Protein–RNA interactions for Protein: Q149C2

Traf3ip1, TRAF3-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 625 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf3ip1Q149C2 Gm14381-201ENSMUST00000122105 414 ntBASIC14.42□□□□□ -0.1
Traf3ip1Q149C2 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
Traf3ip1Q149C2 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
Traf3ip1Q149C2 Fam168a-210ENSMUST00000216021 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
Traf3ip1Q149C2 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Traf3ip1Q149C2 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Traf3ip1Q149C2 Abca7-203ENSMUST00000171637 6638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Traf3ip1Q149C2 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Traf3ip1Q149C2 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Traf3ip1Q149C2 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Traf3ip1Q149C2 Arhgap35-202ENSMUST00000171937 6251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
Traf3ip1Q149C2 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC14.42□□□□□ -0.1
Traf3ip1Q149C2 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Traf3ip1Q149C2 Mfsd13b-205ENSMUST00000216241 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
Traf3ip1Q149C2 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Traf3ip1Q149C2 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Traf3ip1Q149C2 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Traf3ip1Q149C2 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Traf3ip1Q149C2 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Traf3ip1Q149C2 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Traf3ip1Q149C2 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Traf3ip1Q149C2 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Traf3ip1Q149C2 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Traf3ip1Q149C2 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Traf3ip1Q149C2 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
Traf3ip1Q149C2 Gm23270-201ENSMUST00000104055 131 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
Traf3ip1Q149C2 Gm24255-201ENSMUST00000104481 128 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
Traf3ip1Q149C2 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Traf3ip1Q149C2 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Traf3ip1Q149C2 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
Traf3ip1Q149C2 Gm15547-201ENSMUST00000122152 333 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
Traf3ip1Q149C2 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Traf3ip1Q149C2 Gm16339-201ENSMUST00000160954 929 ntTSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Traf3ip1Q149C2 Olfr668-201ENSMUST00000164391 957 ntAPPRIS P1 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Traf3ip1Q149C2 Nat8f7-202ENSMUST00000179613 686 ntAPPRIS P1 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Traf3ip1Q149C2 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Traf3ip1Q149C2 Gm42937-201ENSMUST00000197360 752 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
Traf3ip1Q149C2 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Traf3ip1Q149C2 Gm39185-201ENSMUST00000212941 540 ntTSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Traf3ip1Q149C2 Ctrb1-201ENSMUST00000034435 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Traf3ip1Q149C2 Olfr667-201ENSMUST00000071362 981 ntAPPRIS P1 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Traf3ip1Q149C2 Olfr666-201ENSMUST00000081116 957 ntAPPRIS P1 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Traf3ip1Q149C2 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
Traf3ip1Q149C2 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Traf3ip1Q149C2 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Traf3ip1Q149C2 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Traf3ip1Q149C2 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Traf3ip1Q149C2 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Traf3ip1Q149C2 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Traf3ip1Q149C2 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Traf3ip1Q149C2 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Traf3ip1Q149C2 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Traf3ip1Q149C2 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Traf3ip1Q149C2 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Traf3ip1Q149C2 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Traf3ip1Q149C2 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Traf3ip1Q149C2 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Traf3ip1Q149C2 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Traf3ip1Q149C2 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Traf3ip1Q149C2 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Traf3ip1Q149C2 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Traf3ip1Q149C2 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Traf3ip1Q149C2 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Traf3ip1Q149C2 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Traf3ip1Q149C2 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Traf3ip1Q149C2 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Traf3ip1Q149C2 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Traf3ip1Q149C2 Gm11595-201ENSMUST00000107440 1200 ntAPPRIS P1 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Traf3ip1Q149C2 Gm14832-201ENSMUST00000121289 322 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
Traf3ip1Q149C2 Gm16087-201ENSMUST00000124395 964 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Traf3ip1Q149C2 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Traf3ip1Q149C2 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Traf3ip1Q149C2 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Traf3ip1Q149C2 Gm7172-201ENSMUST00000218047 1152 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
Traf3ip1Q149C2 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Traf3ip1Q149C2 AC122371.3-201ENSMUST00000223402 1061 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
Traf3ip1Q149C2 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
Traf3ip1Q149C2 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Traf3ip1Q149C2 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Traf3ip1Q149C2 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Traf3ip1Q149C2 BC027072-201ENSMUST00000057405 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Traf3ip1Q149C2 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Traf3ip1Q149C2 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Traf3ip1Q149C2 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Traf3ip1Q149C2 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Traf3ip1Q149C2 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Traf3ip1Q149C2 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Traf3ip1Q149C2 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Traf3ip1Q149C2 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Traf3ip1Q149C2 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Traf3ip1Q149C2 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
Traf3ip1Q149C2 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Traf3ip1Q149C2 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Traf3ip1Q149C2 Plce1-204ENSMUST00000182481 8357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Traf3ip1Q149C2 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Traf3ip1Q149C2 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Traf3ip1Q149C2 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Traf3ip1Q149C2 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Traf3ip1Q149C2 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Traf3ip1Q149C2 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.2 ms