Protein–RNA interactions for Protein: P50704

Defa6, Alpha-defensin 6/12, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa6P50704 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Defa6P50704 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC9.41□□□□□ -0.9
Defa6P50704 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC9.41□□□□□ -0.9
Defa6P50704 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC9.41□□□□□ -0.9
Defa6P50704 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Defa6P50704 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC9.41□□□□□ -0.9
Defa6P50704 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC9.41□□□□□ -0.9
Defa6P50704 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.41□□□□□ -0.9
Defa6P50704 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Defa6P50704 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC9.41□□□□□ -0.9
Defa6P50704 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Defa6P50704 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Defa6P50704 Arvcf-203ENSMUST00000115612 4218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Defa6P50704 Polr3e-201ENSMUST00000033173 4194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Defa6P50704 Ehd2-201ENSMUST00000098799 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Defa6P50704 Zfp689-201ENSMUST00000053392 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Defa6P50704 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.41□□□□□ -0.9
Defa6P50704 Zfp426-202ENSMUST00000115562 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Defa6P50704 Klhdc7b-202ENSMUST00000225666 3951 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.41□□□□□ -0.9
Defa6P50704 Gm15411-201ENSMUST00000133243 3488 ntTSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Defa6P50704 Aplp2-209ENSMUST00000217641 3462 ntTSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Defa6P50704 Map3k12-208ENSMUST00000171565 4318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Defa6P50704 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC9.41□□□□□ -0.9
Defa6P50704 Gm20427-201ENSMUST00000168978 3703 ntTSL 2 BASIC9.41□□□□□ -0.9
Defa6P50704 AC154639.1-201ENSMUST00000224393 2849 ntBASIC9.41□□□□□ -0.9
Defa6P50704 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Defa6P50704 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC9.41□□□□□ -0.9
Defa6P50704 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Defa6P50704 Steap3-202ENSMUST00000112640 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Defa6P50704 Col20a1-201ENSMUST00000108856 4489 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.41□□□□□ -0.9
Defa6P50704 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Defa6P50704 F730043M19Rik-204ENSMUST00000148740 3312 ntTSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Defa6P50704 Slc37a1-202ENSMUST00000171233 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Defa6P50704 Mdh1b-201ENSMUST00000114094 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Defa6P50704 Gm13093-201ENSMUST00000126212 2485 ntTSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Defa6P50704 Nrros-202ENSMUST00000115163 3559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Defa6P50704 Sptb-202ENSMUST00000166101 8084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.4□□□□□ -0.9
Defa6P50704 Acacb-202ENSMUST00000102582 8788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.4□□□□□ -0.9
Defa6P50704 Tmcc2-203ENSMUST00000132435 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Defa6P50704 C530043K16Rik-201ENSMUST00000201865 3109 ntBASIC9.4□□□□□ -0.9
Defa6P50704 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC9.4□□□□□ -0.9
Defa6P50704 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC9.4□□□□□ -0.9
Defa6P50704 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC9.4□□□□□ -0.9
Defa6P50704 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC9.4□□□□□ -0.9
Defa6P50704 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Defa6P50704 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Defa6P50704 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Defa6P50704 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Defa6P50704 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC9.4□□□□□ -0.9
Defa6P50704 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.4□□□□□ -0.9
Defa6P50704 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC9.4□□□□□ -0.9
Defa6P50704 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC9.4□□□□□ -0.9
Defa6P50704 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Defa6P50704 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Defa6P50704 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Defa6P50704 Gm20649-201ENSMUST00000160950 2740 ntTSL 2 BASIC9.4□□□□□ -0.9
Defa6P50704 Slc25a24-201ENSMUST00000029477 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Defa6P50704 Plekhn1-203ENSMUST00000217885 1982 ntTSL 5 BASIC9.4□□□□□ -0.9
Defa6P50704 Ttc25-201ENSMUST00000006976 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Defa6P50704 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.4□□□□□ -0.9
Defa6P50704 Fam26e-201ENSMUST00000069125 5323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Defa6P50704 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.91
Defa6P50704 Asb7-202ENSMUST00000124899 4928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.91
Defa6P50704 Gm10686-201ENSMUST00000215389 3247 ntBASIC9.4□□□□□ -0.91
Defa6P50704 Sema4c-202ENSMUST00000191642 3892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.4□□□□□ -0.91
Defa6P50704 Gm36957-201ENSMUST00000192982 2824 ntBASIC9.4□□□□□ -0.91
Defa6P50704 BC048403-201ENSMUST00000065600 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.91
Defa6P50704 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC9.4□□□□□ -0.91
Defa6P50704 Ftsj1-201ENSMUST00000033513 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.91
Defa6P50704 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.91
Defa6P50704 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.91
Defa6P50704 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC9.4□□□□□ -0.91
Defa6P50704 Car10-206ENSMUST00000107863 3334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Defa6P50704 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Defa6P50704 Trak2-201ENSMUST00000027186 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Defa6P50704 Traf7-201ENSMUST00000070777 2384 ntTSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Defa6P50704 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Defa6P50704 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Defa6P50704 Egr2-201ENSMUST00000048289 2965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Defa6P50704 Tcp11l1-202ENSMUST00000111118 5474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Defa6P50704 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Defa6P50704 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Defa6P50704 Cox15-201ENSMUST00000045562 4798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Defa6P50704 Sik2-205ENSMUST00000176663 4107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Defa6P50704 Gm15587-201ENSMUST00000146326 3493 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Defa6P50704 Zfp251-201ENSMUST00000080406 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Defa6P50704 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Defa6P50704 Cd19-204ENSMUST00000206325 2452 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Defa6P50704 Pcdhb19-201ENSMUST00000059571 7138 ntAPPRIS P1 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Defa6P50704 Cacna1e-207ENSMUST00000211821 6765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Defa6P50704 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Defa6P50704 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Defa6P50704 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Defa6P50704 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Defa6P50704 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Defa6P50704 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
Defa6P50704 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Defa6P50704 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Defa6P50704 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Defa6P50704 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms