Protein–RNA interactions for Protein: Q07409

Cntn3, Contactin-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,028 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntn3Q07409 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cntn3Q07409 Gm29199-201ENSMUST00000187766 775 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Cntn3Q07409 Gm13097-201ENSMUST00000210722 397 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Cntn3Q07409 CT485787.1-201ENSMUST00000225617 968 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Cntn3Q07409 Psmb2-201ENSMUST00000030642 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cntn3Q07409 Psma1-201ENSMUST00000033008 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cntn3Q07409 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cntn3Q07409 Syngr4-201ENSMUST00000039049 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cntn3Q07409 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cntn3Q07409 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cntn3Q07409 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cntn3Q07409 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cntn3Q07409 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cntn3Q07409 Add2-203ENSMUST00000203279 1454 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cntn3Q07409 Gm10782-202ENSMUST00000223775 1480 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Cntn3Q07409 Akt1-205ENSMUST00000128300 1342 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cntn3Q07409 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cntn3Q07409 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cntn3Q07409 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Cntn3Q07409 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Cntn3Q07409 4933411K16Rik-201ENSMUST00000164518 1380 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Cntn3Q07409 Hars2-201ENSMUST00000019287 2002 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Cntn3Q07409 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cntn3Q07409 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cntn3Q07409 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cntn3Q07409 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cntn3Q07409 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Cntn3Q07409 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cntn3Q07409 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cntn3Q07409 Inca1-203ENSMUST00000108542 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cntn3Q07409 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cntn3Q07409 C330007P06Rik-203ENSMUST00000115249 1145 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cntn3Q07409 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cntn3Q07409 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cntn3Q07409 Gm17028-201ENSMUST00000170026 704 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cntn3Q07409 Gm13381-202ENSMUST00000177012 640 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cntn3Q07409 Gm44992-206ENSMUST00000209313 1261 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cntn3Q07409 AC159747.1-201ENSMUST00000219903 265 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Cntn3Q07409 CT573034.1-201ENSMUST00000222983 313 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Cntn3Q07409 AC113031.8-201ENSMUST00000227856 631 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Cntn3Q07409 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cntn3Q07409 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cntn3Q07409 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cntn3Q07409 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cntn3Q07409 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Cntn3Q07409 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cntn3Q07409 Pomgnt1-205ENSMUST00000121052 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cntn3Q07409 Zcwpw2-202ENSMUST00000187329 1469 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cntn3Q07409 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cntn3Q07409 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cntn3Q07409 Tsta3-201ENSMUST00000023231 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cntn3Q07409 Nupl1-206ENSMUST00000225111 2936 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Cntn3Q07409 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cntn3Q07409 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cntn3Q07409 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cntn3Q07409 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cntn3Q07409 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cntn3Q07409 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cntn3Q07409 Ibsp-201ENSMUST00000031246 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cntn3Q07409 Hnrnpr-201ENSMUST00000084219 2647 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cntn3Q07409 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cntn3Q07409 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cntn3Q07409 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cntn3Q07409 Gm19817-201ENSMUST00000199764 2132 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Cntn3Q07409 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cntn3Q07409 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cntn3Q07409 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cntn3Q07409 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cntn3Q07409 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cntn3Q07409 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cntn3Q07409 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cntn3Q07409 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cntn3Q07409 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cntn3Q07409 Gm12012-201ENSMUST00000118857 1066 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Cntn3Q07409 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cntn3Q07409 G630018N14Rik-201ENSMUST00000135656 1231 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cntn3Q07409 Gm15276-201ENSMUST00000145953 498 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Cntn3Q07409 Gm11210-201ENSMUST00000150203 422 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cntn3Q07409 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cntn3Q07409 Gm27046-201ENSMUST00000182160 463 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Cntn3Q07409 2610016A17Rik-202ENSMUST00000186768 689 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Cntn3Q07409 Gm38317-201ENSMUST00000195564 343 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Cntn3Q07409 Gm32850-202ENSMUST00000209149 732 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cntn3Q07409 Erg28-201ENSMUST00000021676 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cntn3Q07409 Dnajc17-201ENSMUST00000038439 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cntn3Q07409 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cntn3Q07409 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cntn3Q07409 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cntn3Q07409 Spata33-202ENSMUST00000212161 2941 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cntn3Q07409 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cntn3Q07409 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cntn3Q07409 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cntn3Q07409 Tmem19-206ENSMUST00000218731 1346 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cntn3Q07409 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cntn3Q07409 Rbm8a-202ENSMUST00000196456 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cntn3Q07409 Gm7993-201ENSMUST00000200970 1384 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Cntn3Q07409 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Cntn3Q07409 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cntn3Q07409 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cntn3Q07409 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.7 ms