Protein–RNA interactions for Protein: P62823

Rab3c, Ras-related protein Rab-3C, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab3cP62823 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Rab3cP62823 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rab3cP62823 Prkcsh-202ENSMUST00000115331 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rab3cP62823 Dlgap1-210ENSMUST00000146730 3936 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rab3cP62823 Myo16-201ENSMUST00000042103 6725 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rab3cP62823 Sgcb-201ENSMUST00000081170 3786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rab3cP62823 Tat-201ENSMUST00000001720 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rab3cP62823 Rims1-206ENSMUST00000115273 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rab3cP62823 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rab3cP62823 Taf9b-201ENSMUST00000055497 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rab3cP62823 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rab3cP62823 Mfap3l-203ENSMUST00000161421 4142 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rab3cP62823 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rab3cP62823 Qpctl-201ENSMUST00000032566 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rab3cP62823 Tmem200a-203ENSMUST00000218232 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rab3cP62823 Hdac5-204ENSMUST00000107152 3788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rab3cP62823 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rab3cP62823 Fen1-202ENSMUST00000116542 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rab3cP62823 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rab3cP62823 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rab3cP62823 Paip2b-201ENSMUST00000058383 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rab3cP62823 Tbx4-203ENSMUST00000108047 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rab3cP62823 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rab3cP62823 Slc44a2-201ENSMUST00000034697 3456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rab3cP62823 Acsm4-201ENSMUST00000047045 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rab3cP62823 Cdc14a-201ENSMUST00000090464 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rab3cP62823 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rab3cP62823 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rab3cP62823 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rab3cP62823 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rab3cP62823 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rab3cP62823 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rab3cP62823 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rab3cP62823 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Rab3cP62823 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rab3cP62823 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Rab3cP62823 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rab3cP62823 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rab3cP62823 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rab3cP62823 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rab3cP62823 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rab3cP62823 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rab3cP62823 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rab3cP62823 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rab3cP62823 Ppp2r1b-202ENSMUST00000114437 3430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rab3cP62823 Alg12-201ENSMUST00000043087 1793 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rab3cP62823 1700082M22Rik-201ENSMUST00000067136 2022 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rab3cP62823 Fmo2-202ENSMUST00000111510 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rab3cP62823 Slc39a14-202ENSMUST00000068044 4926 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rab3cP62823 Gm10419-202ENSMUST00000196693 2530 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rab3cP62823 Maats1-201ENSMUST00000023501 2750 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rab3cP62823 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rab3cP62823 Hnrnpf-201ENSMUST00000035493 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rab3cP62823 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rab3cP62823 Traf7-201ENSMUST00000070777 2384 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rab3cP62823 Calcoco1-204ENSMUST00000171838 2968 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rab3cP62823 Terb1-201ENSMUST00000064576 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rab3cP62823 Galc-201ENSMUST00000021390 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rab3cP62823 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rab3cP62823 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rab3cP62823 Tanc1-201ENSMUST00000037526 7873 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rab3cP62823 Olfr1419-203ENSMUST00000217617 3087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rab3cP62823 Mtmr4-201ENSMUST00000092802 5525 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rab3cP62823 Tacc2-201ENSMUST00000033141 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rab3cP62823 Asap1-203ENSMUST00000110115 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rab3cP62823 Gm12766-201ENSMUST00000140298 1823 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rab3cP62823 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rab3cP62823 Zfp809-206ENSMUST00000215902 1800 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rab3cP62823 Nacc2-202ENSMUST00000114159 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rab3cP62823 Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rab3cP62823 AC091764.2-201ENSMUST00000218190 1590 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rab3cP62823 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rab3cP62823 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rab3cP62823 Gm15411-201ENSMUST00000133243 3488 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rab3cP62823 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rab3cP62823 Clasp1-216ENSMUST00000189738 5373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rab3cP62823 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rab3cP62823 Tiparp-201ENSMUST00000047906 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rab3cP62823 Armcx3-202ENSMUST00000086880 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rab3cP62823 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rab3cP62823 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rab3cP62823 Oraov1-204ENSMUST00000128057 2231 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rab3cP62823 BC067074-203ENSMUST00000136755 8274 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rab3cP62823 Knop1-202ENSMUST00000063607 4884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rab3cP62823 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Rab3cP62823 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Rab3cP62823 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rab3cP62823 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rab3cP62823 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rab3cP62823 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Rab3cP62823 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rab3cP62823 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rab3cP62823 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Rab3cP62823 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rab3cP62823 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rab3cP62823 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rab3cP62823 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rab3cP62823 Ercc4-201ENSMUST00000023206 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rab3cP62823 Gm28036-202ENSMUST00000132494 5505 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rab3cP62823 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.1 ms