Protein–RNA interactions for Protein: P55194

Sh3bp1, SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

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Length 680 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1P55194 Trpc6-201ENSMUST00000050433 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Sh3bp1P55194 Kctd10-202ENSMUST00000102581 3103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Sh3bp1P55194 Sez6l-206ENSMUST00000212758 2664 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Sh3bp1P55194 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Sh3bp1P55194 Mir124a-1hg-201ENSMUST00000180610 4103 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Sh3bp1P55194 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Sh3bp1P55194 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Sh3bp1P55194 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Sh3bp1P55194 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Sh3bp1P55194 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Sh3bp1P55194 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Sh3bp1P55194 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Sh3bp1P55194 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Sh3bp1P55194 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Sh3bp1P55194 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Sh3bp1P55194 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Sh3bp1P55194 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Sh3bp1P55194 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Sh3bp1P55194 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Sh3bp1P55194 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Sh3bp1P55194 Helq-201ENSMUST00000044684 3689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Sh3bp1P55194 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Sh3bp1P55194 Cbx7-201ENSMUST00000089293 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Sh3bp1P55194 L3mbtl2-208ENSMUST00000174229 2578 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Sh3bp1P55194 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Sh3bp1P55194 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Sh3bp1P55194 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Sh3bp1P55194 Lrp8-203ENSMUST00000106732 2648 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Sh3bp1P55194 Aknad1-202ENSMUST00000133931 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Sh3bp1P55194 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Sh3bp1P55194 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Sh3bp1P55194 Etv3-205ENSMUST00000170036 5127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Sh3bp1P55194 Timm22-201ENSMUST00000021203 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Sh3bp1P55194 Pcdhgb2-202ENSMUST00000195112 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Sh3bp1P55194 Ttc25-201ENSMUST00000006976 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Sh3bp1P55194 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Sh3bp1P55194 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Sh3bp1P55194 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Sh3bp1P55194 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Sh3bp1P55194 Gm16083-201ENSMUST00000125681 2547 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Sh3bp1P55194 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Sh3bp1P55194 Fbxo18-201ENSMUST00000071564 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Sh3bp1P55194 Olfr658-202ENSMUST00000210641 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Sh3bp1P55194 Olfr658-201ENSMUST00000089296 2912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Sh3bp1P55194 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Sh3bp1P55194 Avpr2-202ENSMUST00000101470 2787 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Sh3bp1P55194 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Sh3bp1P55194 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Sh3bp1P55194 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Sh3bp1P55194 Robo4-201ENSMUST00000102895 3226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Sh3bp1P55194 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Sh3bp1P55194 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Sh3bp1P55194 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Sh3bp1P55194 Olfr222-203ENSMUST00000215339 2166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Sh3bp1P55194 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Sh3bp1P55194 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Sh3bp1P55194 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Sh3bp1P55194 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Sh3bp1P55194 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Sh3bp1P55194 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Sh3bp1P55194 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Sh3bp1P55194 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Sh3bp1P55194 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Sh3bp1P55194 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Sh3bp1P55194 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Sh3bp1P55194 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Sh3bp1P55194 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Sh3bp1P55194 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Sh3bp1P55194 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Sh3bp1P55194 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Sh3bp1P55194 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Sh3bp1P55194 AC154639.1-201ENSMUST00000224393 2849 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Sh3bp1P55194 Fosb-201ENSMUST00000003640 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Sh3bp1P55194 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Sh3bp1P55194 Ngfr-201ENSMUST00000000122 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Sh3bp1P55194 Itgb4-204ENSMUST00000106460 5919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Sh3bp1P55194 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Sh3bp1P55194 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Sh3bp1P55194 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Sh3bp1P55194 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Sh3bp1P55194 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.19
Sh3bp1P55194 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Sh3bp1P55194 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Sh3bp1P55194 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Sh3bp1P55194 Galr1-201ENSMUST00000065224 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Sh3bp1P55194 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Sh3bp1P55194 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Sh3bp1P55194 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Sh3bp1P55194 Carmil1-201ENSMUST00000072889 4988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Sh3bp1P55194 Mrgprd-201ENSMUST00000062163 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Sh3bp1P55194 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Sh3bp1P55194 Slc37a1-202ENSMUST00000171233 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Sh3bp1P55194 Hdac7-201ENSMUST00000079838 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Sh3bp1P55194 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Sh3bp1P55194 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Sh3bp1P55194 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Sh3bp1P55194 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Sh3bp1P55194 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Sh3bp1P55194 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Sh3bp1P55194 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
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