Protein–RNA interactions for Protein: Q06138

Cab39, Calcium-binding protein 39, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cab39Q06138 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Cab39Q06138 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Cab39Q06138 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Cab39Q06138 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Cab39Q06138 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Cab39Q06138 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Cab39Q06138 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Cab39Q06138 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Cab39Q06138 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Cab39Q06138 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Cab39Q06138 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Cab39Q06138 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Cab39Q06138 Zfp629-202ENSMUST00000084564 5829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Cab39Q06138 Zscan12-203ENSMUST00000225545 4405 ntAPPRIS P1 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Cab39Q06138 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Cab39Q06138 Pars2-202ENSMUST00000106781 3046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Cab39Q06138 Fli1-201ENSMUST00000016231 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Cab39Q06138 Stx1b-201ENSMUST00000106267 4536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Cab39Q06138 Myo18a-222ENSMUST00000168348 6582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Cab39Q06138 Ehd3-201ENSMUST00000024860 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Cab39Q06138 6030458C11Rik-201ENSMUST00000057256 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Cab39Q06138 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Cab39Q06138 Atic-201ENSMUST00000027384 2845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Cab39Q06138 Rnf123-218ENSMUST00000178267 4309 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Cab39Q06138 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Cab39Q06138 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Cab39Q06138 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Cab39Q06138 Hdac6-201ENSMUST00000033501 4142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Cab39Q06138 Lats2-207ENSMUST00000173990 3834 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Cab39Q06138 Anxa7-202ENSMUST00000100844 2904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Cab39Q06138 Esco2-201ENSMUST00000022613 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Cab39Q06138 Aknad1-202ENSMUST00000133931 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Cab39Q06138 Klhl22-208ENSMUST00000165790 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Cab39Q06138 Poll-201ENSMUST00000026239 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Cab39Q06138 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Cab39Q06138 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Cab39Q06138 Ap1b1-203ENSMUST00000109897 3942 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Cab39Q06138 Fyttd1-211ENSMUST00000171325 4295 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Cab39Q06138 Sh3pxd2a-201ENSMUST00000081619 10464 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cab39Q06138 Pi16-202ENSMUST00000114701 2756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cab39Q06138 Dbx2-201ENSMUST00000054244 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cab39Q06138 Myh8-201ENSMUST00000019625 6149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cab39Q06138 Prkch-201ENSMUST00000021527 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cab39Q06138 Arhgap1-202ENSMUST00000111329 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cab39Q06138 Pafah2-201ENSMUST00000105869 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cab39Q06138 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cab39Q06138 Vsx2-201ENSMUST00000021665 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cab39Q06138 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cab39Q06138 Pcif1-201ENSMUST00000041643 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cab39Q06138 Epb41l1-201ENSMUST00000029155 6220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cab39Q06138 Smarca2-209ENSMUST00000176030 5862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cab39Q06138 AC160410.1-201ENSMUST00000219298 1972 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Cab39Q06138 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cab39Q06138 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cab39Q06138 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Cab39Q06138 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cab39Q06138 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cab39Q06138 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Cab39Q06138 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Cab39Q06138 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cab39Q06138 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Cab39Q06138 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Cab39Q06138 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cab39Q06138 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cab39Q06138 Ank1-204ENSMUST00000117270 5652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cab39Q06138 Plekhn1-202ENSMUST00000105571 2004 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cab39Q06138 Gm43622-201ENSMUST00000200140 2019 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Cab39Q06138 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cab39Q06138 Arhgef3-204ENSMUST00000225949 3198 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Cab39Q06138 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cab39Q06138 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Cab39Q06138 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cab39Q06138 Pou2f1-209ENSMUST00000160908 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cab39Q06138 Tle1-201ENSMUST00000030095 2569 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cab39Q06138 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Cab39Q06138 AC107453.4-201ENSMUST00000227068 1817 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Cab39Q06138 Raph1-204ENSMUST00000140485 10024 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cab39Q06138 Ctr9-201ENSMUST00000005749 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cab39Q06138 Kcnab2-201ENSMUST00000030768 3533 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cab39Q06138 Cldn12-201ENSMUST00000060947 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cab39Q06138 Gatsl2-201ENSMUST00000016088 7367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cab39Q06138 Lax1-201ENSMUST00000169295 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cab39Q06138 Zfp263-201ENSMUST00000023176 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cab39Q06138 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Cab39Q06138 Amotl1-201ENSMUST00000013220 8957 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cab39Q06138 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cab39Q06138 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cab39Q06138 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cab39Q06138 Pcgf2-207ENSMUST00000179765 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cab39Q06138 Pdhx-201ENSMUST00000011058 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cab39Q06138 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cab39Q06138 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cab39Q06138 Neat1-202ENSMUST00000174287 3004 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cab39Q06138 Tmod2-202ENSMUST00000098552 9871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cab39Q06138 Mirg-208ENSMUST00000182499 3187 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cab39Q06138 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cab39Q06138 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cab39Q06138 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cab39Q06138 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cab39Q06138 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.9 ms