Protein–RNA interactions for Protein: Q3UDK1

Trafd1, TRAF-type zinc finger domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trafd1Q3UDK1 Myocd-201ENSMUST00000101042 2585 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Trafd1Q3UDK1 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Trafd1Q3UDK1 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Trafd1Q3UDK1 Lrrc18-204ENSMUST00000120951 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Trafd1Q3UDK1 Kcnip4-207ENSMUST00000176191 2116 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Trafd1Q3UDK1 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Trafd1Q3UDK1 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Trafd1Q3UDK1 Polm-202ENSMUST00000109837 2697 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Trafd1Q3UDK1 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Trafd1Q3UDK1 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Trafd1Q3UDK1 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Trafd1Q3UDK1 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Trafd1Q3UDK1 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Trafd1Q3UDK1 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Trafd1Q3UDK1 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Trafd1Q3UDK1 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Trafd1Q3UDK1 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Trafd1Q3UDK1 Vmn1r45-207ENSMUST00000228492 2849 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Trafd1Q3UDK1 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Trafd1Q3UDK1 Accs-201ENSMUST00000041593 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Trafd1Q3UDK1 Gm10728-201ENSMUST00000194292 1829 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Trafd1Q3UDK1 Cacnb2-203ENSMUST00000114723 3945 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Trafd1Q3UDK1 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Trafd1Q3UDK1 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Trafd1Q3UDK1 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Trafd1Q3UDK1 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Trafd1Q3UDK1 Tmem181a-201ENSMUST00000088940 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Trafd1Q3UDK1 Lig1-201ENSMUST00000098814 3091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Trafd1Q3UDK1 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Trafd1Q3UDK1 Dolpp1-203ENSMUST00000123202 2294 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Trafd1Q3UDK1 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Trafd1Q3UDK1 Gm14132-201ENSMUST00000117188 1719 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Trafd1Q3UDK1 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Trafd1Q3UDK1 Pif1-202ENSMUST00000131483 3309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Trafd1Q3UDK1 AC160405.1-201ENSMUST00000218207 1545 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Trafd1Q3UDK1 Gprasp1-201ENSMUST00000113144 5843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Trafd1Q3UDK1 Abcc5-202ENSMUST00000079158 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Trafd1Q3UDK1 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Trafd1Q3UDK1 Gm38569-201ENSMUST00000205476 2228 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Trafd1Q3UDK1 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Trafd1Q3UDK1 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Trafd1Q3UDK1 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Trafd1Q3UDK1 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Trafd1Q3UDK1 Zfp809-206ENSMUST00000215902 1800 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Trafd1Q3UDK1 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Trafd1Q3UDK1 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Trafd1Q3UDK1 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Trafd1Q3UDK1 Arhgap24-206ENSMUST00000112854 2991 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Trafd1Q3UDK1 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Trafd1Q3UDK1 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Trafd1Q3UDK1 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Trafd1Q3UDK1 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Trafd1Q3UDK1 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Trafd1Q3UDK1 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Trafd1Q3UDK1 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Trafd1Q3UDK1 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Trafd1Q3UDK1 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Trafd1Q3UDK1 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Trafd1Q3UDK1 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Trafd1Q3UDK1 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Trafd1Q3UDK1 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Trafd1Q3UDK1 Gm24136-201ENSMUST00000083374 165 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Trafd1Q3UDK1 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Trafd1Q3UDK1 Pdcd4-202ENSMUST00000074371 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Trafd1Q3UDK1 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Trafd1Q3UDK1 Amer2-201ENSMUST00000022561 10506 ntAPPRIS P1 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Trafd1Q3UDK1 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Trafd1Q3UDK1 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Trafd1Q3UDK1 Tsku-202ENSMUST00000164726 2620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Trafd1Q3UDK1 Fam198a-203ENSMUST00000214536 2789 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Trafd1Q3UDK1 1110051M20Rik-203ENSMUST00000102594 1977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Trafd1Q3UDK1 Smarca1-205ENSMUST00000141084 1965 ntTSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Trafd1Q3UDK1 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Trafd1Q3UDK1 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Trafd1Q3UDK1 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Trafd1Q3UDK1 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Trafd1Q3UDK1 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Trafd1Q3UDK1 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Trafd1Q3UDK1 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Trafd1Q3UDK1 Gm44260-201ENSMUST00000204946 2094 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Trafd1Q3UDK1 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Trafd1Q3UDK1 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Trafd1Q3UDK1 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Trafd1Q3UDK1 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Trafd1Q3UDK1 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Trafd1Q3UDK1 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Trafd1Q3UDK1 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Trafd1Q3UDK1 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Trafd1Q3UDK1 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Trafd1Q3UDK1 Hnrnpr-201ENSMUST00000084219 2647 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Trafd1Q3UDK1 Ppp1r10-202ENSMUST00000087211 4255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Trafd1Q3UDK1 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Trafd1Q3UDK1 AC156031.2-201ENSMUST00000213107 3310 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Trafd1Q3UDK1 Eif1a-201ENSMUST00000078079 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Trafd1Q3UDK1 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Trafd1Q3UDK1 H3f3b-201ENSMUST00000016703 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Trafd1Q3UDK1 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Trafd1Q3UDK1 Gm2670-201ENSMUST00000180668 2804 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Trafd1Q3UDK1 Gck-203ENSMUST00000109823 2361 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Trafd1Q3UDK1 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.4 ms