Protein–RNA interactions for Protein: Q3U3Q1

Ulk3, Serine/threonine-protein kinase ULK3, mousemouse

Predictions only

Length 472 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ulk3Q3U3Q1 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ulk3Q3U3Q1 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ulk3Q3U3Q1 Ptprm-203ENSMUST00000224091 3773 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Ulk3Q3U3Q1 Cd93-201ENSMUST00000099269 6677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ulk3Q3U3Q1 Dopey2-207ENSMUST00000227156 7340 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Ulk3Q3U3Q1 Myom3-201ENSMUST00000105854 5575 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ulk3Q3U3Q1 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Ulk3Q3U3Q1 Egfem1-202ENSMUST00000119598 2687 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ulk3Q3U3Q1 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ulk3Q3U3Q1 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ulk3Q3U3Q1 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ulk3Q3U3Q1 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ulk3Q3U3Q1 Slc6a4-201ENSMUST00000021195 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ulk3Q3U3Q1 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ulk3Q3U3Q1 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ulk3Q3U3Q1 Stat5b-202ENSMUST00000107358 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ulk3Q3U3Q1 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ulk3Q3U3Q1 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ulk3Q3U3Q1 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ulk3Q3U3Q1 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ulk3Q3U3Q1 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ulk3Q3U3Q1 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ulk3Q3U3Q1 Ptgfr-201ENSMUST00000029670 6624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ulk3Q3U3Q1 Ubxn10-201ENSMUST00000105809 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ulk3Q3U3Q1 Adipor2-202ENSMUST00000169744 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ulk3Q3U3Q1 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ulk3Q3U3Q1 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Ulk3Q3U3Q1 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ulk3Q3U3Q1 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ulk3Q3U3Q1 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ulk3Q3U3Q1 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Ulk3Q3U3Q1 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ulk3Q3U3Q1 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ulk3Q3U3Q1 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ulk3Q3U3Q1 CT009757.3-201ENSMUST00000223367 2320 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Ulk3Q3U3Q1 Cerk-203ENSMUST00000156546 2162 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ulk3Q3U3Q1 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ulk3Q3U3Q1 Cry2-201ENSMUST00000090559 3976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ulk3Q3U3Q1 Rgs12-207ENSMUST00000114285 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ulk3Q3U3Q1 Sun2-201ENSMUST00000046259 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ulk3Q3U3Q1 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ulk3Q3U3Q1 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ulk3Q3U3Q1 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ulk3Q3U3Q1 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Ulk3Q3U3Q1 Xpnpep1-209ENSMUST00000183108 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ulk3Q3U3Q1 Tmem178b-201ENSMUST00000061740 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ulk3Q3U3Q1 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ulk3Q3U3Q1 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ulk3Q3U3Q1 Wbp1l-201ENSMUST00000099376 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ulk3Q3U3Q1 Egr1-202ENSMUST00000165033 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ulk3Q3U3Q1 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ulk3Q3U3Q1 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ulk3Q3U3Q1 Rufy2-203ENSMUST00000122231 2664 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ulk3Q3U3Q1 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ulk3Q3U3Q1 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Ulk3Q3U3Q1 Tdrd9-201ENSMUST00000079009 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ulk3Q3U3Q1 Olfr707-203ENSMUST00000210644 1817 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ulk3Q3U3Q1 Apbb2-215ENSMUST00000162349 3362 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ulk3Q3U3Q1 Apbb2-201ENSMUST00000087256 3362 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ulk3Q3U3Q1 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Ulk3Q3U3Q1 Pcdh10-202ENSMUST00000170695 8234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ulk3Q3U3Q1 Grip1-205ENSMUST00000105262 4996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ulk3Q3U3Q1 Als2cl-206ENSMUST00000155014 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ulk3Q3U3Q1 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ulk3Q3U3Q1 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ulk3Q3U3Q1 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ulk3Q3U3Q1 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ulk3Q3U3Q1 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ulk3Q3U3Q1 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ulk3Q3U3Q1 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Ulk3Q3U3Q1 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ulk3Q3U3Q1 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Ulk3Q3U3Q1 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ulk3Q3U3Q1 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ulk3Q3U3Q1 Ralgps2-211ENSMUST00000190648 2498 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ulk3Q3U3Q1 Ap1g2-201ENSMUST00000036041 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ulk3Q3U3Q1 Npbwr1-201ENSMUST00000044180 3692 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ulk3Q3U3Q1 Adcyap1r1-201ENSMUST00000070736 3695 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ulk3Q3U3Q1 Trak1-213ENSMUST00000211439 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ulk3Q3U3Q1 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ulk3Q3U3Q1 Cacna1c-205ENSMUST00000112825 7577 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ulk3Q3U3Q1 Gsdmcl2-203ENSMUST00000185431 1911 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Ulk3Q3U3Q1 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Ulk3Q3U3Q1 Sgcb-201ENSMUST00000081170 3786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ulk3Q3U3Q1 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ulk3Q3U3Q1 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ulk3Q3U3Q1 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ulk3Q3U3Q1 Haus6-201ENSMUST00000070607 6158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ulk3Q3U3Q1 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ulk3Q3U3Q1 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ulk3Q3U3Q1 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ulk3Q3U3Q1 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ulk3Q3U3Q1 Cep41-203ENSMUST00000115131 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ulk3Q3U3Q1 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ulk3Q3U3Q1 Gpr179-201ENSMUST00000093942 9219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ulk3Q3U3Q1 Cyp26b1-204ENSMUST00000204146 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ulk3Q3U3Q1 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ulk3Q3U3Q1 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ulk3Q3U3Q1 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ulk3Q3U3Q1 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.7 ms