Protein–RNA interactions for Protein: P62069

Usp46, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 46, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp46P62069 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Usp46P62069 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Usp46P62069 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Usp46P62069 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Usp46P62069 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Usp46P62069 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Usp46P62069 Gm3476-201ENSMUST00000112742 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Usp46P62069 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Usp46P62069 Rbm3-ps-201ENSMUST00000121422 465 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Usp46P62069 Rbm48-202ENSMUST00000121877 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Usp46P62069 Acyp1-204ENSMUST00000121930 634 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Usp46P62069 Vmn1r185-201ENSMUST00000171039 1144 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Usp46P62069 Gm20482-202ENSMUST00000174729 825 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Usp46P62069 Gm5597-201ENSMUST00000182353 1193 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Usp46P62069 Gm27320-201ENSMUST00000184892 109 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Usp46P62069 Gm5441-202ENSMUST00000190132 449 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Usp46P62069 Gm42838-201ENSMUST00000196503 439 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Usp46P62069 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Usp46P62069 Ldha-213ENSMUST00000210631 685 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Usp46P62069 Gm45881-201ENSMUST00000210659 517 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Usp46P62069 Gm6082-201ENSMUST00000215204 454 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Usp46P62069 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Usp46P62069 mt-Nd3-201ENSMUST00000082411 348 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Usp46P62069 Gm16519-201ENSMUST00000092011 489 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Usp46P62069 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Usp46P62069 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Usp46P62069 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Usp46P62069 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Usp46P62069 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Usp46P62069 Etfrf1-207ENSMUST00000111726 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Usp46P62069 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Usp46P62069 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Usp46P62069 Gm45053-201ENSMUST00000206112 2499 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Usp46P62069 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Usp46P62069 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Usp46P62069 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Usp46P62069 AI464131-201ENSMUST00000054920 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Usp46P62069 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Usp46P62069 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Usp46P62069 Arid5a-203ENSMUST00000115031 3002 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Usp46P62069 Ccdc190-201ENSMUST00000094348 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Usp46P62069 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Usp46P62069 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Usp46P62069 Gm12749-201ENSMUST00000122138 1159 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Usp46P62069 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Usp46P62069 Gm31831-201ENSMUST00000196240 684 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Usp46P62069 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Usp46P62069 AC153361.2-203ENSMUST00000218083 661 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Usp46P62069 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Usp46P62069 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Usp46P62069 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Usp46P62069 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Usp46P62069 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Usp46P62069 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Usp46P62069 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Usp46P62069 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Usp46P62069 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Usp46P62069 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Usp46P62069 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Usp46P62069 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Usp46P62069 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Usp46P62069 AC164426.2-201ENSMUST00000225993 2492 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Usp46P62069 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Usp46P62069 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Usp46P62069 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Usp46P62069 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Usp46P62069 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Usp46P62069 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Usp46P62069 Gm23270-201ENSMUST00000104055 131 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Usp46P62069 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Usp46P62069 Gm15808-201ENSMUST00000119046 604 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
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Usp46P62069 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Usp46P62069 Gm17586-201ENSMUST00000181502 908 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Usp46P62069 Gm26973-201ENSMUST00000182105 696 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
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Usp46P62069 Gm34816-201ENSMUST00000193363 502 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Usp46P62069 6330419E04Rik-201ENSMUST00000203087 1263 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Usp46P62069 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Usp46P62069 AC131777.1-201ENSMUST00000214749 387 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Usp46P62069 AC158605.1-202ENSMUST00000217860 540 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Usp46P62069 Gm7745-202ENSMUST00000222914 567 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Usp46P62069 AC166095.1-201ENSMUST00000223731 1241 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Usp46P62069 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Usp46P62069 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Usp46P62069 Olfr1447-201ENSMUST00000071484 1113 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Usp46P62069 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Usp46P62069 Olfr1446-201ENSMUST00000081236 1044 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Usp46P62069 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Usp46P62069 Gm43980-201ENSMUST00000204899 1612 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Usp46P62069 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Usp46P62069 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Usp46P62069 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Usp46P62069 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Usp46P62069 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
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