Protein–RNA interactions for Protein: Q14B62

ptchd1, Patched domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 888 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ptchd1Q14B62 Gm18061-201ENSMUST00000208350 562 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
ptchd1Q14B62 Gm18063-201ENSMUST00000208529 568 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
ptchd1Q14B62 Gm18052-201ENSMUST00000208750 559 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
ptchd1Q14B62 Gm44992-206ENSMUST00000209313 1261 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
ptchd1Q14B62 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
ptchd1Q14B62 Gm8712-201ENSMUST00000221090 701 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
ptchd1Q14B62 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
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ptchd1Q14B62 Gm24136-201ENSMUST00000083374 165 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
ptchd1Q14B62 Rnu1b6-201ENSMUST00000083839 166 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
ptchd1Q14B62 Gm26110-201ENSMUST00000083971 165 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
ptchd1Q14B62 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
ptchd1Q14B62 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
ptchd1Q14B62 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
ptchd1Q14B62 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
ptchd1Q14B62 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
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ptchd1Q14B62 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
ptchd1Q14B62 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
ptchd1Q14B62 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
ptchd1Q14B62 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
ptchd1Q14B62 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
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ptchd1Q14B62 Pcnx3-202ENSMUST00000113615 7264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
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ptchd1Q14B62 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
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ptchd1Q14B62 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
ptchd1Q14B62 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
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ptchd1Q14B62 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
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ptchd1Q14B62 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
ptchd1Q14B62 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
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ptchd1Q14B62 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
ptchd1Q14B62 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
ptchd1Q14B62 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
ptchd1Q14B62 Eif4ebp2-202ENSMUST00000167087 1422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
ptchd1Q14B62 Rapgef2-201ENSMUST00000118100 6573 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
ptchd1Q14B62 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
ptchd1Q14B62 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
ptchd1Q14B62 C330007P06Rik-203ENSMUST00000115249 1145 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
ptchd1Q14B62 Gm14109-201ENSMUST00000118814 309 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
ptchd1Q14B62 Gm12012-201ENSMUST00000118857 1066 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
ptchd1Q14B62 Gm6309-201ENSMUST00000174320 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
ptchd1Q14B62 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
ptchd1Q14B62 Gm28882-201ENSMUST00000185504 314 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
ptchd1Q14B62 1700011D18Rik-201ENSMUST00000205762 277 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
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ptchd1Q14B62 Gm13097-201ENSMUST00000210722 397 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
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