Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIR1

Trappc13, Trafficking protein particle complex subunit 13, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc13Q3TIR1 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Trappc13Q3TIR1 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Trappc13Q3TIR1 Rph3a-201ENSMUST00000079204 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Trappc13Q3TIR1 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Trappc13Q3TIR1 Gsdmcl2-203ENSMUST00000185431 1911 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Trappc13Q3TIR1 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Trappc13Q3TIR1 Myo7a-203ENSMUST00000107127 6806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Trappc13Q3TIR1 Myh2-203ENSMUST00000170159 6083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Trappc13Q3TIR1 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Trappc13Q3TIR1 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Trappc13Q3TIR1 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Trappc13Q3TIR1 Gm27390-201ENSMUST00000184516 176 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Trappc13Q3TIR1 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Trappc13Q3TIR1 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Trappc13Q3TIR1 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Trappc13Q3TIR1 Gatad2a-201ENSMUST00000065169 3812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Trappc13Q3TIR1 Trio-201ENSMUST00000090247 11495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Trappc13Q3TIR1 Carmil1-201ENSMUST00000072889 4988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Trappc13Q3TIR1 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Trappc13Q3TIR1 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Trappc13Q3TIR1 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Trappc13Q3TIR1 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Trappc13Q3TIR1 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Trappc13Q3TIR1 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Trappc13Q3TIR1 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Trappc13Q3TIR1 Anxa8-201ENSMUST00000022519 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Trappc13Q3TIR1 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Trappc13Q3TIR1 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Trappc13Q3TIR1 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Trappc13Q3TIR1 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Trappc13Q3TIR1 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Trappc13Q3TIR1 Nhlrc2-201ENSMUST00000071423 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Trappc13Q3TIR1 Rtl5-204ENSMUST00000188731 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Trappc13Q3TIR1 Runx1-202ENSMUST00000113956 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Trappc13Q3TIR1 Cdh7-202ENSMUST00000112701 4945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Trappc13Q3TIR1 Ltbp2-202ENSMUST00000110254 6602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Trappc13Q3TIR1 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Trappc13Q3TIR1 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Trappc13Q3TIR1 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Trappc13Q3TIR1 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Trappc13Q3TIR1 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Trappc13Q3TIR1 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Trappc13Q3TIR1 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Trappc13Q3TIR1 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Trappc13Q3TIR1 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Trappc13Q3TIR1 Rapgef2-202ENSMUST00000118340 6544 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Trappc13Q3TIR1 Dsp-201ENSMUST00000124830 9592 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Trappc13Q3TIR1 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Trappc13Q3TIR1 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Trappc13Q3TIR1 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Trappc13Q3TIR1 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Trappc13Q3TIR1 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Trappc13Q3TIR1 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Trappc13Q3TIR1 Epb41l2-207ENSMUST00000218903 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Trappc13Q3TIR1 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Trappc13Q3TIR1 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Trappc13Q3TIR1 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Trappc13Q3TIR1 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Trappc13Q3TIR1 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Trappc13Q3TIR1 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Trappc13Q3TIR1 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Trappc13Q3TIR1 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Trappc13Q3TIR1 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Trappc13Q3TIR1 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Trappc13Q3TIR1 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Trappc13Q3TIR1 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Trappc13Q3TIR1 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Trappc13Q3TIR1 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Trappc13Q3TIR1 Rai1-203ENSMUST00000102688 6921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Trappc13Q3TIR1 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Trappc13Q3TIR1 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Trappc13Q3TIR1 Aknad1-202ENSMUST00000133931 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Trappc13Q3TIR1 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Trappc13Q3TIR1 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Trappc13Q3TIR1 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Trappc13Q3TIR1 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Trappc13Q3TIR1 Kremen1-201ENSMUST00000020662 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Trappc13Q3TIR1 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Trappc13Q3TIR1 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Trappc13Q3TIR1 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Trappc13Q3TIR1 Camta1-201ENSMUST00000049790 8423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Trappc13Q3TIR1 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Trappc13Q3TIR1 Tmem181a-201ENSMUST00000088940 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Trappc13Q3TIR1 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Trappc13Q3TIR1 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Trappc13Q3TIR1 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Trappc13Q3TIR1 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Trappc13Q3TIR1 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Trappc13Q3TIR1 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Trappc13Q3TIR1 Zbtb49-201ENSMUST00000094833 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Trappc13Q3TIR1 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Trappc13Q3TIR1 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Trappc13Q3TIR1 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Trappc13Q3TIR1 Atp8a1-202ENSMUST00000072971 7154 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Trappc13Q3TIR1 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Trappc13Q3TIR1 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Trappc13Q3TIR1 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Trappc13Q3TIR1 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Trappc13Q3TIR1 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Trappc13Q3TIR1 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43 ms