Protein–RNA interactions for Protein: Q3TCJ8

Ccdc69, Coiled-coil domain-containing protein 69, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc69Q3TCJ8 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Ccdc69Q3TCJ8 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Ccdc69Q3TCJ8 Gm24548-201ENSMUST00000158650 108 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Ccdc69Q3TCJ8 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ccdc69Q3TCJ8 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ccdc69Q3TCJ8 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ccdc69Q3TCJ8 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ccdc69Q3TCJ8 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ccdc69Q3TCJ8 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ccdc69Q3TCJ8 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ccdc69Q3TCJ8 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ccdc69Q3TCJ8 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Ccdc69Q3TCJ8 AC154352.1-201ENSMUST00000221477 2365 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Ccdc69Q3TCJ8 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Ccdc69Q3TCJ8 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ccdc69Q3TCJ8 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ccdc69Q3TCJ8 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ccdc69Q3TCJ8 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ccdc69Q3TCJ8 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ccdc69Q3TCJ8 Eng-202ENSMUST00000113272 3021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ccdc69Q3TCJ8 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ccdc69Q3TCJ8 Ldb3-201ENSMUST00000022327 5119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ccdc69Q3TCJ8 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ccdc69Q3TCJ8 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ccdc69Q3TCJ8 Ptprt-203ENSMUST00000109443 12112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ccdc69Q3TCJ8 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ccdc69Q3TCJ8 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ccdc69Q3TCJ8 Gpc6-202ENSMUST00000088483 3488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ccdc69Q3TCJ8 Exosc10-202ENSMUST00000076022 2682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ccdc69Q3TCJ8 Cntnap1-201ENSMUST00000103109 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ccdc69Q3TCJ8 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ccdc69Q3TCJ8 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ccdc69Q3TCJ8 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ccdc69Q3TCJ8 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ccdc69Q3TCJ8 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ccdc69Q3TCJ8 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ccdc69Q3TCJ8 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ccdc69Q3TCJ8 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ccdc69Q3TCJ8 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ccdc69Q3TCJ8 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ccdc69Q3TCJ8 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ccdc69Q3TCJ8 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ccdc69Q3TCJ8 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ccdc69Q3TCJ8 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ccdc69Q3TCJ8 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ccdc69Q3TCJ8 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ccdc69Q3TCJ8 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Ccdc69Q3TCJ8 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ccdc69Q3TCJ8 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Ccdc69Q3TCJ8 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ccdc69Q3TCJ8 1500004A13Rik-208ENSMUST00000184958 823 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ccdc69Q3TCJ8 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Ccdc69Q3TCJ8 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Ccdc69Q3TCJ8 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ccdc69Q3TCJ8 Gm42067-201ENSMUST00000209642 647 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ccdc69Q3TCJ8 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ccdc69Q3TCJ8 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Ccdc69Q3TCJ8 Gm40383-201ENSMUST00000222601 610 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ccdc69Q3TCJ8 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ccdc69Q3TCJ8 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ccdc69Q3TCJ8 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ccdc69Q3TCJ8 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ccdc69Q3TCJ8 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ccdc69Q3TCJ8 Phc1-203ENSMUST00000112600 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ccdc69Q3TCJ8 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ccdc69Q3TCJ8 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ccdc69Q3TCJ8 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ccdc69Q3TCJ8 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ccdc69Q3TCJ8 Hlcs-201ENSMUST00000099512 4833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ccdc69Q3TCJ8 Adh6-ps1-201ENSMUST00000171054 2789 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ccdc69Q3TCJ8 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ccdc69Q3TCJ8 Itga2b-201ENSMUST00000103086 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ccdc69Q3TCJ8 Gm6157-201ENSMUST00000199935 1897 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Ccdc69Q3TCJ8 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ccdc69Q3TCJ8 Rbm39-201ENSMUST00000029149 2711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ccdc69Q3TCJ8 Tmem266-202ENSMUST00000085754 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ccdc69Q3TCJ8 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ccdc69Q3TCJ8 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ccdc69Q3TCJ8 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ccdc69Q3TCJ8 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ccdc69Q3TCJ8 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Ccdc69Q3TCJ8 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ccdc69Q3TCJ8 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ccdc69Q3TCJ8 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ccdc69Q3TCJ8 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ccdc69Q3TCJ8 Cadm1-203ENSMUST00000114547 4444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ccdc69Q3TCJ8 AC131586.1-201ENSMUST00000228844 2964 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Ccdc69Q3TCJ8 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ccdc69Q3TCJ8 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ccdc69Q3TCJ8 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ccdc69Q3TCJ8 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ccdc69Q3TCJ8 Gm40557-201ENSMUST00000220782 2736 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ccdc69Q3TCJ8 Abca7-201ENSMUST00000043866 6590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ccdc69Q3TCJ8 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Ccdc69Q3TCJ8 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ccdc69Q3TCJ8 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ccdc69Q3TCJ8 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ccdc69Q3TCJ8 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Ccdc69Q3TCJ8 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ccdc69Q3TCJ8 Gm20641-201ENSMUST00000176069 615 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.9 ms