Protein–RNA interactions for Protein: Q3TWW8

Srsf6, Serine/arginine-rich splicing factor 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srsf6Q3TWW8 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Srsf6Q3TWW8 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Srsf6Q3TWW8 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Srsf6Q3TWW8 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Srsf6Q3TWW8 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Srsf6Q3TWW8 Rfc4-202ENSMUST00000115337 416 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Srsf6Q3TWW8 Gm12816-201ENSMUST00000118069 1212 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Srsf6Q3TWW8 Gm14724-201ENSMUST00000118400 537 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Srsf6Q3TWW8 Gm11451-201ENSMUST00000118946 630 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Srsf6Q3TWW8 Gm16071-201ENSMUST00000119589 793 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Srsf6Q3TWW8 Gm15725-201ENSMUST00000119947 1090 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Srsf6Q3TWW8 Gm12969-201ENSMUST00000120199 1004 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Srsf6Q3TWW8 Pcbd2-202ENSMUST00000124968 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Srsf6Q3TWW8 Pyy-202ENSMUST00000127381 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Srsf6Q3TWW8 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Srsf6Q3TWW8 AA387200-201ENSMUST00000147463 1177 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Srsf6Q3TWW8 Gm23218-201ENSMUST00000158124 276 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Srsf6Q3TWW8 Rwdd2a-202ENSMUST00000179212 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Srsf6Q3TWW8 2610316D01Rik-201ENSMUST00000181047 924 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Srsf6Q3TWW8 Gm17826-201ENSMUST00000189720 798 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Srsf6Q3TWW8 Gm2965-201ENSMUST00000198365 343 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Srsf6Q3TWW8 Gm44958-201ENSMUST00000203734 736 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Srsf6Q3TWW8 CT571245.2-201ENSMUST00000218421 305 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Srsf6Q3TWW8 AC166344.1-201ENSMUST00000223745 674 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Srsf6Q3TWW8 Pgpep1l-201ENSMUST00000032770 953 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Srsf6Q3TWW8 Mrpl41-201ENSMUST00000045604 776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Srsf6Q3TWW8 Cldn17-201ENSMUST00000069549 1172 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Srsf6Q3TWW8 Gm5879-201ENSMUST00000089501 1209 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Srsf6Q3TWW8 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Srsf6Q3TWW8 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Srsf6Q3TWW8 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Srsf6Q3TWW8 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Srsf6Q3TWW8 Tssk4-201ENSMUST00000007735 1420 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Srsf6Q3TWW8 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Srsf6Q3TWW8 Themis3-201ENSMUST00000024914 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Srsf6Q3TWW8 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Srsf6Q3TWW8 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Srsf6Q3TWW8 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Srsf6Q3TWW8 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Srsf6Q3TWW8 Gm16364-201ENSMUST00000153722 1313 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Srsf6Q3TWW8 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Srsf6Q3TWW8 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Srsf6Q3TWW8 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Srsf6Q3TWW8 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.55
Srsf6Q3TWW8 E330023G01Rik-201ENSMUST00000186387 1483 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Srsf6Q3TWW8 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Srsf6Q3TWW8 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Srsf6Q3TWW8 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Srsf6Q3TWW8 Efna1-202ENSMUST00000118587 1632 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Srsf6Q3TWW8 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Srsf6Q3TWW8 Ighv8-9-201ENSMUST00000103533 301 ntAPPRIS P1 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Srsf6Q3TWW8 Ighv8-13-201ENSMUST00000103542 303 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Srsf6Q3TWW8 Gm11949-201ENSMUST00000117640 372 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Srsf6Q3TWW8 Gm14314-201ENSMUST00000118225 1015 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Srsf6Q3TWW8 Gm13205-201ENSMUST00000123548 562 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Srsf6Q3TWW8 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Srsf6Q3TWW8 4930471C06Rik-202ENSMUST00000143070 579 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Srsf6Q3TWW8 Gm13523-201ENSMUST00000151820 488 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Srsf6Q3TWW8 Gm23119-201ENSMUST00000158610 140 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Srsf6Q3TWW8 Ighv1-48-201ENSMUST00000191795 294 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Srsf6Q3TWW8 Diablo-210ENSMUST00000200247 748 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Srsf6Q3TWW8 Mrpl23-206ENSMUST00000210662 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Srsf6Q3TWW8 AC122408.1-201ENSMUST00000218949 218 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Srsf6Q3TWW8 AC151275.1-201ENSMUST00000224870 585 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Srsf6Q3TWW8 AC156501.1-201ENSMUST00000228219 270 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Srsf6Q3TWW8 Psmg2-201ENSMUST00000025418 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Srsf6Q3TWW8 Lrrfip2-213ENSMUST00000216430 1525 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Srsf6Q3TWW8 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Srsf6Q3TWW8 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Srsf6Q3TWW8 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Srsf6Q3TWW8 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Srsf6Q3TWW8 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Srsf6Q3TWW8 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Srsf6Q3TWW8 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Srsf6Q3TWW8 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Srsf6Q3TWW8 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Srsf6Q3TWW8 A430108G06Rik-201ENSMUST00000153461 1428 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Srsf6Q3TWW8 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Srsf6Q3TWW8 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Srsf6Q3TWW8 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Srsf6Q3TWW8 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Srsf6Q3TWW8 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Srsf6Q3TWW8 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Srsf6Q3TWW8 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Srsf6Q3TWW8 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Srsf6Q3TWW8 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Srsf6Q3TWW8 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Srsf6Q3TWW8 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Srsf6Q3TWW8 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Srsf6Q3TWW8 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Srsf6Q3TWW8 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Srsf6Q3TWW8 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Srsf6Q3TWW8 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Srsf6Q3TWW8 Oxct1-205ENSMUST00000138927 1743 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Srsf6Q3TWW8 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Srsf6Q3TWW8 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Srsf6Q3TWW8 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Srsf6Q3TWW8 AC127242.1-201ENSMUST00000222861 1464 ntTSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Srsf6Q3TWW8 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Srsf6Q3TWW8 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63 ms