Protein–RNA interactions for Protein: Q05020

Apoc2, Apolipoprotein C-II, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoc2Q05020 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Apoc2Q05020 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Apoc2Q05020 Gm14760-201ENSMUST00000121831 999 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Apoc2Q05020 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Apoc2Q05020 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Apoc2Q05020 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Apoc2Q05020 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Apoc2Q05020 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Apoc2Q05020 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Apoc2Q05020 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Apoc2Q05020 Gm42599-201ENSMUST00000201308 469 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Apoc2Q05020 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Apoc2Q05020 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Apoc2Q05020 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Apoc2Q05020 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Apoc2Q05020 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Apoc2Q05020 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Apoc2Q05020 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Apoc2Q05020 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Apoc2Q05020 Exoc3l4-209ENSMUST00000222897 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Apoc2Q05020 Smim1-208ENSMUST00000143047 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Apoc2Q05020 Ctif-201ENSMUST00000165559 6173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Apoc2Q05020 Tex9-209ENSMUST00000184125 2794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Apoc2Q05020 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Apoc2Q05020 Clec16a-201ENSMUST00000038145 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Apoc2Q05020 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Apoc2Q05020 Ncoa6-203ENSMUST00000109670 7101 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Apoc2Q05020 Lmbr1-201ENSMUST00000055195 4926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Apoc2Q05020 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Apoc2Q05020 Clec10a-209ENSMUST00000178945 2332 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Apoc2Q05020 Cabp5-201ENSMUST00000005791 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Apoc2Q05020 Gm15541-201ENSMUST00000147449 2713 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Apoc2Q05020 Shtn1-201ENSMUST00000047511 4081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Apoc2Q05020 Mapk4-202ENSMUST00000159162 3514 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Apoc2Q05020 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Apoc2Q05020 Zfp362-202ENSMUST00000106072 2812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Apoc2Q05020 Pink1-202ENSMUST00000105816 1465 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Apoc2Q05020 Gtf2e1-201ENSMUST00000023525 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Apoc2Q05020 Aldh3a2-202ENSMUST00000074127 3091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Apoc2Q05020 Arsa-202ENSMUST00000165199 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Apoc2Q05020 Slc37a1-202ENSMUST00000171233 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Apoc2Q05020 Gm2916-202ENSMUST00000181779 1702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Apoc2Q05020 Gm9008-201ENSMUST00000097218 2353 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Apoc2Q05020 Bckdk-201ENSMUST00000071056 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Apoc2Q05020 Plod3-201ENSMUST00000004968 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Apoc2Q05020 Cd109-201ENSMUST00000093812 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Apoc2Q05020 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Apoc2Q05020 Wdr59-202ENSMUST00000038193 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Apoc2Q05020 P2rx7-203ENSMUST00000100737 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Apoc2Q05020 Sfxn3-201ENSMUST00000062213 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Apoc2Q05020 Il22ra1-201ENSMUST00000102546 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Apoc2Q05020 Spata7-203ENSMUST00000101146 1913 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Apoc2Q05020 AC126262.1-201ENSMUST00000221802 1904 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Apoc2Q05020 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Apoc2Q05020 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Apoc2Q05020 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Apoc2Q05020 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Apoc2Q05020 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Apoc2Q05020 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Apoc2Q05020 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Apoc2Q05020 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Apoc2Q05020 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Apoc2Q05020 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Apoc2Q05020 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Apoc2Q05020 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Apoc2Q05020 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Apoc2Q05020 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Apoc2Q05020 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Apoc2Q05020 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Apoc2Q05020 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Apoc2Q05020 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Apoc2Q05020 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Apoc2Q05020 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Apoc2Q05020 Arhgef9-206ENSMUST00000113884 3784 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Apoc2Q05020 Papss1-201ENSMUST00000029666 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Apoc2Q05020 Setd1a-201ENSMUST00000047075 6487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Apoc2Q05020 Onecut1-201ENSMUST00000056006 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Apoc2Q05020 Gm15587-201ENSMUST00000146326 3493 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Apoc2Q05020 Nrros-208ENSMUST00000143682 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Apoc2Q05020 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Apoc2Q05020 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Apoc2Q05020 Wars-201ENSMUST00000109848 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Apoc2Q05020 Pde9a-201ENSMUST00000047168 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Apoc2Q05020 Pbrm1-208ENSMUST00000112098 6566 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Apoc2Q05020 Dip2a-201ENSMUST00000036033 6322 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Apoc2Q05020 Fosb-203ENSMUST00000207716 3546 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Apoc2Q05020 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Apoc2Q05020 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Apoc2Q05020 4833439L19Rik-208ENSMUST00000153065 2502 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Apoc2Q05020 Abat-201ENSMUST00000065987 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Apoc2Q05020 Sik2-205ENSMUST00000176663 4107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Apoc2Q05020 Gnb1l-204ENSMUST00000115601 3507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Apoc2Q05020 Emilin1-201ENSMUST00000031055 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Apoc2Q05020 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Apoc2Q05020 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Apoc2Q05020 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Apoc2Q05020 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Apoc2Q05020 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Apoc2Q05020 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Apoc2Q05020 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms