Protein–RNA interactions for Protein: P50404

Sftpd, Pulmonary surfactant-associated protein D, mousemouse

Predictions only

Length 374 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SftpdP50404 Gm13563-201ENSMUST00000125518 643 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SftpdP50404 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SftpdP50404 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SftpdP50404 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SftpdP50404 Gm2310-201ENSMUST00000179217 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SftpdP50404 Gm5597-201ENSMUST00000182353 1193 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
SftpdP50404 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SftpdP50404 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
SftpdP50404 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
SftpdP50404 Gm19963-201ENSMUST00000208413 1255 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
SftpdP50404 Gm18935-201ENSMUST00000212692 664 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
SftpdP50404 Morn2-202ENSMUST00000227729 656 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
SftpdP50404 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SftpdP50404 D030025P21Rik-202ENSMUST00000220643 3987 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
SftpdP50404 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SftpdP50404 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SftpdP50404 Mrvi1-201ENSMUST00000005751 6198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SftpdP50404 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
SftpdP50404 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
SftpdP50404 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SftpdP50404 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SftpdP50404 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SftpdP50404 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
SftpdP50404 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SftpdP50404 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SftpdP50404 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SftpdP50404 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SftpdP50404 Armcx2-201ENSMUST00000035559 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SftpdP50404 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SftpdP50404 Pfkfb3-220ENSMUST00000192949 4801 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SftpdP50404 Gm45342-201ENSMUST00000210903 1363 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
SftpdP50404 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SftpdP50404 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SftpdP50404 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SftpdP50404 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SftpdP50404 Gm15370-201ENSMUST00000117158 253 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
SftpdP50404 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SftpdP50404 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
SftpdP50404 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
SftpdP50404 Gm45022-201ENSMUST00000208332 545 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SftpdP50404 CT033793.1-201ENSMUST00000216883 565 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SftpdP50404 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SftpdP50404 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SftpdP50404 Acyp1-202ENSMUST00000065913 448 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SftpdP50404 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SftpdP50404 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
SftpdP50404 Olfr366-201ENSMUST00000091001 930 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SftpdP50404 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SftpdP50404 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SftpdP50404 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SftpdP50404 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SftpdP50404 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SftpdP50404 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SftpdP50404 Myo10-201ENSMUST00000022882 5880 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SftpdP50404 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SftpdP50404 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SftpdP50404 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SftpdP50404 Igbp1b-201ENSMUST00000054786 1456 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SftpdP50404 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SftpdP50404 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SftpdP50404 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SftpdP50404 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SftpdP50404 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SftpdP50404 1520401A03Rik-205ENSMUST00000201734 2660 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SftpdP50404 D630033O11Rik-204ENSMUST00000210588 1358 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SftpdP50404 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SftpdP50404 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SftpdP50404 Plce1-204ENSMUST00000182481 8357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SftpdP50404 Gstt1-202ENSMUST00000120177 1105 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SftpdP50404 Gm13297-201ENSMUST00000120205 934 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
SftpdP50404 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
SftpdP50404 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SftpdP50404 Gm23119-201ENSMUST00000158610 140 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
SftpdP50404 Gm17028-201ENSMUST00000170026 704 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SftpdP50404 2310047D07Rik-201ENSMUST00000189493 735 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SftpdP50404 Gm8176-201ENSMUST00000191297 1099 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
SftpdP50404 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SftpdP50404 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SftpdP50404 AC132384.14-201ENSMUST00000219346 1147 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
SftpdP50404 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
SftpdP50404 Cym-201ENSMUST00000029504 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SftpdP50404 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SftpdP50404 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SftpdP50404 Gm6502-202ENSMUST00000097478 1218 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SftpdP50404 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SftpdP50404 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SftpdP50404 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SftpdP50404 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SftpdP50404 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SftpdP50404 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SftpdP50404 Adam19-201ENSMUST00000011400 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SftpdP50404 Kcnip4-207ENSMUST00000176191 2116 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SftpdP50404 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SftpdP50404 Oxct1-205ENSMUST00000138927 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SftpdP50404 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SftpdP50404 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SftpdP50404 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SftpdP50404 Gm43417-201ENSMUST00000201586 5207 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
SftpdP50404 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SftpdP50404 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.9 ms