Protein–RNA interactions for Protein: Q00690

Sele, E-selectin, mousemouse

Predictions only

Length 612 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SeleQ00690 Cadm1-203ENSMUST00000114547 4444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SeleQ00690 Gfod2-201ENSMUST00000013294 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SeleQ00690 Dennd4c-202ENSMUST00000082026 7940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
SeleQ00690 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
SeleQ00690 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SeleQ00690 Sept8-204ENSMUST00000121334 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
SeleQ00690 Gemin4-201ENSMUST00000102500 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SeleQ00690 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SeleQ00690 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SeleQ00690 Trim56-201ENSMUST00000054384 9279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SeleQ00690 Zfp108-203ENSMUST00000206777 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SeleQ00690 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
SeleQ00690 Gm22323-201ENSMUST00000103832 109 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
SeleQ00690 Gm24255-201ENSMUST00000104481 128 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
SeleQ00690 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SeleQ00690 Pigp-205ENSMUST00000113917 805 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SeleQ00690 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
SeleQ00690 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SeleQ00690 Gm2310-201ENSMUST00000179217 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
SeleQ00690 Anapc16-205ENSMUST00000182912 566 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
SeleQ00690 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
SeleQ00690 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SeleQ00690 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SeleQ00690 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SeleQ00690 Asb8-201ENSMUST00000059112 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SeleQ00690 Krtap19-9a-201ENSMUST00000062005 168 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
SeleQ00690 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SeleQ00690 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
SeleQ00690 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SeleQ00690 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
SeleQ00690 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SeleQ00690 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
SeleQ00690 Lypd6-202ENSMUST00000112712 3495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
SeleQ00690 Mrvi1-201ENSMUST00000005751 6198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SeleQ00690 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
SeleQ00690 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SeleQ00690 Flrt1-201ENSMUST00000113383 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SeleQ00690 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SeleQ00690 Erich1-201ENSMUST00000110813 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SeleQ00690 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
SeleQ00690 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
SeleQ00690 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
SeleQ00690 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
SeleQ00690 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
SeleQ00690 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
SeleQ00690 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
SeleQ00690 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
SeleQ00690 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
SeleQ00690 Speg-201ENSMUST00000087122 10801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
SeleQ00690 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
SeleQ00690 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
SeleQ00690 Gm45833-201ENSMUST00000211931 2730 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
SeleQ00690 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
SeleQ00690 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
SeleQ00690 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
SeleQ00690 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
SeleQ00690 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
SeleQ00690 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
SeleQ00690 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
SeleQ00690 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
SeleQ00690 S100a14-202ENSMUST00000167598 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
SeleQ00690 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
SeleQ00690 2010320M18Rik-201ENSMUST00000191396 1009 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
SeleQ00690 1700045I11Rik-201ENSMUST00000194752 493 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
SeleQ00690 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
SeleQ00690 Gm22058-201ENSMUST00000083393 310 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
SeleQ00690 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
SeleQ00690 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
SeleQ00690 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
SeleQ00690 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
SeleQ00690 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
SeleQ00690 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
SeleQ00690 Pitpnm3-202ENSMUST00000108508 6450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
SeleQ00690 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
SeleQ00690 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
SeleQ00690 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
SeleQ00690 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
SeleQ00690 Ubxn10-201ENSMUST00000105809 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
SeleQ00690 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
SeleQ00690 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
SeleQ00690 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
SeleQ00690 Rasgrp4-214ENSMUST00000205027 2717 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
SeleQ00690 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
SeleQ00690 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
SeleQ00690 Sema4a-215ENSMUST00000169222 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
SeleQ00690 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
SeleQ00690 4930520O04Rik-202ENSMUST00000131898 2660 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
SeleQ00690 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
SeleQ00690 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
SeleQ00690 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
SeleQ00690 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
SeleQ00690 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
SeleQ00690 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
SeleQ00690 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
SeleQ00690 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
SeleQ00690 Apc2-201ENSMUST00000020349 9074 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
SeleQ00690 Pygo1-201ENSMUST00000038489 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
SeleQ00690 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
SeleQ00690 Adam19-201ENSMUST00000011400 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
SeleQ00690 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.2 ms