Protein–RNA interactions for Protein: P50580

Pa2g4, Proliferation-associated protein 2G4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pa2g4P50580 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pa2g4P50580 Gm45495-201ENSMUST00000200940 1700 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Pa2g4P50580 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pa2g4P50580 Oprm1-202ENSMUST00000052751 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pa2g4P50580 Oprm1-207ENSMUST00000092731 1332 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pa2g4P50580 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pa2g4P50580 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pa2g4P50580 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pa2g4P50580 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pa2g4P50580 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pa2g4P50580 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pa2g4P50580 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pa2g4P50580 Tmem254b-202ENSMUST00000100806 1108 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pa2g4P50580 Tmem254a-201ENSMUST00000100811 1108 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pa2g4P50580 Gm15236-201ENSMUST00000117309 379 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Pa2g4P50580 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pa2g4P50580 Gm6963-201ENSMUST00000147879 379 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Pa2g4P50580 Ftl1-ps2-201ENSMUST00000169477 549 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Pa2g4P50580 Gm44958-201ENSMUST00000203734 736 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Pa2g4P50580 Calml4-207ENSMUST00000215968 526 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pa2g4P50580 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pa2g4P50580 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pa2g4P50580 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pa2g4P50580 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pa2g4P50580 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pa2g4P50580 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pa2g4P50580 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pa2g4P50580 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pa2g4P50580 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pa2g4P50580 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Pa2g4P50580 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pa2g4P50580 Gm45765-202ENSMUST00000212921 1313 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pa2g4P50580 Crry-ps-201ENSMUST00000079090 1309 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Pa2g4P50580 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pa2g4P50580 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pa2g4P50580 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pa2g4P50580 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pa2g4P50580 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pa2g4P50580 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Pa2g4P50580 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pa2g4P50580 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pa2g4P50580 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pa2g4P50580 Vps25-204ENSMUST00000107280 876 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pa2g4P50580 Pyy-202ENSMUST00000127381 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pa2g4P50580 Gm15979-201ENSMUST00000149741 590 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pa2g4P50580 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pa2g4P50580 Gm4959-201ENSMUST00000197271 1044 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Pa2g4P50580 Gm44262-201ENSMUST00000204969 372 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Pa2g4P50580 Gm45186-201ENSMUST00000206874 478 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Pa2g4P50580 AC163667.3-201ENSMUST00000225774 222 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Pa2g4P50580 Tm2d3-201ENSMUST00000032726 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pa2g4P50580 Clec4b2-201ENSMUST00000088455 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pa2g4P50580 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pa2g4P50580 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pa2g4P50580 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pa2g4P50580 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pa2g4P50580 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pa2g4P50580 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pa2g4P50580 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pa2g4P50580 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pa2g4P50580 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pa2g4P50580 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pa2g4P50580 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pa2g4P50580 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pa2g4P50580 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pa2g4P50580 8430408G22Rik-201ENSMUST00000067354 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pa2g4P50580 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pa2g4P50580 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pa2g4P50580 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pa2g4P50580 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pa2g4P50580 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pa2g4P50580 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Pa2g4P50580 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pa2g4P50580 Gm24934-201ENSMUST00000103764 111 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Pa2g4P50580 Gm12015-201ENSMUST00000117065 843 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Pa2g4P50580 2010001A14Rik-203ENSMUST00000152790 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pa2g4P50580 Gm27239-201ENSMUST00000184638 642 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pa2g4P50580 Gm8856-201ENSMUST00000185254 1144 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Pa2g4P50580 Gm19994-201ENSMUST00000217086 586 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Pa2g4P50580 Gm9176-201ENSMUST00000219955 1120 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Pa2g4P50580 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pa2g4P50580 Dnajc17-201ENSMUST00000038439 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pa2g4P50580 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pa2g4P50580 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pa2g4P50580 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pa2g4P50580 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pa2g4P50580 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pa2g4P50580 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pa2g4P50580 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pa2g4P50580 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pa2g4P50580 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pa2g4P50580 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pa2g4P50580 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pa2g4P50580 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pa2g4P50580 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pa2g4P50580 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pa2g4P50580 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pa2g4P50580 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pa2g4P50580 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Pa2g4P50580 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms