Protein–RNA interactions for Protein: Q3UND0

Skap2, Src kinase-associated phosphoprotein 2, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skap2Q3UND0 Grpel1-201ENSMUST00000031099 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Skap2Q3UND0 Jak3-203ENSMUST00000110013 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Skap2Q3UND0 Lgi4-201ENSMUST00000039775 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Skap2Q3UND0 Jak3-201ENSMUST00000051995 4019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Skap2Q3UND0 Slc44a1-204ENSMUST00000107647 2176 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Skap2Q3UND0 Agpat5-202ENSMUST00000149565 10779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Skap2Q3UND0 Cog3-203ENSMUST00000227473 4197 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Skap2Q3UND0 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Skap2Q3UND0 Asap3-201ENSMUST00000047526 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Skap2Q3UND0 Ly75-202ENSMUST00000112533 6901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Skap2Q3UND0 Dis3l-201ENSMUST00000068367 3605 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Skap2Q3UND0 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Skap2Q3UND0 Hdac6-202ENSMUST00000115642 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Skap2Q3UND0 Eef2k-203ENSMUST00000106488 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Skap2Q3UND0 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Skap2Q3UND0 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Skap2Q3UND0 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Skap2Q3UND0 Fam163a-201ENSMUST00000015628 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Skap2Q3UND0 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Skap2Q3UND0 Rnf44-217ENSMUST00000150806 3772 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Skap2Q3UND0 AC126257.2-201ENSMUST00000215507 2300 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Skap2Q3UND0 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Skap2Q3UND0 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Skap2Q3UND0 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Skap2Q3UND0 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Skap2Q3UND0 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Skap2Q3UND0 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Skap2Q3UND0 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Skap2Q3UND0 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Skap2Q3UND0 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Skap2Q3UND0 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Skap2Q3UND0 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Skap2Q3UND0 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Skap2Q3UND0 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Skap2Q3UND0 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Skap2Q3UND0 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Skap2Q3UND0 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Skap2Q3UND0 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Skap2Q3UND0 Nrg1-206ENSMUST00000208205 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Skap2Q3UND0 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Skap2Q3UND0 Gm2822-201ENSMUST00000164299 2910 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Skap2Q3UND0 Gm14137-201ENSMUST00000069711 3067 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Skap2Q3UND0 Snap23-201ENSMUST00000028743 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Skap2Q3UND0 Ttc25-201ENSMUST00000006976 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Skap2Q3UND0 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Skap2Q3UND0 Slc39a14-202ENSMUST00000068044 4926 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Skap2Q3UND0 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Skap2Q3UND0 Trmt61b-202ENSMUST00000137830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Skap2Q3UND0 Lmo3-206ENSMUST00000163024 1331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Skap2Q3UND0 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Skap2Q3UND0 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Skap2Q3UND0 Plxnb2-201ENSMUST00000060808 6394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Skap2Q3UND0 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Skap2Q3UND0 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Skap2Q3UND0 Acsm4-201ENSMUST00000047045 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Skap2Q3UND0 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Skap2Q3UND0 AC122840.1-201ENSMUST00000220915 3334 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Skap2Q3UND0 Grm5-202ENSMUST00000125009 8047 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Skap2Q3UND0 Il2rb-201ENSMUST00000089398 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Skap2Q3UND0 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Skap2Q3UND0 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Skap2Q3UND0 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Skap2Q3UND0 Pla2g6-206ENSMUST00000173163 3018 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Skap2Q3UND0 Ptgir-202ENSMUST00000144408 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Skap2Q3UND0 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Skap2Q3UND0 Htr2c-207ENSMUST00000156697 4654 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Skap2Q3UND0 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Skap2Q3UND0 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Skap2Q3UND0 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Skap2Q3UND0 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Skap2Q3UND0 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Skap2Q3UND0 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Skap2Q3UND0 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Skap2Q3UND0 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Skap2Q3UND0 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Skap2Q3UND0 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Skap2Q3UND0 Gm44086-201ENSMUST00000203251 2349 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Skap2Q3UND0 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Skap2Q3UND0 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Skap2Q3UND0 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Skap2Q3UND0 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Skap2Q3UND0 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Skap2Q3UND0 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Skap2Q3UND0 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Skap2Q3UND0 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Skap2Q3UND0 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Skap2Q3UND0 Pigo-201ENSMUST00000067481 3525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Skap2Q3UND0 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Skap2Q3UND0 Cbx7-201ENSMUST00000089293 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Skap2Q3UND0 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Skap2Q3UND0 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Skap2Q3UND0 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Skap2Q3UND0 Aldh1a7-201ENSMUST00000025656 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Skap2Q3UND0 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Skap2Q3UND0 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Skap2Q3UND0 Slx4ip-201ENSMUST00000028737 2556 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Skap2Q3UND0 Bmp3-201ENSMUST00000031278 6548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Skap2Q3UND0 Ush1c-201ENSMUST00000009667 3072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Skap2Q3UND0 Plcg1-202ENSMUST00000103115 4435 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Skap2Q3UND0 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.4 ms