Protein–RNA interactions for Protein: Q00724

Rbp4, Retinol-binding protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbp4Q00724 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rbp4Q00724 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rbp4Q00724 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rbp4Q00724 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rbp4Q00724 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rbp4Q00724 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rbp4Q00724 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rbp4Q00724 Kank4-201ENSMUST00000102790 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
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Rbp4Q00724 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rbp4Q00724 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
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Rbp4Q00724 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rbp4Q00724 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rbp4Q00724 Pcdh15-238ENSMUST00000193739 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rbp4Q00724 Dpysl5-201ENSMUST00000088081 5022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rbp4Q00724 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rbp4Q00724 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
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Rbp4Q00724 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rbp4Q00724 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rbp4Q00724 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
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Rbp4Q00724 Rph3a-201ENSMUST00000079204 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rbp4Q00724 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
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Rbp4Q00724 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rbp4Q00724 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rbp4Q00724 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
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Rbp4Q00724 Mecom-202ENSMUST00000108270 5692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rbp4Q00724 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rbp4Q00724 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rbp4Q00724 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rbp4Q00724 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rbp4Q00724 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
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Rbp4Q00724 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rbp4Q00724 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
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Rbp4Q00724 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rbp4Q00724 Togaram1-207ENSMUST00000223166 6386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rbp4Q00724 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Rbp4Q00724 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rbp4Q00724 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rbp4Q00724 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rbp4Q00724 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rbp4Q00724 Myo16-201ENSMUST00000042103 6725 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rbp4Q00724 D130043K22Rik-201ENSMUST00000006893 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rbp4Q00724 Stat3-202ENSMUST00000103114 6042 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rbp4Q00724 Exd1-201ENSMUST00000060009 6042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rbp4Q00724 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rbp4Q00724 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rbp4Q00724 Tmx3-201ENSMUST00000025515 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rbp4Q00724 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Rbp4Q00724 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rbp4Q00724 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rbp4Q00724 Agrn-202ENSMUST00000105574 7193 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms