0 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sec31aQ3UPL0 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sec31aQ3UPL0 Atp6v0a1-210ENSMUST00000168757 3967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sec31aQ3UPL0 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sec31aQ3UPL0 Ctsc-201ENSMUST00000032779 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sec31aQ3UPL0 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sec31aQ3UPL0 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sec31aQ3UPL0 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sec31aQ3UPL0 Calm1-202ENSMUST00000110082 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sec31aQ3UPL0 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sec31aQ3UPL0 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sec31aQ3UPL0 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sec31aQ3UPL0 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Sec31aQ3UPL0 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Sec31aQ3UPL0 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sec31aQ3UPL0 Gm9022-201ENSMUST00000182482 992 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Sec31aQ3UPL0 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sec31aQ3UPL0 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sec31aQ3UPL0 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sec31aQ3UPL0 Duox1-201ENSMUST00000099461 5267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sec31aQ3UPL0 Fnbp1-202ENSMUST00000075326 1761 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sec31aQ3UPL0 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sec31aQ3UPL0 Nlrx1-202ENSMUST00000168499 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sec31aQ3UPL0 Mirt1-202ENSMUST00000180667 1633 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sec31aQ3UPL0 Pxylp1-201ENSMUST00000078478 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sec31aQ3UPL0 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sec31aQ3UPL0 Gm44831-201ENSMUST00000208469 2989 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Sec31aQ3UPL0 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sec31aQ3UPL0 Cog3-203ENSMUST00000227473 4197 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Sec31aQ3UPL0 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sec31aQ3UPL0 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sec31aQ3UPL0 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sec31aQ3UPL0 Osgin1-206ENSMUST00000152420 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sec31aQ3UPL0 Gm20687-203ENSMUST00000185121 4242 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sec31aQ3UPL0 Traf3ip2-201ENSMUST00000019987 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sec31aQ3UPL0 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sec31aQ3UPL0 AC160405.1-201ENSMUST00000218207 1545 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Sec31aQ3UPL0 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Sec31aQ3UPL0 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Sec31aQ3UPL0 Ccpg1-208ENSMUST00000150826 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Sec31aQ3UPL0 Man2c1-215ENSMUST00000161182 2909 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Sec31aQ3UPL0 Gm2916-202ENSMUST00000181779 1702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Sec31aQ3UPL0 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Sec31aQ3UPL0 Atg4c-203ENSMUST00000180278 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Sec31aQ3UPL0 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Sec31aQ3UPL0 Gm43727-201ENSMUST00000198021 2647 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Sec31aQ3UPL0 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Sec31aQ3UPL0 Arhgef3-204ENSMUST00000225949 3198 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Sec31aQ3UPL0 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Sec31aQ3UPL0 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Sec31aQ3UPL0 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Sec31aQ3UPL0 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Sec31aQ3UPL0 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Sec31aQ3UPL0 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Sec31aQ3UPL0 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Sec31aQ3UPL0 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Sec31aQ3UPL0 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Sec31aQ3UPL0 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Sec31aQ3UPL0 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Sec31aQ3UPL0 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Sec31aQ3UPL0 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Sec31aQ3UPL0 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Sec31aQ3UPL0 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Sec31aQ3UPL0 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Sec31aQ3UPL0 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Sec31aQ3UPL0 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Sec31aQ3UPL0 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Sec31aQ3UPL0 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Sec31aQ3UPL0 Etv3-205ENSMUST00000170036 5127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Sec31aQ3UPL0 Eps15l1-201ENSMUST00000163643 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Sec31aQ3UPL0 AC122840.1-201ENSMUST00000220915 3334 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Sec31aQ3UPL0 Apold1-201ENSMUST00000167323 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Sec31aQ3UPL0 Nxph1-202ENSMUST00000160300 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Sec31aQ3UPL0 Pcsk7-201ENSMUST00000039059 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Sec31aQ3UPL0 Gm28373-201ENSMUST00000178129 2724 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Sec31aQ3UPL0 1110051M20Rik-203ENSMUST00000102594 1977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sec31aQ3UPL0 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sec31aQ3UPL0 Mmel1-204ENSMUST00000105635 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sec31aQ3UPL0 L3mbtl2-208ENSMUST00000174229 2578 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sec31aQ3UPL0 Smim1-208ENSMUST00000143047 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
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