Protein–RNA interactions for Protein: P56400

Gp1bb, Platelet glycoprotein Ib beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gp1bbP56400 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gp1bbP56400 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gp1bbP56400 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gp1bbP56400 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gp1bbP56400 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gp1bbP56400 Cstl1-201ENSMUST00000109952 629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gp1bbP56400 Zfp36l1-ps-201ENSMUST00000118349 899 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Gp1bbP56400 Gm12380-201ENSMUST00000119012 544 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Gp1bbP56400 Gm14760-201ENSMUST00000121831 999 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Gp1bbP56400 Odf4-202ENSMUST00000125134 646 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gp1bbP56400 Dnajb6-202ENSMUST00000012734 1024 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gp1bbP56400 Gnpda2-207ENSMUST00000173927 1011 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gp1bbP56400 Hax1-205ENSMUST00000197767 1092 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gp1bbP56400 Washc3-201ENSMUST00000020248 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gp1bbP56400 Gm19208-201ENSMUST00000213861 912 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Gp1bbP56400 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Gp1bbP56400 Ift43-205ENSMUST00000222821 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gp1bbP56400 Elovl1-202ENSMUST00000067896 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gp1bbP56400 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gp1bbP56400 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gp1bbP56400 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gp1bbP56400 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gp1bbP56400 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gp1bbP56400 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gp1bbP56400 Aire-202ENSMUST00000105395 1630 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gp1bbP56400 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gp1bbP56400 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gp1bbP56400 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gp1bbP56400 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gp1bbP56400 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gp1bbP56400 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gp1bbP56400 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gp1bbP56400 Adgrv1-206ENSMUST00000128120 1591 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gp1bbP56400 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gp1bbP56400 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gp1bbP56400 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gp1bbP56400 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gp1bbP56400 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gp1bbP56400 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gp1bbP56400 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gp1bbP56400 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gp1bbP56400 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gp1bbP56400 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Gp1bbP56400 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gp1bbP56400 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gp1bbP56400 Cyp4f16-208ENSMUST00000169591 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gp1bbP56400 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gp1bbP56400 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gp1bbP56400 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gp1bbP56400 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gp1bbP56400 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gp1bbP56400 Dixdc1-204ENSMUST00000118707 989 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gp1bbP56400 Gm13563-201ENSMUST00000125518 643 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gp1bbP56400 Gm23119-201ENSMUST00000158610 140 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Gp1bbP56400 Gm20426-201ENSMUST00000173657 440 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Gp1bbP56400 Gm19187-201ENSMUST00000206781 892 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Gp1bbP56400 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gp1bbP56400 Tm2d3-201ENSMUST00000032726 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gp1bbP56400 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gp1bbP56400 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gp1bbP56400 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gp1bbP56400 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gp1bbP56400 Cd72-204ENSMUST00000107925 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gp1bbP56400 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gp1bbP56400 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gp1bbP56400 Art3-201ENSMUST00000113083 1561 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gp1bbP56400 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gp1bbP56400 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gp1bbP56400 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gp1bbP56400 Gm13142-201ENSMUST00000117213 1453 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Gp1bbP56400 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gp1bbP56400 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gp1bbP56400 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gp1bbP56400 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gp1bbP56400 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gp1bbP56400 A630076J17Rik-201ENSMUST00000179399 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gp1bbP56400 Gm45342-201ENSMUST00000210903 1363 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Gp1bbP56400 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gp1bbP56400 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gp1bbP56400 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Gp1bbP56400 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gp1bbP56400 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gp1bbP56400 Ighv5-2-201ENSMUST00000103442 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gp1bbP56400 Pax5-204ENSMUST00000107826 1228 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gp1bbP56400 Gm14051-201ENSMUST00000131603 377 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gp1bbP56400 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gp1bbP56400 AC107638.1-201ENSMUST00000213690 1061 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Gp1bbP56400 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gp1bbP56400 Olfr398-201ENSMUST00000053874 945 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gp1bbP56400 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gp1bbP56400 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gp1bbP56400 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gp1bbP56400 Det1-202ENSMUST00000107431 1439 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gp1bbP56400 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gp1bbP56400 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gp1bbP56400 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gp1bbP56400 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gp1bbP56400 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gp1bbP56400 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gp1bbP56400 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms