Protein–RNA interactions for Protein: Q0PD08

Rab42, Ras-related protein Rab-42, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab42Q0PD08 AC129336.2-201ENSMUST00000218053 3086 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Rab42Q0PD08 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rab42Q0PD08 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rab42Q0PD08 Apold1-201ENSMUST00000167323 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rab42Q0PD08 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Rab42Q0PD08 Tmem135-202ENSMUST00000117852 2986 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rab42Q0PD08 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Rab42Q0PD08 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rab42Q0PD08 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rab42Q0PD08 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rab42Q0PD08 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rab42Q0PD08 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rab42Q0PD08 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rab42Q0PD08 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Rab42Q0PD08 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rab42Q0PD08 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rab42Q0PD08 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rab42Q0PD08 Epm2aip1-201ENSMUST00000060711 7149 ntAPPRIS P1 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rab42Q0PD08 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rab42Q0PD08 Gnas-203ENSMUST00000087876 3719 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rab42Q0PD08 Tmcc1-210ENSMUST00000204353 2851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rab42Q0PD08 Pex11g-201ENSMUST00000004686 2870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rab42Q0PD08 Entpd8-201ENSMUST00000044078 2299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rab42Q0PD08 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rab42Q0PD08 Mlc1-201ENSMUST00000042594 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rab42Q0PD08 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rab42Q0PD08 Mast4-207ENSMUST00000167058 10636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rab42Q0PD08 Tm9sf1-202ENSMUST00000120041 2164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rab42Q0PD08 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rab42Q0PD08 Neu2-206ENSMUST00000166259 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rab42Q0PD08 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rab42Q0PD08 Ces2a-201ENSMUST00000034346 1960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rab42Q0PD08 Fyb2-201ENSMUST00000106803 3136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rab42Q0PD08 Arfgap1-202ENSMUST00000108859 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rab42Q0PD08 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rab42Q0PD08 Tyk2-206ENSMUST00000216874 4828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rab42Q0PD08 Kcnb1-204ENSMUST00000207917 11153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rab42Q0PD08 Kdm2a-201ENSMUST00000047898 8578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rab42Q0PD08 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rab42Q0PD08 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rab42Q0PD08 Tmem266-202ENSMUST00000085754 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rab42Q0PD08 Jak3-202ENSMUST00000110012 3774 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rab42Q0PD08 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rab42Q0PD08 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rab42Q0PD08 Parvg-207ENSMUST00000163667 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rab42Q0PD08 Cox17-202ENSMUST00000120495 3690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rab42Q0PD08 Rps6kl1-202ENSMUST00000221972 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rab42Q0PD08 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rab42Q0PD08 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rab42Q0PD08 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rab42Q0PD08 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rab42Q0PD08 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Rab42Q0PD08 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rab42Q0PD08 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rab42Q0PD08 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rab42Q0PD08 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rab42Q0PD08 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Rab42Q0PD08 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Rab42Q0PD08 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Rab42Q0PD08 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Rab42Q0PD08 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rab42Q0PD08 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rab42Q0PD08 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rab42Q0PD08 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rab42Q0PD08 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rab42Q0PD08 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rab42Q0PD08 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rab42Q0PD08 Amer2-201ENSMUST00000022561 10506 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rab42Q0PD08 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rab42Q0PD08 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rab42Q0PD08 Gm26905-201ENSMUST00000180798 6621 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rab42Q0PD08 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rab42Q0PD08 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rab42Q0PD08 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rab42Q0PD08 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Rab42Q0PD08 Trub2-201ENSMUST00000048044 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rab42Q0PD08 Tmprss5-202ENSMUST00000165088 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rab42Q0PD08 Olfr370-203ENSMUST00000214156 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rab42Q0PD08 Reln-207ENSMUST00000161356 11699 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rab42Q0PD08 Mrrf-201ENSMUST00000028250 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rab42Q0PD08 Zeb2-201ENSMUST00000028229 5335 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rab42Q0PD08 Hmbox1-202ENSMUST00000067843 2931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rab42Q0PD08 Svopl-202ENSMUST00000096040 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rab42Q0PD08 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rab42Q0PD08 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rab42Q0PD08 Hsd3b1-201ENSMUST00000029465 1663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rab42Q0PD08 Pla2g16-202ENSMUST00000136465 3048 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rab42Q0PD08 Ints1-210ENSMUST00000200393 7070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rab42Q0PD08 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rab42Q0PD08 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rab42Q0PD08 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rab42Q0PD08 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Rab42Q0PD08 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rab42Q0PD08 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rab42Q0PD08 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Rab42Q0PD08 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rab42Q0PD08 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Rab42Q0PD08 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rab42Q0PD08 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rab42Q0PD08 Pbx1-208ENSMUST00000188912 3970 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms