Protein–RNA interactions for Protein: P70398

Usp9x, Probable ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase FAF-X, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp9xP70398 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Usp9xP70398 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Usp9xP70398 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Usp9xP70398 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Usp9xP70398 Hnrnpa2b1-202ENSMUST00000090002 1662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Usp9xP70398 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Usp9xP70398 Gm15003-201ENSMUST00000118884 446 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Usp9xP70398 Gm16001-201ENSMUST00000127989 875 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Usp9xP70398 2810403D21Rik-208ENSMUST00000153212 1005 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Usp9xP70398 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Usp9xP70398 Gm23045-201ENSMUST00000175041 96 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Usp9xP70398 AC136376.2-201ENSMUST00000228819 490 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Usp9xP70398 Taar9-201ENSMUST00000041180 1047 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Usp9xP70398 Cox17-201ENSMUST00000050273 444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Usp9xP70398 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Usp9xP70398 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Usp9xP70398 Gatad2a-201ENSMUST00000065169 3812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Usp9xP70398 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Usp9xP70398 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Usp9xP70398 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Usp9xP70398 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Usp9xP70398 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Usp9xP70398 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Usp9xP70398 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Usp9xP70398 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Usp9xP70398 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Usp9xP70398 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Usp9xP70398 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Usp9xP70398 Rtbdn-202ENSMUST00000109740 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Usp9xP70398 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Usp9xP70398 Rtn2-202ENSMUST00000108468 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Usp9xP70398 Gm13916-201ENSMUST00000117368 628 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Usp9xP70398 Gm12856-201ENSMUST00000119471 1293 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Usp9xP70398 Hspb9-202ENSMUST00000169833 726 ntAPPRIS P2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Usp9xP70398 Olfr431-ps1-201ENSMUST00000192435 544 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Usp9xP70398 Fkbp6-204ENSMUST00000201791 1297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Usp9xP70398 Gm10318-202ENSMUST00000217996 639 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Usp9xP70398 CT571245.2-201ENSMUST00000218421 305 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Usp9xP70398 Gm46336-201ENSMUST00000221894 279 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Usp9xP70398 AC129308.3-201ENSMUST00000225652 524 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Usp9xP70398 Pgpep1l-201ENSMUST00000032770 953 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Usp9xP70398 Gm6685-201ENSMUST00000042595 764 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Usp9xP70398 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Usp9xP70398 Gm36855-203ENSMUST00000216660 1406 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Usp9xP70398 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Usp9xP70398 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Usp9xP70398 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Usp9xP70398 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Usp9xP70398 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Usp9xP70398 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Usp9xP70398 Gm14193-201ENSMUST00000105067 153 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Usp9xP70398 Gm11956-201ENSMUST00000119525 512 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Usp9xP70398 Eef1akmt2-202ENSMUST00000120425 573 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Usp9xP70398 Tbata-203ENSMUST00000121297 1000 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Usp9xP70398 Prss36-208ENSMUST00000156152 1132 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Usp9xP70398 Fxyd5-209ENSMUST00000162087 762 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Usp9xP70398 Eef1b2-209ENSMUST00000188524 681 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Usp9xP70398 Gm29019-202ENSMUST00000188623 564 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Usp9xP70398 Tex29-205ENSMUST00000209692 884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Usp9xP70398 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Usp9xP70398 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Usp9xP70398 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Usp9xP70398 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Usp9xP70398 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Usp9xP70398 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Usp9xP70398 Npy5r-203ENSMUST00000212563 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Usp9xP70398 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Usp9xP70398 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Usp9xP70398 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Usp9xP70398 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Usp9xP70398 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Usp9xP70398 Slc25a21-205ENSMUST00000217690 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Usp9xP70398 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Usp9xP70398 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Usp9xP70398 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Usp9xP70398 Ypel4-201ENSMUST00000090729 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Usp9xP70398 Gm13267-201ENSMUST00000142787 698 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Usp9xP70398 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Usp9xP70398 Rps12-208ENSMUST00000220070 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Usp9xP70398 Gm9508-201ENSMUST00000220084 693 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Usp9xP70398 AC156568.1-201ENSMUST00000223018 712 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Usp9xP70398 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Usp9xP70398 Mgp-201ENSMUST00000032342 617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Usp9xP70398 Olfr284-201ENSMUST00000063289 918 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Usp9xP70398 Tmem25-202ENSMUST00000114705 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Usp9xP70398 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Usp9xP70398 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Usp9xP70398 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Usp9xP70398 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Usp9xP70398 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC10.27□□□□□ -0.76
Usp9xP70398 Gpr45-201ENSMUST00000114761 1546 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Usp9xP70398 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Usp9xP70398 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Usp9xP70398 2900011O08Rik-202ENSMUST00000118412 954 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Usp9xP70398 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Usp9xP70398 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Usp9xP70398 Smim20-201ENSMUST00000147148 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Usp9xP70398 Chn2-212ENSMUST00000204115 783 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Usp9xP70398 Nps-202ENSMUST00000210697 1082 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Usp9xP70398 Gm45527-201ENSMUST00000211052 774 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42 ms