Protein–RNA interactions for Protein: Q3UI66

Ccdc34, Coiled-coil domain-containing protein 34, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc34Q3UI66 Arhgef4-204ENSMUST00000159747 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccdc34Q3UI66 Thsd4-206ENSMUST00000171654 8522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccdc34Q3UI66 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccdc34Q3UI66 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccdc34Q3UI66 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccdc34Q3UI66 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccdc34Q3UI66 Sh3pxd2a-201ENSMUST00000081619 10464 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc34Q3UI66 Sec22b-201ENSMUST00000029476 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc34Q3UI66 Smtn-210ENSMUST00000170588 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc34Q3UI66 Sptan1-204ENSMUST00000113717 7958 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc34Q3UI66 Acad9-201ENSMUST00000011492 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc34Q3UI66 Tmcc2-203ENSMUST00000132435 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc34Q3UI66 Anp32e-202ENSMUST00000165307 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc34Q3UI66 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc34Q3UI66 Sephs1-201ENSMUST00000027973 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc34Q3UI66 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc34Q3UI66 Stx1b-201ENSMUST00000106267 4536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc34Q3UI66 Chd3-202ENSMUST00000108661 7261 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc34Q3UI66 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc34Q3UI66 Tmem161a-201ENSMUST00000002413 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc34Q3UI66 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc34Q3UI66 Ank1-204ENSMUST00000117270 5652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc34Q3UI66 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc34Q3UI66 Coq8a-201ENSMUST00000027766 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc34Q3UI66 Traf7-202ENSMUST00000088464 2504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc34Q3UI66 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc34Q3UI66 Hvcn1-202ENSMUST00000100747 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc34Q3UI66 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc34Q3UI66 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc34Q3UI66 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc34Q3UI66 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc34Q3UI66 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc34Q3UI66 Rian-215ENSMUST00000183180 633 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc34Q3UI66 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc34Q3UI66 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc34Q3UI66 Trdn-202ENSMUST00000217779 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc34Q3UI66 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc34Q3UI66 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc34Q3UI66 Mfsd4b5-202ENSMUST00000073618 2978 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc34Q3UI66 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc34Q3UI66 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc34Q3UI66 Zfp518b-203ENSMUST00000179555 6816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc34Q3UI66 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc34Q3UI66 Ephx3-201ENSMUST00000087721 2416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc34Q3UI66 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc34Q3UI66 Stat1-211ENSMUST00000189347 2588 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc34Q3UI66 Pip5k1b-201ENSMUST00000025800 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc34Q3UI66 Dcun1d2-201ENSMUST00000045366 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc34Q3UI66 Lrba-202ENSMUST00000192145 8843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc34Q3UI66 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc34Q3UI66 Gnas-209ENSMUST00000109088 3519 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc34Q3UI66 Gnas-201ENSMUST00000080493 3519 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc34Q3UI66 Emc1-201ENSMUST00000042096 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc34Q3UI66 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc34Q3UI66 Wdr20rt-201ENSMUST00000046331 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc34Q3UI66 Fancc-217ENSMUST00000163091 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc34Q3UI66 Adam12-201ENSMUST00000067680 7675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccdc34Q3UI66 Gpatch2l-204ENSMUST00000221368 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccdc34Q3UI66 Hnrnpm-206ENSMUST00000148178 3934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccdc34Q3UI66 Ttc30b-201ENSMUST00000099996 2737 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccdc34Q3UI66 Zfp809-206ENSMUST00000215902 1800 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccdc34Q3UI66 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccdc34Q3UI66 Arvcf-202ENSMUST00000115610 3829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccdc34Q3UI66 Tex9-209ENSMUST00000184125 2794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccdc34Q3UI66 Fam120b-201ENSMUST00000055352 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccdc34Q3UI66 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccdc34Q3UI66 Zbtb42-201ENSMUST00000169593 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccdc34Q3UI66 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccdc34Q3UI66 Sik2-205ENSMUST00000176663 4107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccdc34Q3UI66 Acsf3-201ENSMUST00000015160 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccdc34Q3UI66 Alox12-201ENSMUST00000000329 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccdc34Q3UI66 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccdc34Q3UI66 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccdc34Q3UI66 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccdc34Q3UI66 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccdc34Q3UI66 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccdc34Q3UI66 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccdc34Q3UI66 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccdc34Q3UI66 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccdc34Q3UI66 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccdc34Q3UI66 AC153361.2-203ENSMUST00000218083 661 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccdc34Q3UI66 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccdc34Q3UI66 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccdc34Q3UI66 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccdc34Q3UI66 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccdc34Q3UI66 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccdc34Q3UI66 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccdc34Q3UI66 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccdc34Q3UI66 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccdc34Q3UI66 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccdc34Q3UI66 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccdc34Q3UI66 9230105E05Rik-201ENSMUST00000161291 2250 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccdc34Q3UI66 Slc10a7-201ENSMUST00000034111 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccdc34Q3UI66 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccdc34Q3UI66 Angpt4-201ENSMUST00000028955 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccdc34Q3UI66 Scn10a-202ENSMUST00000213392 6692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccdc34Q3UI66 Nrf1-206ENSMUST00000115204 2047 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccdc34Q3UI66 Sez6l2-201ENSMUST00000106332 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccdc34Q3UI66 Gnas-203ENSMUST00000087876 3719 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccdc34Q3UI66 Gm45902-202ENSMUST00000140494 2390 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.1 ms