Protein–RNA interactions for Protein: P97309

Mesp1, Mesoderm posterior protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mesp1P97309 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Mesp1P97309 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Mesp1P97309 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Mesp1P97309 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Mesp1P97309 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Mesp1P97309 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Mesp1P97309 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Mesp1P97309 2810006K23Rik-201ENSMUST00000077376 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Mesp1P97309 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Mesp1P97309 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Mesp1P97309 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Mesp1P97309 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Mesp1P97309 Gm13786-201ENSMUST00000122371 333 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Mesp1P97309 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Mesp1P97309 Cd180-203ENSMUST00000170878 842 ntTSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Mesp1P97309 Cd180-205ENSMUST00000172138 518 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Mesp1P97309 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Mesp1P97309 Gm44066-201ENSMUST00000203263 519 ntTSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Mesp1P97309 Gm6334-201ENSMUST00000207083 228 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Mesp1P97309 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Mesp1P97309 Kdelr1-203ENSMUST00000211234 832 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Mesp1P97309 Gm18935-201ENSMUST00000212692 664 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Mesp1P97309 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Mesp1P97309 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Mesp1P97309 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Mesp1P97309 Gm5773-201ENSMUST00000090853 1143 ntAPPRIS P1 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Mesp1P97309 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Mesp1P97309 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Mesp1P97309 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Mesp1P97309 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Mesp1P97309 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Mesp1P97309 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Mesp1P97309 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Mesp1P97309 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Mesp1P97309 2900041M22Rik-201ENSMUST00000155384 1784 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Mesp1P97309 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Mesp1P97309 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.9□□□□□ -0.67
Mesp1P97309 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.67
Mesp1P97309 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Mesp1P97309 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Mesp1P97309 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Mesp1P97309 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Mesp1P97309 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.67
Mesp1P97309 St6galnac6-201ENSMUST00000072111 2277 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Mesp1P97309 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Mesp1P97309 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Mesp1P97309 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Mesp1P97309 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Mesp1P97309 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Mesp1P97309 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Mesp1P97309 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Mesp1P97309 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Mesp1P97309 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Mesp1P97309 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Mesp1P97309 Pxn-214ENSMUST00000212819 1689 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Mesp1P97309 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Mesp1P97309 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Mesp1P97309 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Mesp1P97309 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Mesp1P97309 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Mesp1P97309 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Mesp1P97309 Gm9544-201ENSMUST00000223349 2482 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Mesp1P97309 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Mesp1P97309 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Mesp1P97309 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Mesp1P97309 Gm15968-201ENSMUST00000119342 1168 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Mesp1P97309 1700066O22Rik-203ENSMUST00000150994 961 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Mesp1P97309 Mospd4-201ENSMUST00000180618 576 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Mesp1P97309 Gm2164-201ENSMUST00000184062 424 ntTSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Mesp1P97309 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Mesp1P97309 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Mesp1P97309 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Mesp1P97309 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Mesp1P97309 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Mesp1P97309 AC132384.14-201ENSMUST00000219346 1147 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Mesp1P97309 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Mesp1P97309 Olfr569-201ENSMUST00000078191 945 ntAPPRIS P1 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Mesp1P97309 Olfr582-201ENSMUST00000098212 960 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Mesp1P97309 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Mesp1P97309 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Mesp1P97309 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Mesp1P97309 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Mesp1P97309 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Mesp1P97309 Spata7-203ENSMUST00000101146 1913 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Mesp1P97309 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Mesp1P97309 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Mesp1P97309 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Mesp1P97309 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Mesp1P97309 Grm5-201ENSMUST00000107263 3516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Mesp1P97309 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Mesp1P97309 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Mesp1P97309 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Mesp1P97309 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Mesp1P97309 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Mesp1P97309 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Mesp1P97309 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Mesp1P97309 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Mesp1P97309 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Mesp1P97309 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Mesp1P97309 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms