Protein–RNA interactions for Protein: Q07456

Ambp, Protein AMBP, mousemouse

Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AmbpQ07456 Slc12a9-201ENSMUST00000039991 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
AmbpQ07456 Bpnt1-201ENSMUST00000027916 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
AmbpQ07456 Fcer2a-201ENSMUST00000005678 2242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
AmbpQ07456 Cyp26b1-202ENSMUST00000168003 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
AmbpQ07456 Wdr13-201ENSMUST00000033506 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
AmbpQ07456 Cyp26b1-201ENSMUST00000077705 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
AmbpQ07456 Thg1l-201ENSMUST00000011398 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
AmbpQ07456 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
AmbpQ07456 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
AmbpQ07456 Tmcc1-210ENSMUST00000204353 2851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
AmbpQ07456 Ncoa3-202ENSMUST00000109252 5757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
AmbpQ07456 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
AmbpQ07456 A830018L16Rik-202ENSMUST00000135014 6451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
AmbpQ07456 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
AmbpQ07456 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
AmbpQ07456 Nudt15-201ENSMUST00000043813 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
AmbpQ07456 Ltbp2-202ENSMUST00000110254 6602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
AmbpQ07456 Elavl2-204ENSMUST00000107110 3671 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
AmbpQ07456 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
AmbpQ07456 Acsm4-201ENSMUST00000047045 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
AmbpQ07456 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
AmbpQ07456 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
AmbpQ07456 Accs-202ENSMUST00000068513 1872 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
AmbpQ07456 Mob4-205ENSMUST00000162364 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
AmbpQ07456 Ccdc189-201ENSMUST00000072155 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
AmbpQ07456 Lrrc74b-203ENSMUST00000100123 2231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
AmbpQ07456 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
AmbpQ07456 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
AmbpQ07456 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
AmbpQ07456 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
AmbpQ07456 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
AmbpQ07456 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
AmbpQ07456 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
AmbpQ07456 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
AmbpQ07456 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
AmbpQ07456 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
AmbpQ07456 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
AmbpQ07456 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
AmbpQ07456 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
AmbpQ07456 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
AmbpQ07456 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
AmbpQ07456 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
AmbpQ07456 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
AmbpQ07456 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
AmbpQ07456 Sp6-201ENSMUST00000047997 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
AmbpQ07456 Tmcc3os-201ENSMUST00000146744 2912 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
AmbpQ07456 Ints6-202ENSMUST00000223585 10883 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
AmbpQ07456 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
AmbpQ07456 Hap1-202ENSMUST00000138603 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
AmbpQ07456 Clspn-201ENSMUST00000048391 5027 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
AmbpQ07456 Slx4-201ENSMUST00000040790 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
AmbpQ07456 Armcx3-202ENSMUST00000086880 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
AmbpQ07456 Dcun1d3-202ENSMUST00000098080 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
AmbpQ07456 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
AmbpQ07456 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
AmbpQ07456 Ces4a-201ENSMUST00000161289 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
AmbpQ07456 Gtf2ird2-201ENSMUST00000016086 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
AmbpQ07456 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
AmbpQ07456 Zbtb44-201ENSMUST00000115222 8861 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
AmbpQ07456 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
AmbpQ07456 Acad9-201ENSMUST00000011492 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
AmbpQ07456 Gm17230-201ENSMUST00000171194 3942 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
AmbpQ07456 Crispld2-202ENSMUST00000108972 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
AmbpQ07456 Mmel1-202ENSMUST00000080559 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
AmbpQ07456 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
AmbpQ07456 Arhgap24-206ENSMUST00000112854 2991 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
AmbpQ07456 Meltf-201ENSMUST00000023464 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
AmbpQ07456 Nek5-202ENSMUST00000209656 2253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
AmbpQ07456 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
AmbpQ07456 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
AmbpQ07456 Smarca1-205ENSMUST00000141084 1965 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
AmbpQ07456 Cln3-201ENSMUST00000032962 2386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
AmbpQ07456 Hspa5-201ENSMUST00000028222 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
AmbpQ07456 Gm37931-201ENSMUST00000194686 2866 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
AmbpQ07456 Cyb5r3-202ENSMUST00000162178 2547 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
AmbpQ07456 Mmp25-201ENSMUST00000024696 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
AmbpQ07456 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
AmbpQ07456 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
AmbpQ07456 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
AmbpQ07456 Gm12984-201ENSMUST00000145711 273 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
AmbpQ07456 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
AmbpQ07456 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
AmbpQ07456 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
AmbpQ07456 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
AmbpQ07456 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
AmbpQ07456 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
AmbpQ07456 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
AmbpQ07456 Fxr1-206ENSMUST00000198051 2127 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
AmbpQ07456 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
AmbpQ07456 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
AmbpQ07456 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
AmbpQ07456 Grm1-202ENSMUST00000105560 4265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
AmbpQ07456 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
AmbpQ07456 Asph-212ENSMUST00000108340 6646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
AmbpQ07456 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
AmbpQ07456 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
AmbpQ07456 Dysf-216ENSMUST00000204987 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
AmbpQ07456 Msantd1-201ENSMUST00000050535 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
AmbpQ07456 Armc3-202ENSMUST00000114640 2818 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
AmbpQ07456 Dram1-201ENSMUST00000020249 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.3 ms