Protein–RNA interactions for Protein: P97769

Cited1, Cbp/p300-interacting transactivator 1, mousemouse

Predictions only

Length 203 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cited1P97769 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Cited1P97769 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
Cited1P97769 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Cited1P97769 Kif1a-201ENSMUST00000086819 5097 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Cited1P97769 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Cited1P97769 Hist1h2be-201ENSMUST00000051091 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Cited1P97769 Smndc1-201ENSMUST00000025997 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Cited1P97769 4933413J09Rik-202ENSMUST00000059648 3387 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Cited1P97769 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
Cited1P97769 9330199G10Rik-202ENSMUST00000221607 1728 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Cited1P97769 Loxhd1-202ENSMUST00000096547 6595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Cited1P97769 Abl2-202ENSMUST00000166172 10151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Cited1P97769 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Cited1P97769 Gm12799-201ENSMUST00000118151 2560 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
Cited1P97769 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Cited1P97769 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Cited1P97769 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Cited1P97769 D930048N14Rik-202ENSMUST00000117859 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Cited1P97769 Sell-201ENSMUST00000027871 2199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Cited1P97769 Adamts10-201ENSMUST00000087623 4043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Cited1P97769 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Cited1P97769 Zfp956-201ENSMUST00000101445 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Cited1P97769 Capn3-204ENSMUST00000110716 2752 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.88
Cited1P97769 Lipg-201ENSMUST00000066532 3787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Cited1P97769 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Cited1P97769 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Cited1P97769 Tmem74bos-202ENSMUST00000149319 2090 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Cited1P97769 Gm16702-201ENSMUST00000181180 2384 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Cited1P97769 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Cited1P97769 Slc7a1-201ENSMUST00000048116 7179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Cited1P97769 Ablim2-204ENSMUST00000114204 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.88
Cited1P97769 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Cited1P97769 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Cited1P97769 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Cited1P97769 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Cited1P97769 Ces2d-ps-201ENSMUST00000043209 1656 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Cited1P97769 4930594M22Rik-202ENSMUST00000161599 3595 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Cited1P97769 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Cited1P97769 Dcun1d2-204ENSMUST00000110840 2853 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Cited1P97769 Vmn1r193-202ENSMUST00000227457 6429 ntAPPRIS P1 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Cited1P97769 Nfkbiz-202ENSMUST00000096026 4067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Cited1P97769 Ogfod1-202ENSMUST00000093301 5141 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Cited1P97769 Rab3gap2-201ENSMUST00000069652 7052 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Cited1P97769 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Cited1P97769 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Cited1P97769 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Cited1P97769 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Cited1P97769 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Cited1P97769 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Cited1P97769 Aknad1-202ENSMUST00000133931 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Cited1P97769 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Cited1P97769 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Cited1P97769 Sox5os1-201ENSMUST00000156994 1585 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Cited1P97769 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Cited1P97769 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Cited1P97769 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Cited1P97769 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Cited1P97769 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Cited1P97769 Cd2bp2-203ENSMUST00000205316 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Cited1P97769 Zfp109-202ENSMUST00000206362 2932 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Cited1P97769 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Cited1P97769 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Cited1P97769 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Cited1P97769 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Cited1P97769 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Cited1P97769 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Cited1P97769 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Cited1P97769 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Cited1P97769 Gjc1-202ENSMUST00000092567 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Cited1P97769 Dctn1-203ENSMUST00000113913 4163 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Cited1P97769 Eng-201ENSMUST00000009705 3422 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Cited1P97769 Rpap2-205ENSMUST00000112655 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Cited1P97769 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Cited1P97769 Cyyr1-201ENSMUST00000114174 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Cited1P97769 Ghsr-201ENSMUST00000057186 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Cited1P97769 Cplx3-201ENSMUST00000045068 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Cited1P97769 Sf3b5-201ENSMUST00000105139 3841 ntAPPRIS P1 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Cited1P97769 Synpo2l-203ENSMUST00000119483 3696 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Cited1P97769 Gm45161-201ENSMUST00000207316 2263 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Cited1P97769 Rcan2-201ENSMUST00000044792 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Cited1P97769 Txlng-201ENSMUST00000041370 3862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Cited1P97769 Tdrd9-201ENSMUST00000079009 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Cited1P97769 Iqgap3-201ENSMUST00000071812 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Cited1P97769 Pcdhgb4-202ENSMUST00000195363 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Cited1P97769 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Cited1P97769 6430562O15Rik-201ENSMUST00000180491 2488 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Cited1P97769 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Cited1P97769 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Cited1P97769 Igf2bp3-201ENSMUST00000031838 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Cited1P97769 Gm2238-201ENSMUST00000192074 3669 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Cited1P97769 Svopl-202ENSMUST00000096040 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Cited1P97769 Flad1-204ENSMUST00000129308 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Cited1P97769 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Cited1P97769 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Cited1P97769 Capn15-204ENSMUST00000212149 4555 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Cited1P97769 Tshz3-201ENSMUST00000021641 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Cited1P97769 Odf2l-204ENSMUST00000106192 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Cited1P97769 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Cited1P97769 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Cited1P97769 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms