Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPC7

Uncharacterized protein KIAA0825 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,272 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3UPC7 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q3UPC7 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q3UPC7 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q3UPC7 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q3UPC7 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q3UPC7 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q3UPC7 H2-T10-202ENSMUST00000174382 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q3UPC7 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q3UPC7 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q3UPC7 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q3UPC7 A430060F13Rik-201ENSMUST00000124176 378 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Q3UPC7 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q3UPC7 Gm11755-201ENSMUST00000144096 891 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q3UPC7 Gm12984-201ENSMUST00000145711 273 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q3UPC7 Gm13381-202ENSMUST00000177012 640 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q3UPC7 Gm31256-201ENSMUST00000194705 506 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Q3UPC7 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q3UPC7 4930589O11Rik-201ENSMUST00000200768 920 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Q3UPC7 Gm3961-201ENSMUST00000204425 994 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Q3UPC7 Gm3402-201ENSMUST00000036715 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q3UPC7 Olfr117-201ENSMUST00000073636 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q3UPC7 Olfr130-201ENSMUST00000087129 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q3UPC7 B230398E01Rik-201ENSMUST00000125186 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q3UPC7 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q3UPC7 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q3UPC7 Lrrc18-204ENSMUST00000120951 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q3UPC7 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q3UPC7 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q3UPC7 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q3UPC7 Dram1-201ENSMUST00000020249 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q3UPC7 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q3UPC7 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q3UPC7 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q3UPC7 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q3UPC7 Gm27177-202ENSMUST00000183514 2703 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Q3UPC7 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q3UPC7 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q3UPC7 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q3UPC7 Smarca1-205ENSMUST00000141084 1965 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q3UPC7 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q3UPC7 Arrb1-201ENSMUST00000032995 3715 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q3UPC7 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q3UPC7 Olfr288-202ENSMUST00000165379 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q3UPC7 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q3UPC7 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Q3UPC7 Gm24934-201ENSMUST00000103764 111 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Q3UPC7 Cdc26-202ENSMUST00000107459 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q3UPC7 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q3UPC7 Gm16087-201ENSMUST00000124395 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q3UPC7 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q3UPC7 Stard10-207ENSMUST00000173270 670 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q3UPC7 Gm7584-201ENSMUST00000175829 940 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Q3UPC7 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q3UPC7 1700045I11Rik-201ENSMUST00000194752 493 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Q3UPC7 Ldha-213ENSMUST00000210631 685 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q3UPC7 Gm33056-201ENSMUST00000213234 1120 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q3UPC7 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q3UPC7 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Q3UPC7 Olfr171-201ENSMUST00000079891 945 ntAPPRIS P2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q3UPC7 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q3UPC7 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q3UPC7 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q3UPC7 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q3UPC7 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q3UPC7 Slc3a2-207ENSMUST00000206598 1393 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q3UPC7 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q3UPC7 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q3UPC7 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q3UPC7 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q3UPC7 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q3UPC7 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q3UPC7 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q3UPC7 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q3UPC7 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q3UPC7 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q3UPC7 Ldb3-203ENSMUST00000022330 1586 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q3UPC7 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q3UPC7 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q3UPC7 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q3UPC7 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q3UPC7 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q3UPC7 Gm15547-201ENSMUST00000122152 333 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Q3UPC7 Gm8885-201ENSMUST00000189382 598 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Q3UPC7 Gm44364-201ENSMUST00000198368 141 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Q3UPC7 Fam168a-210ENSMUST00000216021 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q3UPC7 Cyp4f17-201ENSMUST00000165999 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q3UPC7 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q3UPC7 Gm8862-201ENSMUST00000198379 1346 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Q3UPC7 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q3UPC7 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Q3UPC7 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q3UPC7 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q3UPC7 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q3UPC7 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q3UPC7 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q3UPC7 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q3UPC7 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Q3UPC7 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Q3UPC7 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Q3UPC7 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.2 ms