Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJ22

Gm648, Gene model 648, (NCBI), mousemouse

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Length 213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm648Q3UJ22 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm648Q3UJ22 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm648Q3UJ22 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm648Q3UJ22 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm648Q3UJ22 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm648Q3UJ22 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm648Q3UJ22 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm648Q3UJ22 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
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Gm648Q3UJ22 Aldh16a1-206ENSMUST00000209963 3537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm648Q3UJ22 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm648Q3UJ22 Pycr1-206ENSMUST00000170556 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm648Q3UJ22 Gm26846-201ENSMUST00000181865 4869 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm648Q3UJ22 Kcnh3-201ENSMUST00000041415 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm648Q3UJ22 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
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Gm648Q3UJ22 Ift88os-201ENSMUST00000149702 2016 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm648Q3UJ22 Kcnt1-212ENSMUST00000197917 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm648Q3UJ22 Fgfr1op-201ENSMUST00000024636 3077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm648Q3UJ22 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm648Q3UJ22 Pofut1-201ENSMUST00000049863 5600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm648Q3UJ22 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm648Q3UJ22 Dab2ip-201ENSMUST00000065001 6392 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
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Gm648Q3UJ22 Pcdhgb6-201ENSMUST00000003599 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
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Gm648Q3UJ22 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm648Q3UJ22 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm648Q3UJ22 Ikbkg-204ENSMUST00000114128 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm648Q3UJ22 Erbin-201ENSMUST00000022222 6369 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm648Q3UJ22 Hdac5-204ENSMUST00000107152 3788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
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Gm648Q3UJ22 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm648Q3UJ22 Camsap3-209ENSMUST00000207970 3817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm648Q3UJ22 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm648Q3UJ22 C730027H18Rik-201ENSMUST00000218381 2300 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm648Q3UJ22 Als2cl-201ENSMUST00000084926 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm648Q3UJ22 Suclg2-201ENSMUST00000079847 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm648Q3UJ22 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
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Gm648Q3UJ22 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm648Q3UJ22 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
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Gm648Q3UJ22 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm648Q3UJ22 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
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Gm648Q3UJ22 Gm42599-201ENSMUST00000201308 469 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm648Q3UJ22 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm648Q3UJ22 Add2-204ENSMUST00000203366 3407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm648Q3UJ22 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
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Gm648Q3UJ22 Thrap3-201ENSMUST00000080919 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
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Gm648Q3UJ22 Gm42913-201ENSMUST00000197936 1853 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm648Q3UJ22 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm648Q3UJ22 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm648Q3UJ22 Map4-206ENSMUST00000169851 3446 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm648Q3UJ22 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
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Gm648Q3UJ22 Col9a1-202ENSMUST00000088349 3059 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
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Gm648Q3UJ22 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
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Gm648Q3UJ22 AC160562.2-201ENSMUST00000216374 2201 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm648Q3UJ22 Slc22a4-201ENSMUST00000020586 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm648Q3UJ22 Mb21d1-202ENSMUST00000070742 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm648Q3UJ22 Rapgef2-206ENSMUST00000195708 6964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm648Q3UJ22 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm648Q3UJ22 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm648Q3UJ22 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm648Q3UJ22 Lox-201ENSMUST00000025409 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm648Q3UJ22 Gatb-202ENSMUST00000107672 1820 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm648Q3UJ22 Smc3-201ENSMUST00000025930 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm648Q3UJ22 Dopey2-207ENSMUST00000227156 7340 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm648Q3UJ22 Gal3st4-201ENSMUST00000100530 3162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm648Q3UJ22 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm648Q3UJ22 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm648Q3UJ22 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm648Q3UJ22 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm648Q3UJ22 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm648Q3UJ22 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm648Q3UJ22 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm648Q3UJ22 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm648Q3UJ22 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm648Q3UJ22 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm648Q3UJ22 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm648Q3UJ22 Ces3b-201ENSMUST00000074403 1907 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm648Q3UJ22 Chl1-204ENSMUST00000203912 4628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm648Q3UJ22 Vrtn-203ENSMUST00000167227 3440 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm648Q3UJ22 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm648Q3UJ22 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
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