Protein–RNA interactions for Protein: Q03142

Fgfr4, Fibroblast growth factor receptor 4, mousemouse

Predictions only

Length 799 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fgfr4Q03142 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Fgfr4Q03142 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Fgfr4Q03142 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Fgfr4Q03142 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Fgfr4Q03142 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Fgfr4Q03142 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Fgfr4Q03142 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Fgfr4Q03142 Gm23270-201ENSMUST00000104055 131 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Fgfr4Q03142 Inca1-203ENSMUST00000108542 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Fgfr4Q03142 Rbm3-ps-201ENSMUST00000121422 465 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Fgfr4Q03142 Gm45692-201ENSMUST00000131138 557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Fgfr4Q03142 Gm12199-201ENSMUST00000137567 517 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Fgfr4Q03142 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Fgfr4Q03142 Olfr668-201ENSMUST00000164391 957 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Fgfr4Q03142 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Fgfr4Q03142 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Fgfr4Q03142 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Fgfr4Q03142 AC159747.1-201ENSMUST00000219903 265 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Fgfr4Q03142 AC122371.3-201ENSMUST00000223402 1061 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Fgfr4Q03142 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Fgfr4Q03142 Ccdc70-202ENSMUST00000070649 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Fgfr4Q03142 Olfr667-201ENSMUST00000071362 981 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Fgfr4Q03142 Olfr171-201ENSMUST00000079891 945 ntAPPRIS P2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Fgfr4Q03142 Olfr666-201ENSMUST00000081116 957 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Fgfr4Q03142 Mirlet7c-2-201ENSMUST00000083674 95 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Fgfr4Q03142 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Fgfr4Q03142 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Fgfr4Q03142 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Fgfr4Q03142 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Fgfr4Q03142 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Fgfr4Q03142 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Fgfr4Q03142 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Fgfr4Q03142 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Fgfr4Q03142 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Fgfr4Q03142 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Fgfr4Q03142 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Fgfr4Q03142 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Fgfr4Q03142 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Fgfr4Q03142 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Fgfr4Q03142 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Fgfr4Q03142 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Fgfr4Q03142 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Fgfr4Q03142 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Fgfr4Q03142 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Fgfr4Q03142 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Fgfr4Q03142 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Fgfr4Q03142 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Fgfr4Q03142 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Fgfr4Q03142 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Fgfr4Q03142 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Fgfr4Q03142 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Fgfr4Q03142 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Fgfr4Q03142 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Fgfr4Q03142 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Fgfr4Q03142 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Fgfr4Q03142 Gm15236-201ENSMUST00000117309 379 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Fgfr4Q03142 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Fgfr4Q03142 Gm16339-201ENSMUST00000160954 929 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Fgfr4Q03142 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Fgfr4Q03142 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Fgfr4Q03142 6530403H02Rik-204ENSMUST00000183276 659 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Fgfr4Q03142 Gm8712-201ENSMUST00000221090 701 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Fgfr4Q03142 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Fgfr4Q03142 Gm3402-201ENSMUST00000036715 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Fgfr4Q03142 Olfr368-201ENSMUST00000053990 985 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Fgfr4Q03142 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Fgfr4Q03142 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Fgfr4Q03142 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Fgfr4Q03142 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Fgfr4Q03142 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Fgfr4Q03142 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Fgfr4Q03142 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Fgfr4Q03142 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Fgfr4Q03142 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Fgfr4Q03142 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Fgfr4Q03142 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Fgfr4Q03142 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Fgfr4Q03142 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Fgfr4Q03142 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Fgfr4Q03142 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Fgfr4Q03142 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Fgfr4Q03142 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Fgfr4Q03142 Crym-201ENSMUST00000033198 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Fgfr4Q03142 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Fgfr4Q03142 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Fgfr4Q03142 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Fgfr4Q03142 Gm24255-201ENSMUST00000104481 128 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Fgfr4Q03142 Gm15808-201ENSMUST00000119046 604 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Fgfr4Q03142 Gm14597-202ENSMUST00000129769 715 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Fgfr4Q03142 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Fgfr4Q03142 Gm11961-202ENSMUST00000141157 760 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Fgfr4Q03142 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Fgfr4Q03142 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Fgfr4Q03142 Stard10-207ENSMUST00000173270 670 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Fgfr4Q03142 Gm37259-201ENSMUST00000193903 849 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Fgfr4Q03142 Gm31256-201ENSMUST00000194705 506 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Fgfr4Q03142 Gm33474-201ENSMUST00000199486 1231 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Fgfr4Q03142 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Fgfr4Q03142 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Fgfr4Q03142 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.4 ms