Protein–RNA interactions for Protein: P83917

Cbx1, Chromobox protein homolog 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx1P83917 Mier1-204ENSMUST00000106857 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cbx1P83917 Ufd1-202ENSMUST00000115578 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cbx1P83917 Ccdc89-201ENSMUST00000061391 2093 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cbx1P83917 Gimap8-202ENSMUST00000203083 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cbx1P83917 Fbrs-201ENSMUST00000048896 2650 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cbx1P83917 Wt1os-203ENSMUST00000172701 2960 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cbx1P83917 Ttpa-201ENSMUST00000098244 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cbx1P83917 C2cd5-204ENSMUST00000203187 3494 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cbx1P83917 Ctnnal1-201ENSMUST00000045142 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cbx1P83917 Arhgap20-204ENSMUST00000130405 3881 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cbx1P83917 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cbx1P83917 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cbx1P83917 Hnrnpa2b1-203ENSMUST00000114459 1728 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cbx1P83917 Emp1-201ENSMUST00000032330 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cbx1P83917 Galnt10-201ENSMUST00000066987 4715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cbx1P83917 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cbx1P83917 Gm45161-201ENSMUST00000207316 2263 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Cbx1P83917 Gm37954-201ENSMUST00000195400 2071 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Cbx1P83917 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cbx1P83917 Pknox1-206ENSMUST00000176701 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cbx1P83917 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cbx1P83917 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Cbx1P83917 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cbx1P83917 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Cbx1P83917 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cbx1P83917 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cbx1P83917 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Cbx1P83917 Elfn1-201ENSMUST00000050519 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cbx1P83917 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cbx1P83917 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cbx1P83917 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cbx1P83917 Oxct1-201ENSMUST00000110690 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cbx1P83917 Synpr-201ENSMUST00000070323 2541 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cbx1P83917 Flnc-201ENSMUST00000065090 9038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cbx1P83917 Ttc30a2-201ENSMUST00000099995 2431 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cbx1P83917 Pyurf-201ENSMUST00000053386 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cbx1P83917 Zfp46-201ENSMUST00000069195 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cbx1P83917 Morf4l2-204ENSMUST00000113097 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cbx1P83917 Yeats2-202ENSMUST00000115560 6116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cbx1P83917 Plscr3-203ENSMUST00000108633 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cbx1P83917 Slc25a44-203ENSMUST00000193433 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cbx1P83917 Acrbp-202ENSMUST00000088294 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cbx1P83917 Abhd4-201ENSMUST00000041197 2401 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cbx1P83917 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cbx1P83917 Fkbp15-204ENSMUST00000107461 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cbx1P83917 C730027H18Rik-201ENSMUST00000218381 2300 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cbx1P83917 Plscr1-201ENSMUST00000093801 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cbx1P83917 1700025G04Rik-201ENSMUST00000044581 9559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cbx1P83917 Polr3e-201ENSMUST00000033173 4194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cbx1P83917 Cldn19-202ENSMUST00000094823 4168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cbx1P83917 Myo18a-222ENSMUST00000168348 6582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cbx1P83917 Zfp36-201ENSMUST00000051241 2790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cbx1P83917 Aldh3b2-201ENSMUST00000143380 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cbx1P83917 Phactr1-201ENSMUST00000066928 2013 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cbx1P83917 Coch-201ENSMUST00000085412 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cbx1P83917 Zfp109-202ENSMUST00000206362 2932 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cbx1P83917 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cbx1P83917 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Cbx1P83917 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cbx1P83917 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cbx1P83917 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cbx1P83917 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cbx1P83917 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Cbx1P83917 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cbx1P83917 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Cbx1P83917 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cbx1P83917 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cbx1P83917 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cbx1P83917 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cbx1P83917 Btg2-201ENSMUST00000020692 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cbx1P83917 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cbx1P83917 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cbx1P83917 CT868720.1-201ENSMUST00000223069 2544 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Cbx1P83917 Cryz-201ENSMUST00000029850 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cbx1P83917 Psd2-203ENSMUST00000175734 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cbx1P83917 Igfbp5-201ENSMUST00000027377 6006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cbx1P83917 4732490B19Rik-201ENSMUST00000130373 2446 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cbx1P83917 Pou2f1-202ENSMUST00000069609 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cbx1P83917 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cbx1P83917 Pcdhga10-201ENSMUST00000193404 4732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cbx1P83917 A530013C23Rik-202ENSMUST00000141923 3489 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cbx1P83917 Mapk8ip3-204ENSMUST00000117509 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cbx1P83917 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cbx1P83917 Tmem92-201ENSMUST00000100554 2043 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cbx1P83917 Accs-201ENSMUST00000041593 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cbx1P83917 Dip2c-201ENSMUST00000166299 4822 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cbx1P83917 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cbx1P83917 Rpap2-202ENSMUST00000112650 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cbx1P83917 Rbm10-205ENSMUST00000115375 3698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cbx1P83917 Gm26737-201ENSMUST00000181106 2151 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cbx1P83917 Cyb5b-201ENSMUST00000034400 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cbx1P83917 Agrn-202ENSMUST00000105574 7193 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cbx1P83917 Fam228a-201ENSMUST00000111154 3004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cbx1P83917 Kcnk18-201ENSMUST00000065204 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cbx1P83917 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cbx1P83917 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cbx1P83917 H2-Q1-202ENSMUST00000105041 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cbx1P83917 Tcp10a-202ENSMUST00000128533 2589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cbx1P83917 Ino80c-203ENSMUST00000141489 2207 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cbx1P83917 Sorbs3-203ENSMUST00000227653 3061 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.8 ms