Protein–RNA interactions for Protein: P63139

Nfyb, Nuclear transcription factor Y subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 207 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfybP63139 Zfp335-201ENSMUST00000041361 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
NfybP63139 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
NfybP63139 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
NfybP63139 Eif4enif1-204ENSMUST00000120721 2952 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
NfybP63139 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
NfybP63139 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
NfybP63139 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
NfybP63139 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
NfybP63139 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
NfybP63139 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
NfybP63139 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
NfybP63139 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
NfybP63139 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
NfybP63139 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
NfybP63139 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
NfybP63139 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
NfybP63139 Fads6-201ENSMUST00000056153 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
NfybP63139 Mzf1-201ENSMUST00000069289 3597 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
NfybP63139 Pcgf2-207ENSMUST00000179765 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
NfybP63139 Hbs1l-201ENSMUST00000020153 2793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
NfybP63139 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
NfybP63139 Tollip-201ENSMUST00000001950 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
NfybP63139 Fosb-201ENSMUST00000003640 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
NfybP63139 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
NfybP63139 Tnfrsf13b-201ENSMUST00000010286 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
NfybP63139 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
NfybP63139 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
NfybP63139 Lats2-207ENSMUST00000173990 3834 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
NfybP63139 Tcf7l2-207ENSMUST00000111653 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
NfybP63139 Tspyl4-201ENSMUST00000047935 3879 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
NfybP63139 Gm43622-201ENSMUST00000200140 2019 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
NfybP63139 Gm44913-201ENSMUST00000208060 2990 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
NfybP63139 Als2cl-206ENSMUST00000155014 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
NfybP63139 Adgrl3-214ENSMUST00000120445 5230 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
NfybP63139 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
NfybP63139 Ccdc154-203ENSMUST00000182621 2402 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
NfybP63139 Fcho1-201ENSMUST00000093444 3073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
NfybP63139 Adgrl3-210ENSMUST00000119788 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
NfybP63139 Gsdme-205ENSMUST00000170142 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
NfybP63139 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
NfybP63139 Gm15411-201ENSMUST00000133243 3488 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
NfybP63139 Per1-202ENSMUST00000101004 3507 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
NfybP63139 Bbs1-201ENSMUST00000053506 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
NfybP63139 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
NfybP63139 Clasp1-216ENSMUST00000189738 5373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
NfybP63139 Tcf4-250ENSMUST00000202458 2610 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
NfybP63139 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
NfybP63139 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
NfybP63139 Ldhd-201ENSMUST00000070004 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
NfybP63139 Pars2-202ENSMUST00000106781 3046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
NfybP63139 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
NfybP63139 Sema3g-201ENSMUST00000090180 4540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
NfybP63139 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
NfybP63139 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
NfybP63139 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
NfybP63139 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
NfybP63139 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
NfybP63139 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
NfybP63139 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
NfybP63139 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
NfybP63139 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
NfybP63139 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
NfybP63139 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
NfybP63139 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
NfybP63139 Socs6-201ENSMUST00000070116 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
NfybP63139 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
NfybP63139 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
NfybP63139 Myh6-201ENSMUST00000081857 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
NfybP63139 Armt1-203ENSMUST00000118544 5044 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
NfybP63139 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
NfybP63139 Ahsa2-202ENSMUST00000109539 3583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
NfybP63139 Gm36957-201ENSMUST00000192982 2824 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
NfybP63139 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
NfybP63139 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
NfybP63139 Abcc10-204ENSMUST00000167360 4866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
NfybP63139 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
NfybP63139 AC157950.1-201ENSMUST00000217561 2168 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
NfybP63139 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
NfybP63139 Anks1b-224ENSMUST00000182960 3397 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
NfybP63139 Dlec1-206ENSMUST00000140326 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
NfybP63139 Dcaf11-203ENSMUST00000117701 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
NfybP63139 Dnaic2-202ENSMUST00000092469 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
NfybP63139 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
NfybP63139 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
NfybP63139 Bahcc1-201ENSMUST00000044985 10726 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
NfybP63139 Slc26a2-202ENSMUST00000146409 7814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
NfybP63139 Pcdhb21-201ENSMUST00000061405 4705 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
NfybP63139 Cryz-208ENSMUST00000192462 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
NfybP63139 Arhgef28-201ENSMUST00000109426 5387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
NfybP63139 Cdc14a-201ENSMUST00000090464 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
NfybP63139 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
NfybP63139 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
NfybP63139 Sel1l-210ENSMUST00000178462 6150 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
NfybP63139 Gm15987-201ENSMUST00000141700 2231 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
NfybP63139 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
NfybP63139 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
NfybP63139 Bmp5-201ENSMUST00000012281 3822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
NfybP63139 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
NfybP63139 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
NfybP63139 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.6 ms