Protein–RNA interactions for Protein: Q3TD16

Rubcnl, Protein RUBCNL-like, mousemouse

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Length 648 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RubcnlQ3TD16 Gm44711-201ENSMUST00000205414 1264 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
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RubcnlQ3TD16 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RubcnlQ3TD16 Dhrs4-202ENSMUST00000226168 828 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
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RubcnlQ3TD16 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RubcnlQ3TD16 Gm14340-201ENSMUST00000148700 1913 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RubcnlQ3TD16 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RubcnlQ3TD16 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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RubcnlQ3TD16 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RubcnlQ3TD16 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RubcnlQ3TD16 Gm37131-201ENSMUST00000192502 1561 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
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RubcnlQ3TD16 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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RubcnlQ3TD16 1700113H08Rik-202ENSMUST00000189456 974 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
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RubcnlQ3TD16 Psmb2-201ENSMUST00000030642 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RubcnlQ3TD16 Lrrc52-201ENSMUST00000036643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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RubcnlQ3TD16 4833422M21Rik-202ENSMUST00000181252 2410 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RubcnlQ3TD16 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RubcnlQ3TD16 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RubcnlQ3TD16 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RubcnlQ3TD16 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RubcnlQ3TD16 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
RubcnlQ3TD16 Gm18626-201ENSMUST00000221512 1409 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
RubcnlQ3TD16 Qpctl-201ENSMUST00000032566 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RubcnlQ3TD16 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RubcnlQ3TD16 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RubcnlQ3TD16 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RubcnlQ3TD16 Amz2-203ENSMUST00000103061 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RubcnlQ3TD16 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RubcnlQ3TD16 Mapk4-202ENSMUST00000159162 3514 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RubcnlQ3TD16 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms