Protein–RNA interactions for Protein: P70232

Chl1, Neural cell adhesion molecule L1-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chl1P70232 Gm45278-201ENSMUST00000209650 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Chl1P70232 Celf2-205ENSMUST00000114927 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Chl1P70232 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Chl1P70232 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Chl1P70232 Zfp286-211ENSMUST00000207597 1668 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Chl1P70232 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Chl1P70232 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Chl1P70232 Gm37131-201ENSMUST00000192502 1561 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Chl1P70232 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chl1P70232 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chl1P70232 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chl1P70232 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chl1P70232 Ccr6-203ENSMUST00000166348 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chl1P70232 Crry-ps-201ENSMUST00000079090 1309 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Chl1P70232 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chl1P70232 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chl1P70232 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chl1P70232 Gm5053-201ENSMUST00000208361 1678 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Chl1P70232 Rpl15-203ENSMUST00000100799 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chl1P70232 Gm12216-202ENSMUST00000120776 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chl1P70232 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chl1P70232 4930483J18Rik-202ENSMUST00000138715 1093 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chl1P70232 Gm20537-202ENSMUST00000173131 889 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chl1P70232 Caly-204ENSMUST00000211283 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chl1P70232 AC110091.1-201ENSMUST00000216004 691 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chl1P70232 Rpl18-201ENSMUST00000072503 679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chl1P70232 Cbx1-202ENSMUST00000079702 912 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chl1P70232 Mtus2-202ENSMUST00000085554 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chl1P70232 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chl1P70232 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chl1P70232 Atg4c-203ENSMUST00000180278 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chl1P70232 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chl1P70232 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chl1P70232 Cd72-204ENSMUST00000107925 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chl1P70232 A430108G06Rik-201ENSMUST00000153461 1428 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chl1P70232 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chl1P70232 1700003D09Rik-201ENSMUST00000141929 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chl1P70232 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chl1P70232 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chl1P70232 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chl1P70232 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chl1P70232 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chl1P70232 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chl1P70232 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chl1P70232 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chl1P70232 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chl1P70232 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chl1P70232 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chl1P70232 Celf2-225ENSMUST00000183091 2177 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chl1P70232 Lhfpl1-201ENSMUST00000040084 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chl1P70232 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chl1P70232 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chl1P70232 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chl1P70232 4930554G24Rik-201ENSMUST00000126260 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chl1P70232 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chl1P70232 Itk-202ENSMUST00000101306 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chl1P70232 Cstl1-202ENSMUST00000109954 454 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chl1P70232 Gm13165-201ENSMUST00000152923 383 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chl1P70232 Acat3-202ENSMUST00000160378 987 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chl1P70232 Atp10d-206ENSMUST00000169617 761 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chl1P70232 Pfn1-201ENSMUST00000018437 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chl1P70232 Gm29199-201ENSMUST00000187766 775 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Chl1P70232 Gm4959-201ENSMUST00000197271 1044 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Chl1P70232 4930504D19Rik-201ENSMUST00000204799 349 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chl1P70232 Gm44711-201ENSMUST00000205414 1264 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Chl1P70232 Aprt-ps-201ENSMUST00000212311 505 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Chl1P70232 Erg28-201ENSMUST00000021676 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chl1P70232 Csnk2b-201ENSMUST00000025246 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chl1P70232 Ifi27-205ENSMUST00000085065 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chl1P70232 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chl1P70232 Gm7224-201ENSMUST00000121359 2066 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Chl1P70232 Adgrv1-206ENSMUST00000128120 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chl1P70232 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Chl1P70232 Gm14132-201ENSMUST00000117188 1719 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Chl1P70232 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chl1P70232 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chl1P70232 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chl1P70232 Abo-202ENSMUST00000114045 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chl1P70232 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chl1P70232 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chl1P70232 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chl1P70232 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chl1P70232 Gm13187-202ENSMUST00000133873 1321 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chl1P70232 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chl1P70232 N4bp2l1-201ENSMUST00000016279 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chl1P70232 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chl1P70232 Dram1-201ENSMUST00000020249 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chl1P70232 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chl1P70232 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chl1P70232 Pole-203ENSMUST00000112482 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chl1P70232 Gm6890-201ENSMUST00000114117 776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chl1P70232 Gm12997-201ENSMUST00000120207 640 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Chl1P70232 Gm7722-201ENSMUST00000120646 741 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Chl1P70232 Gm14017-201ENSMUST00000121934 386 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Chl1P70232 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chl1P70232 Retn-202ENSMUST00000169234 1139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chl1P70232 Pycr1-206ENSMUST00000170556 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chl1P70232 2810405F17Rik-201ENSMUST00000189334 1117 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Chl1P70232 CT573034.1-201ENSMUST00000222983 313 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Chl1P70232 Dph6-201ENSMUST00000028640 2632 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.4 ms