Protein–RNA interactions for Protein: P51125

Cast, Calpastatin, mousemouse

Predictions only

Length 788 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CastP51125 Gm5846-201ENSMUST00000193146 1414 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CastP51125 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CastP51125 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CastP51125 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CastP51125 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CastP51125 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CastP51125 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CastP51125 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CastP51125 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CastP51125 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CastP51125 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CastP51125 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CastP51125 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CastP51125 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CastP51125 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CastP51125 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CastP51125 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CastP51125 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CastP51125 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CastP51125 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CastP51125 Rap1a-ps2-201ENSMUST00000118467 559 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CastP51125 Gm4909-201ENSMUST00000118749 794 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CastP51125 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CastP51125 Oxct1-205ENSMUST00000138927 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CastP51125 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CastP51125 Tepp-204ENSMUST00000161029 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CastP51125 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CastP51125 Tmem267-202ENSMUST00000176171 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CastP51125 Gm9445-201ENSMUST00000207454 1285 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CastP51125 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CastP51125 1110017D15Rik-201ENSMUST00000030152 1114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CastP51125 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CastP51125 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CastP51125 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CastP51125 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CastP51125 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CastP51125 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CastP51125 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CastP51125 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CastP51125 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CastP51125 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CastP51125 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CastP51125 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CastP51125 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CastP51125 1520401A03Rik-205ENSMUST00000201734 2660 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CastP51125 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CastP51125 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CastP51125 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CastP51125 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CastP51125 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CastP51125 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CastP51125 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CastP51125 Ighv8-9-201ENSMUST00000103533 301 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CastP51125 Ighv8-13-201ENSMUST00000103542 303 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CastP51125 Gm13124-201ENSMUST00000105748 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CastP51125 Wsb2-ps-201ENSMUST00000117937 1217 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CastP51125 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CastP51125 Gm14277-201ENSMUST00000121195 360 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CastP51125 Gm13563-201ENSMUST00000125518 643 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CastP51125 Gm11755-201ENSMUST00000144096 891 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CastP51125 Gm24845-201ENSMUST00000158034 109 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CastP51125 Gm8856-201ENSMUST00000185254 1144 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CastP51125 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CastP51125 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CastP51125 Gm44651-201ENSMUST00000207343 372 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CastP51125 AC164573.1-201ENSMUST00000218616 963 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CastP51125 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CastP51125 Olfr288-202ENSMUST00000165379 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CastP51125 Gm44260-201ENSMUST00000204946 2094 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CastP51125 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CastP51125 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CastP51125 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CastP51125 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CastP51125 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CastP51125 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CastP51125 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CastP51125 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CastP51125 Gm45342-201ENSMUST00000210903 1363 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CastP51125 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CastP51125 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CastP51125 Nme8-202ENSMUST00000091763 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CastP51125 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CastP51125 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CastP51125 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CastP51125 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CastP51125 Dmac2-201ENSMUST00000077338 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CastP51125 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CastP51125 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CastP51125 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CastP51125 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CastP51125 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CastP51125 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CastP51125 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CastP51125 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CastP51125 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CastP51125 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CastP51125 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CastP51125 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CastP51125 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CastP51125 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.2 ms