Protein–RNA interactions for Protein: P55066

Ncan, Neurocan core protein, mousemouse

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Length 1,268 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NcanP55066 Fkbp6-204ENSMUST00000201791 1297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
NcanP55066 Gm18706-201ENSMUST00000210053 1066 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
NcanP55066 Gm9508-201ENSMUST00000220084 693 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
NcanP55066 AC134860.1-201ENSMUST00000224867 660 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
NcanP55066 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
NcanP55066 Zfp68-201ENSMUST00000063262 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
NcanP55066 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
NcanP55066 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
NcanP55066 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
NcanP55066 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
NcanP55066 Tmem237-205ENSMUST00000186794 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
NcanP55066 Lonp2-207ENSMUST00000163987 1556 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
NcanP55066 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
NcanP55066 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
NcanP55066 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
NcanP55066 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
NcanP55066 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
NcanP55066 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
NcanP55066 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
NcanP55066 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
NcanP55066 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
NcanP55066 Tcn2-201ENSMUST00000020710 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
NcanP55066 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
NcanP55066 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
NcanP55066 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
NcanP55066 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
NcanP55066 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
NcanP55066 Slc6a18-204ENSMUST00000220650 1728 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
NcanP55066 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
NcanP55066 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
NcanP55066 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
NcanP55066 Tcea3-201ENSMUST00000102533 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
NcanP55066 Gm13019-201ENSMUST00000120000 276 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
NcanP55066 A430060F13Rik-201ENSMUST00000124176 378 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
NcanP55066 Nlrp5-ps-202ENSMUST00000173220 1294 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
NcanP55066 Ly6c1-202ENSMUST00000179762 838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
NcanP55066 Gm11942-201ENSMUST00000180255 345 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
NcanP55066 Gm8756-201ENSMUST00000183250 929 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
NcanP55066 Gm9916-201ENSMUST00000192943 1228 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
NcanP55066 Gm44270-201ENSMUST00000203084 1234 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
NcanP55066 Gm45570-201ENSMUST00000211137 495 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
NcanP55066 CT485606.1-201ENSMUST00000213187 878 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
NcanP55066 Gm4930-201ENSMUST00000219926 1087 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
NcanP55066 Mcts2-201ENSMUST00000062148 917 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
NcanP55066 Gm10775-201ENSMUST00000099425 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
NcanP55066 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
NcanP55066 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
NcanP55066 E130018N17Rik-201ENSMUST00000129713 1309 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
NcanP55066 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
NcanP55066 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
NcanP55066 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
NcanP55066 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
NcanP55066 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
NcanP55066 Gm10681-202ENSMUST00000178221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
NcanP55066 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
NcanP55066 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
NcanP55066 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
NcanP55066 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
NcanP55066 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NcanP55066 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NcanP55066 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NcanP55066 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
NcanP55066 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NcanP55066 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
NcanP55066 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NcanP55066 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NcanP55066 Mtm1-203ENSMUST00000061970 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NcanP55066 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
NcanP55066 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
NcanP55066 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
NcanP55066 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NcanP55066 Ighv8-9-201ENSMUST00000103533 301 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
NcanP55066 Ighv8-13-201ENSMUST00000103542 303 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
NcanP55066 n-R5s84-201ENSMUST00000122591 109 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
NcanP55066 AA672651-201ENSMUST00000151550 489 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
NcanP55066 Gm24398-201ENSMUST00000157870 109 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
NcanP55066 Gm19705-203ENSMUST00000181491 678 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
NcanP55066 Mir6407-201ENSMUST00000184510 101 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
NcanP55066 Ighv5-11-201ENSMUST00000193354 371 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
NcanP55066 Gm5870-201ENSMUST00000196461 282 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
NcanP55066 Gm7596-202ENSMUST00000202171 737 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NcanP55066 Gm7972-202ENSMUST00000208453 505 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
NcanP55066 Cmtm2a-203ENSMUST00000212492 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
NcanP55066 AC154257.1-202ENSMUST00000224729 843 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
NcanP55066 AC154361.2-201ENSMUST00000224747 943 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
NcanP55066 CT009536.2-201ENSMUST00000225370 665 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
NcanP55066 AC121960.1-201ENSMUST00000227982 564 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
NcanP55066 BC030499-201ENSMUST00000046361 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
NcanP55066 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
NcanP55066 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NcanP55066 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
NcanP55066 Ndel1-202ENSMUST00000101017 1646 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NcanP55066 C130050O18Rik-202ENSMUST00000163940 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NcanP55066 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NcanP55066 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NcanP55066 Sparc-207ENSMUST00000213866 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
NcanP55066 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NcanP55066 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NcanP55066 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NcanP55066 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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